Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469826
• Subject: XM_011524022.2
• Aligned Length: 1693
• Identities: 1355
• Gaps: 329

Alignment

Query    1  ATGAACCAGCCGTGCAACTCGATGGAGCCGAGGGTGATGGACGATGACATGCTCAAGCTGGCCGTCGGGGACCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAACCAGCCGTGCAACTCGATGGAGCCGAGGGTGATGGACGATGACATGCTCAAGCTGGCCGTCGGGGACCA  74

Query   75  GGGCCCCCAGGAGGAGGCCGGGCAGCTGGCCAAGCAGGAGGGCATCCTCTTCAAGGATGTCCTGTCCCTGCAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGGCCCCCAGGAGGAGGCCGGGCAGCTGGCCAAGCAGGAGGGCATCCTCTTCAAGGATGTCCTGTCCCTGCAGC  148

Query  149  TGGACTTTCGGA------------------------------------------------------------AC  162
            ||||||||||||                                                            ||
Sbjct  149  TGGACTTTCGGAGAAAAACAGCAGATGAACCCAAAGGGGAACAGGATGATGGCCAGGAGGATTCCCAGGAAGAC  222

Query  163  ATCCTCCGCATAGACAACCTCTGGCAGTTTGAGAACTTGAGGAAGCTGCAGCTGGACAATAACATCATTGAGAA  236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATCCTCCGCATAGACAACCTCTGGCAGTTTGAGAACTTGAGGAAGCTGCAGCTGGACAATAACATCATTGAGAA  296

Query  237  GATCGAGGGCCTGGAGAACCTCGCACACCTGGTCTGGCTGGATCTGTCTTTCAACAACATTGAGACCATCGAGG  310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATCGAGGGCCTGGAGAACCTCGCACACCTGGTCTGGCTGGATCTGTCTTTCAACAACATTGAGACCATCGAGG  370

Query  311  GGCTGGACACACTGGTGAACCTGGAGGACCTGAGCTTGTTCAACAACCGGATCTCCAAGATCGACTCCCTGGAC  384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGCTGGACACACTGGTGAACCTGGAGGACCTGAGCTTGTTCAACAACCGGATCTCCAAGATCGACTCCCTGGAC  444

Query  385  GCCCTCGTCAAGCTGCAGGTGTTGTCGCTGGGCAACAACCGGATTGACAACATGATGAACATCATCTACCTCCG  458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCCTCGTCAAGCTGCAGGTGTTGTCGCTGGGCAACAACCGGATTGACAACATGATGAACATCATCTACCTCCG  518

Query  459  GCGGTTCAAGTGCCTGCGGACGCTCAGCCTCTCTAGGAACCCTATCTCTGAGGCAGAGGATTACAAGATGTTCA  532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCGGTTCAAGTGCCTGCGGACGCTCAGCCTCTCTAGGAACCCTATCTCTGAGGCAGAGGATTACAAGATGTTCA  592

Query  533  TCTGTGCCTACCTTCCTGACCTCATGTACCTGGACTACCGGCGCATTGATGACCACACA---------------  591
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
Sbjct  593  TCTGTGCCTACCTTCCTGACCTCATGTACCTGGACTACCGGCGCATTGATGACCACACAGCAAGTGTCTCCCTC  666

Query  592  ------------------------------------------AAAAAGCTTGCGGAGGCTAAGCACCAGTACAG  623
                                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCAGTCTCCCAGCCCTGTGAGACAGATTCCTCAAGCCCCCAGAAAAAGCTTGCGGAGGCTAAGCACCAGTACAG  740

Query  624  CATCGACGAGCTGAAGCACCAGGAGAACCTGATGCAGGCCCAGCTGGAGGACGAGCAGGCGCAGCGGGAGGAGC  697
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATCGACGAGCTGAAGCACCAGGAGAACCTGATGCAGGCCCAGCTGGAGGACGAGCAGGCGCAGCGGGAGGAGC  814

