Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469828
• Subject: XR_926220.3
• Aligned Length: 1718
• Identities: 1263
• Gaps: 419

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  AAACACACAAGACGCCGGAGCTTCACAAGGGAGCGAACGAGGGTGTTTATAAGAATGGAAGTGTTGTTTCCTTG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCCGATTCCTTCATGCTATATCTCATGAACCTCTGTAATCTTGGGGGAGAGACTATATTTAATGATGACAAACC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TGTCACCAGTGTAGCAACAACAGTGTGAGGACAAAAGCAAATAAAAATTAAGAAGCGTTCAAATTTATATTCAA  222

Query    1  ------------------------------------------------ATGAACCGATACACAACCATGAGACA  26
                                                            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAAGGAAGTCATTTCAATCAACAACTTCTGCTGCATTATTTTTCCAAGATGAACCGATACACAACCATGAGACA  296

Query   27  GTTGGGGGACGGCACGTATGGGAGTGTGCTTATGGGCAAGAGTAATGAATCCGGGGAGCTGGTGGCCATCAAAA  100
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTTGGGGGACGGCACGTATGGGAGTGTGCTTATGGGCAAGAGTAATGAATCCGGGGAGCTGGTGGCCATCAAAA  370

Query  101  GGATGAAGAGAAAGTTCTATTCTTGGGATGAATGCATGAACTTGAGAGAAGTTAAGTCTCTGAAGAAACTTAAT  174
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGATGAAGAGAAAGTTCTATTCTTGGGATGAATGCATGAACTTGAGAGAAGTTAAGTCTCTGAAGAAACTTAAT  444

Query  175  CATGCCAATGTTATTAAATTGAAAGAAGTTATCAGAGAAAATGACCATCTTTATTTTATATTTGAATATATGAA  248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CATGCCAATGTTATTAAATTGAAAGAAGTTATCAGAGAAAATGACCATCTTTATTTTATATTTGAATATATGAA  518

Query  249  AGAAAACCTCTATCAATTAATGAAAGACAGAAACAAGTTGTTCCCTGAATCAGTCATCAGAAATATTATGTATC  322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAAAACCTCTATCAATTAATGAAAGACAGAAACAAGTTGTTCCCTGAATCAGTCATCAGAAATATTATGTATC  592

Query  323  AAATATTGCAAGGGCTGGCTTTTATCCATAAACATGGCTTTTTTCATAGGGACATGAAACCAGAAAACTTGCTT  396
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAATATTGCAAGGGCTGGCTTTTATCCATAAACATGGCTTTTTTCATAGGGACATGAAACCAGAAAACTTGCTT  666

Query  397  TGTATGGGTCCAGAGCTTGTGAAAATTGCTGATTTTGGACTTGCAAGAGAATTAAGGTCACAGCCACCATACAC  470
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGTATGGGTCCAGAGCTTGTGAAAATTGCTGATTTTGGACTTGCAAGAGAATTAAGGTCACAGCCACCATACAC  740

Query  471  TGATTATGTATCTACCAGATGGTATCGTGCCCCTGAAGTTTTACTGAGATCTTCAGTTTATAGTTCTCCCATTG  544
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGATTATGTATCTACCAGATGGTATCGTGCCCCTGAAGTTTTACTGAGATCTTCAGTTTATAGTTCTCCCATTG  814

Query  545  ATGTGTGGGCTGTTGGAAGTATCATGGCTGAACTCTATATGTTAAGGCCACTTTTCCCAGGGACAAGTGAGGTC  618
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGTGTGGGCTGTTGGAAGTATCATGGCTGAACTCTATATGTTAAGGCCACTTTTCCCAGGGACAAGTGAGGTC  888

Query  619  GATGAAATCTTTAAAATTTGCCAAGTTTTAGGGACTCCCAAAAAAAGTGACTGGCCAGAAGGATACCAGCTGGC  692
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GATGAAATCTTTAAAATTTGCCAAGTTTTAGGGACTCCCAAAAAAAGTGACTGGCCAGAAGGATACCAGCTGGC  962

