Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469733
• Subject: XM_006514972.3
• Aligned Length: 1431
• Identities: 964
• Gaps: 393

Alignment

Query    1  ATGGATGGATTTTATGACCAGCAAGTGCCTTACATGGTCACCAATAGTCAGCGTGGGAGAAATTGTAACGAGAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACCAACAAATGTCAGGAAAAGAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTTCAAGATC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TAAGTCAATTACAGGAAACATGGCTTGCAGAAGCTCAGGTACCTGACAATGATGAGCAGTTTGTACCAGACTAT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CAGGCTGAAAGTTTGGCTTTTCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGTCCATGTTCAGAAAT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CAGCTCTGCCTGCAGTCAAGAACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTCAGTGCCT  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  ATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAACCCCCCCACACCATCCAGCACGCCAGTGTCCCCACTG  444
                                   ||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct    1  -----------------------ATGAGGCCCTCCAATCCCCCGACACCATCCAGCACTCCAGTGTCCCCACTA  51

Query  445  CATCATGCATCTCCAAACTCAACTCATACACCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTCCATCGCA  518
            ||.|||||||||||||||.||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct   52  CACCATGCATCTCCAAACACAGCTCATACTCCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTCCTTCTCA  125

Query  519  GTCCATACCAGATAGCAGCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAACTCCTTTC  592
            ||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  126  GTCCATACCAGACAGCACCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAATTCTTTTC  199

Query  593  CTCCTTTGCCGACGATGCCAAGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACATCCCCTTC  666
            |||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  200  CTCCTTTGCCGACAATGCCAAGGGAAGGGCGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACATCCCCTTC  273

Query  667  CCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACACAACACCATGGTTGGCAGTGCGGCCAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|.|||||||||||||.||||.|||||
Sbjct  274  CCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTCTATGAACATACCACCATGGTTGGCGGTGCAGCCAG  347

Query  741  CCAAAGCTTTCCCCCTCCTCTGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTGCCTAGCT  814
            |||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  348  CCAAAGCTTCCCCCCTCCTTTGATGATCAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTGCCTAGCT  421

Query  815  GCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGCAGAACAGAAGGCTGTATGTTTGAAAAG  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  422  GCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCAAGCAGAACAGAAGGCTGCATGTTTGAGAAG  495

Query  889  GGCCCCAGGCAGTTTTATGATGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATTCGATGGAGACATCAAACAAGAGCCAGG  962
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct  496  GGTCCCAGGCAGTTCTATGATGACACCTGTGTGGTCCCGGAGAAGTTCGATGGGGACATTAAGCAAGAGCCTGG  569

Query  963  AATGTATCGGGAAGGACCCACATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTGG  1036
            ||||||.||||||||||||||.|||||..||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  570  AATGTACCGGGAAGGACCCACGTACCAGAGGCGAGGATCCCTCCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCTCTTCTGG  643

Query 1037  ATGACCCTTCAAATTCTCATTTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCCTGAAGAG  1110
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  644  ATGACCCTTCAAATTCTCATTTCATTGCCTGGACTGGACGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCCCGAAGAG  717

Query 1111  GTGGCCCGACGTTGGGGCATTCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTATGATAAACTTAGCCGTTCACTCCGCTA  1184
            ||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  718  GTGGCCCGGCGTTGGGGCATTCAGAAGAACAGGCCGGCGATGAACTATGACAAACTTAGTCGTTCTCTCCGCTA  791

Query 1185  TTACTATGAGAAAGGAATTATGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATGTCTACAAGTTTGTGTGTGATCCAGAAG  1258
            |||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  792  TTATTATGAGAAGGGAATCATGCAAAAGGTGGCTGGAGAAAGATACGTGTACAAATTTGTGTGTGACCCGGAAG  865

Query 1259  CCCTTTTCTCCATGGCCTTTCCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAGACAGACATGGAACGTCACATCAACGAG  1332
            ||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  866  CCCTTTTCTCTATGGCCTTTCCGGATAACCAGCGCCCACTGCTGAAGACGGACATGGAACGTCACATCAACGAA  939

Query 1333  GAGGACACAGTGCCTCTTTCTCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACATGCCGGAAGGGGGCTGCTGCAACCCCCA  1406
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  940  GAGGACACAGTGCCTCTGTCTCACTTTGATGAGAGCATGACCTACATGCCCGAAGGGGGCTGCTGCAACCCTCA  1013

Query 1407  CCCCTACAACGAAGGCTACGTGTAT  1431
            |||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1014  CCCCTACAACGAAGGATACGTGTAC  1038