Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469767
• Subject: XM_024450101.1
• Aligned Length: 2085
• Identities: 1845
• Gaps: 225

Alignment

Query    1  ATGGAGAACGACCCCTCGAGACGAAGAGAGTCCATCTCTCTCACACCTGTGGCCAAGGGTCTGGAGAACATGGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGAACGACCCCTCGAGACGAAGAGAGTCCATCTCTCTCACACCTGTGGCCAAGGGTCTGGAGAACATGGG  74

Query   75  GGCTGATTTCTTGGAAAGCCTGGAGGAAGGCCAGCTCCCTAGGAGTGACTTGAGCCCCGCAGAGATCAGGAGCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCTGATTTCTTGGAAAGCCTGGAGGAAGGCCAGCTCCCTAGGAGTGACTTGAGCCCCGCAGAGATCAGGAGCA  148

Query  149  GCTGGAGCGAGGCGGCGCCGAAGCCCTTCTCCAGATGGAGGAACCTGCAGCCAGCCCTGAGAGCCAGAAGCTTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCTGGAGCGAGGCGGCGCCGAAGCCCTTCTCCAGATGGAGGAACCTGCAGCCAGCCCTGAGAGCCAGAAGCTTC  222

Query  223  TGCAGGGAGCACATGCAGCTGTTTCGATGGATCGGCACAGGCCTGCTCTGCACTGGGCTCTCTGCCTTCCTGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGCAGGGAGCACATGCAGCTGTTTCGATGGATCGGCACAGGCCTGCTCTGCACTGGGCTCTCTGCCTTCCTGCT  296

Query  297  GGTGGCCTGCCTCCTGGATTTCCAGAGGGCCCTGGCTCTGTTTGTCCTCACCTGTGTGGTCCTCACCTTCCTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTGGCCTGCCTCCTGGATTTCCAGAGGGCCCTGGCTCTGTTTGTCCTCACCTGTGTGGTCCTCACCTTCCTGG  370

Query  371  GCCACCGCCTGCTGAAACGGCTTCTGGGGCCAAAGCTGAGGAGGTTTCTCAAGCCTCAGGGCCATCCCCGCCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCACCGCCTGCTGAAACGGCTTCTGGGGCCAAAGCTGAGGAGGTTTCTCAAGCCTCAGGGCCATCCCCGCCTG  444

Query  445  CTGCTCTGGTTTAAGAGGGGTCTAGCTCTTGCTGCTTTCCTGGGCCTGGTCCTGTGGCTGTCTCTGGACACCTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGCTCTGGTTTAAGAGGGGTCTAGCTCTTGCTGCTTTCCTGGGCCTGGTCCTGTGGCTGTCTCTGGACACCTC  518

Query  519  CCAGCGGCCTGAGCAACTGGTGTCCTTCGCAGGAATCTGCGTGTTCGTCGCTCTCCTCTTTGCCTGCTCAAAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCAGCGGCCTGAGCAACTGGTGTCCTTCGCAGGAATCTGCGTGTTCGTCGCTCTCCTCTTTGCCTGCTCAAAGC  592

Query  593  ATCATTGCGCAGTGTCCTGGAGGGCCGTGTCTTGGGGACTTGGACTGCAGTTTGTACTTGGACTCCTCGTCATC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATCATTGCGCAGTGTCCTGGAGGGCCGTGTCTTGGGGACTTGGACTGCAGTTTGTACTTGGACTCCTCGTCATC  666

Query  667  AGAACAGAACCAGGATTCATTGCGTTCGAGTGGCTGGGCGAGCAGATCCGGATCTTCCTGAGCTACACGAAGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                        
Sbjct  667  AGAACAGAACCAGGATTCATTGCGTTCGAGTGGCTGGGCGAGCAGATCCG------------------------  716

Query  741  TGGCTCCAGCTTCGTGTTTGGGGAGGCGCTGGTCAAGGATGTCTTTGCCTTTCAGGTTCTGCCCATCATTGTCT  814
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct  717  ------------------------------------------------------GGTTCTGCCCATCATTGTCT  736

Query  815  TTTTCAGCTGTGTCATATCCGTTCTCTACCACGTGGGCCTCATGCAGTGGGTGATCCTGAAGATTGCCTGGCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  737  TTTTCAGCTGTGTCATATCCGTTCTCTACCACGTGGGCCTCATGCAGTGGGTGATCCTGAAGATTGCCTGGCTG  810

Query  889  ATGCAAGTCACCATGGGCACCACAGCCACTGAGACCCTGAGTGTGGCTGGAAACATCTTTGTGAGCCAGACCGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  811  ATGCAAGTCACCATGGGCACCACAGCCACTGAGACCCTGAGTGTGGCTGGAAACATCTTTGTGAGCCAGACCGA  884

Query  963  GGCTCCATTACTGATCCGGCCCTACTTGGCAGACATGACACTCTCTGAAGTCCACGTTGTCATGACCGGAGGTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  885  GGCTCCATTACTGATCCGGCCCTACTTGGCAGACATGACACTCTCTGAAGTCCACGTTGTCATGACCGGAGGTT  958