Query  693  ATCCTCTATGAACTTCCGTTTTCCCCAGTGTGTTCCTATAAACTTAAAAACTCTTATTCCCAATGCCAGTAATG  766
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATCCTCTATGAACTTCCGTTTTCCCCAGTGTGTTCCTATAAACTTAAAAACTCTTATTCCCAATGCCAGTAATG  1036

Query  767  AAGCTATTCAGCTCATGACCGAAATGTTGAATTGGGATCCAAAGAAACGACCGACAGCAAGCCAGGCATTGAAA  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAGCTATTCAGCTCATGACCGAAATGTTGAATTGGGATCCAAAGAAACGACCGACAGCAAGCCAGGCATTGAAA  1110

Query  841  CACCCATATTTTCAAGTTGGTCAGGTATTAGGCCCTTCGTCAAATCATCTGGAATCAAAACAGTCTTTAAATAA  914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CACCCATATTTTCAAGTTGGTCAGGTATTAGGCCCTTCGTCAAATCATCTGGAATCAAAACAGTCTTTAAATAA  1184

Query  915  GCAGCTGCAACCATTAGAATCAAAGCCATCTTTAGTTGAGGTAGAGCCTAAGCCTCTGCCGGATATAATCGATC  988
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCAGCTGCAACCATTAGAATCAAAGCCATCTTTAGTTGAGGTAGAGCCTAAGCCTCTGCCGGATATAATCGATC  1258

Query  989  AGGTTGTTGGACAACCCCAGCCAAAAACTAGCCAGCAGCCACTGCAGCCCATTCAGCCGCCACAGAACCTGAGC  1062
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGTTGTTGGACAACCCCAGCCAAAAACTAGCCAGCAGCCACTGCAGCCCATTCAGCCGCCACAGAACCTGAGC  1332

Query 1063  GTCCAGCAACCTCCAAAGCAACAGAGTCAGGAGAAACCGCCACAAACGCTATTCCCGAGCATCGTCAAAAACAT  1136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTCCAGCAACCTCCAAAGCAACAGAGTCAGGAGAAACCGCCACAAACGCTATTCCCGAGCATCGTCAAAAACAT  1406

Query 1137  GCCAACT-------AAGCCAAATGGCACACTGAGTCATAAA---------AGTGG----TAGGAG-------GC  1183
            |||||||       .|||||    |.||.||.||.|...||         ||.||    .|.|||       ||
Sbjct 1407  GCCAACTGCTTCCAGAGCCA----GTACCCTCAGGCTCCAACCACTCGACAGGGGAAAACAAGAGCTTACCTGC  1476

Query 1184  -GTTGGGGTCAGACTATCTTCAAGTCTG-----GAGAT----AGCTG----------------GGAAGAGTTGG  1231
             |||        |||..|.|.||.||||     || ||    |.|||                |.|..|.|||.
Sbjct 1477  TGTT--------ACTTCCCTAAAATCTGATTCCGA-ATTGTCAACTGCTCCAACCTCTAAACAGTACTACTTGA  1541

Query 1232  AGGACTAT---GATTTCGGAGCCTCCC--------ATTCCAAGAAGCCAAGCATGGGTGTTTTTAA-----AGA  1289
            |  ||.||   |||.|      ||.||        ||.|||||||          |||||..||.|     ||.
Sbjct 1542  A--ACAATCAAGATAT------CTTCCAGGTGTGAATCCCAAGAA----------GGTGTCCTTGATAGCCAGT  1597

Query 1290  AAAAAGGAAA-AAAGATTCTCCATTTCGTCAACAGGTGAAGATGGCTGTTATTTCCCTCTC----AGCACACCA  1358
            ..|||||||| |||      ||                                |||.|.|    |||| ||||
Sbjct 1598  GGAAAGGAAATAAA------CC--------------------------------CCCACACTTGGAGCA-ACCA  1632

Query 1359  G---TTTCCCACGTTA  1371
            |   ||.||||.||  
Sbjct 1633  GTTATTCCCCAAGT--  1646