Query  698  TAGAGAAGCACAAGACTGCGTTTGTGGAACACCTGAATGGCTCCTTCCTGTTTGACAGCATGTACGCTGAGGAC  771
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TAGAGAAGCACAAGACTGCGTTTGTGGAACACCTGAATGGCTCCTTCCTGTTTGACAGCATGTACGCTGAGGAC  888

Query  772  TCAGAGGGCAACAATCTGTCCTACCTGCCTGGTGTCGGTGAGCTCCTTGAGACCTACAAGGACAAGTTTGTCAT  845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCAGAGGGCAACAATCTGTCCTACCTGCCTGGTGTCGGTGAGCTCCTTGAGACCTACAAGGACAAGTTTGTCAT  962

Query  846  CATCTGCGTGAATATTTTTGAGTATGGCCTGAAACAGCAGGAGAAGCGGAAAACAGAGCTTGACACCTTCAGTG  919
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CATCTGCGTGAATATTTTTGAGTATGGCCTGAAACAGCAGGAGAAGCGGAAAACAGAGCTTGACACCTTCAGTG  1036

Query  920  AATGTGTCCGTGAGGCCATCCAGGAAAACCAGGAGCAGGGCAAACGCAAGATTGCCAAATTCGAGGAGAAGCAC  993
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AATGTGTCCGTGAGGCCATCCAGGAAAACCAGGAGCAGGGCAAACGCAAGATTGCCAAATTCGAGGAGAAGCAC  1110

Query  994  TTGTCGAGTTTAAGTGCCATTCGAGAGGAGTTGGAACTGCCCAACATTGAGAAGATGATCCTAGAATGCAGTGC  1067
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTGTCGAGTTTAAGTGCCATTCGAGAGGAGTTGGAACTGCCCAACATTGAGAAGATGATCCTAGAATGCAGTGC  1184

Query 1068  TGACATCAGTGAGTTGTTCGATGCGCTCATGACGCTGGAGATGCAGCTGGTGGAGCAGCTGGAGGAGACTATAA  1141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGACATCAGTGAGTTGTTCGATGCGCTCATGACGCTGGAGATGCAGCTGGTGGAGCAGCTGGAGGAGACTATAA  1258

Query 1142  ACATGTTTGAAAGGAACATTGTTGACATGGTAGGACTGTTTATCGAAAATGTCCAAAGCCTGATGGCTCAGTGC  1215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACATGTTTGAAAGGAACATTGTTGACATGGTAGGACTGTTTATCGAAAATGTCCAAAGCCTGATGGCTCAGTGC  1332

Query 1216  CGGGACCTGGAGAATCACCACCACGAGAAGCTCCTGGAGATCTCTATCAGCACCCTGGAGAAGATTGTCGAGGG  1289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CGGGACCTGGAGAATCACCACCACGAGAAGCTCCTGGAGATCTCTATCAGCACCCTGGAGAAGATTGTCGAGGG  1406

Query 1290  CGACCTGGACGAGGACCTGCCTAACGACCTGCGCGCGCTTTTTGTCGAT----AAAGATACGATTGTT-AATGC  1358
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     .||||.|    |||         ||| |||..
Sbjct 1407  CGACCTGGACGAGGACCTGCCTAACGACCTGCGCGCG-----GGTCGTTTCCAAAA---------GTTCAATTA  1466

Query 1359  TGTCGGGGCATC--GCACGACATCCACCTCCTGAAGATTGACAATCGAGAAGATGAGCTGGTGACCAGAATCAA  1430
            |||.|.|||.||  ||||  ..||                                                  
Sbjct 1467  TGTGGAGGCTTCTGGCAC--TTTC--------------------------------------------------  1488

Query 1431  CTCTTGGTGTACACGTTTAATAGACAGGATTCACAAGGATGAGATCATGAGGAACCGCAAGCGCGTGAAGGAGA  1504
                                                                                      
Sbjct 1489  --------------------------------------------------------------------------  1488

Query 1505  TCAATCAGTACATCGACCACATGCAGAGCGAACTGGACAACCTGGAATGTGGCGACATCCTAGAC  1569
                                                                             
Sbjct 1489  -----------------------------------------------------------------  1488