Query 1037  ACGCCACCATTGCTGGCAGCCTGCTGGGTGCCTACATCTCCTTTGGGATCGATGCCACCTCGTTGATTGCAGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959  ACGCCACCATTGCTGGCAGCCTGCTGGGTGCCTACATCTCCTTTGGGATCGATGCCACCTCGTTGATTGCAGCC  1032

Query 1111  TCTGTGATGGCTGCCCCTTGTGCCTTGGCCCTCTCCAAACTGGTCTACCCGGAGGTGGAGGAGTCCAAGTTTAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033  TCTGTGATGGCTGCCCCTTGTGCCTTGGCCCTCTCCAAGCTGGTCTACCCGGAGGTGGAGGAGTCCAAGTTTAG  1106

Query 1185  GAGGGAGGAAGGAGTGAAACTGACCTATGGAGATGCTCAGAACCTCATAGAAGCAGCCAGCACTGGGGCCGCCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107  GAGGGAGGAAGGAGTGAAACTGACCTATGGAGATGCTCAGAACCTCATAGAAGCAGCCAGCACTGGGGCCGCCA  1180

Query 1259  TCTCCGTGAAGGTGGTCGCCAACATCGCTGCCAACCTGATTGCGTTCCTGGCTGTGCTGGACTTTATCAATGCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181  TCTCCGTGAAGGTGGTCGCCAACATCGCTGCCAACCTGATTGCGTTCCTGGCTGTGCTGGACTTTATCAATGCT  1254

Query 1333  GCCCTCTCCTGGCTGGGAGACATGGTGGACATCCAGGGGCTCAGCTTCCAGCTCATCTGCTCCTACATCCTGCG  1406
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255  GCCCTCTCCTGGCTGGGAGACATGGTGGACATCCAAGGGCTCAGCTTCCAGCTCATCTGCTCCTACATCCTGCG  1328

Query 1407  GCCTGTAGCCTTCTTGATGGGTGTGGCGTGGGAGGACTGCCCAGTGGTAGCTGAGCTGCTGGGGATCAAGCTGT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329  GCCTGTAGCCTTCTTGATGGGTGTGGCGTGGGAGGACTGCCCAGTGGTAGCTGAGCTGCTGGGGATCAAGCTGT  1402

Query 1481  TTCTGAACGAGTTTGTGGCCTATCAAGACCTCTCCAAGTACAAGCAATGCCGCCTGGCAGGGGCCGAGGAGTGG  1554
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403  TTCTGAACGAGTTTGTGGCCTATCAAGACCTCTCCAAGTACAAGCAACGCCGCCTGGCAGGGGCCGAGGAGTGG  1476

Query 1555  GTCGGCGACAGGAAGCAGTGGATCTCCGTCAGAGCTGAAGTCCTCACGACGTTTGCCCTCTGTGGATTTGCCAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477  GTCGGCGACAGGAAGCAGTGGATCTCCGTCAGAGCTGAAGTCCTCACGACGTTTGCCCTCTGTGGATTTGCCAA  1550

Query 1629  TTTCAGCTCCATTGGGATCATGCTGGGAGGCTTGACCTCCATGGTCCCCCAACGGAAGAGCGACTTCTCCCAGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551  TTTCAGCTCCATTGGGATCATGCTGGGAGGCTTGACCTCCATGGTCCCCCAACGGAAGAGCGACTTCTCCCAGA  1624

Query 1703  TAGTGCTCCGGGCGCTCTTCACGGGAGCCTGTGTGTCCCTGGTGAACGCCTGTATGGCAGGGATCCTCTACATG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625  TAGTGCTCCGGGCGCTCTTCACGGGAGCCTGTGTGTCCCTGGTGAACGCCTGTATGGCAGGGATCCTCTACATG  1698

Query 1777  CCCAGGGGGGCTGAAGTTGACTGCATGTCCCTCTTGAACACGACCCTCAGCAGCAGTAGCTTTGAGATTTACCA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699  CCCAGGGGGGCTGAAGTTGACTGCATGTCCCTCTTGAACACGACCCTCAGCAGCAGTAGCTTTGAGATTTACCA  1772

Query 1851  GTGCTGCCGTGAGGCCTTCCAGAGCGTCAATCCA-GAGTTCAGCCCA----------GAGGCCCTGGACAAC--  1911
            |||||||||||||||||||||||  |.||.|.|| ||||..||..||          ||.|||    |.|||  
Sbjct 1773  GTGCTGCCGTGAGGCCTTCCAGA--GACAGTGCATGAGTCAAGAGCAAGTCGAAGATGAAGCC----AGAACAC  1840

Query 1912  ----TGCTGTCGG-----TTT------TACAA----------------CCACACGAT-----CTG---------  1940
                ||  ||.||     |||      |||||                ||||| |||     |||         
Sbjct 1841  AGCATG--GTGGGACTCATTTCTCATCTACAAGTAAGAAGGCAGTAACCCACA-GATCAAGACTGCCAACCAGA  1911

Query 1941  TGCACAG-------------------------------------------------------------------  1947
            ||.|||.                                                                   
Sbjct 1912  TGGACACACGAAATGCTGCTACACACTCTCCTACACGTCAGTAAATTCCTTGCATCCAATGACTCCATGTGCTT  1985

Query 1948  -------------  1947
                         
Sbjct 1986  CAGTGACGGACCA  1998