Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469869
- Subject:
- NM_001204260.2
- Aligned Length:
- 2331
- Identities:
- 2064
- Gaps:
- 267
Alignment
Query 1 ATGGACTCCAAAGAATCATTAACTCCTGGTAGAGAAGAAAACCCCAGCAGTGTGCTTGCTCAGGAGAGGGGAGA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TGTGATGGACTTCTATAAAACCCTAAGAGGAGGAGCTACTGTGAAGGTTTCTGCGTCTTCACCCTCACTGGCTG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TCGCTTCTCAATCAGACTCCAAGCAGCGAAGACTTTTGGTTGATTTTCCAAAAGGCTCAGTAAGCAATGCGCAG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CAGCCAGATCTGTCCAAAGCAGTTTCACTCTCAATGGGACTGTATATGGGAGAGACAGAAACAAAAGTGATGGG 296
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ---------------------------------------------ATGGGAGAGACAGAAACAAAAGTGATGGG 29
Query 297 AAATGACCTGGGATTCCCACAGCAGGGCCAAATCAGCCTTTCCTCGGGGGAAACAGACTTAAAGCTTTTGGAAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 30 AAATGACCTGGGATTCCCACAGCAGGGCCAAATCAGCCTTTCCTCGGGGGAAACAGACTTAAAGCTTTTGGAAG 103
Query 371 AAAGCATTGCAAACCTCAATAGGTCGACCAGTGTTCCAGAGAACCCCAAGAGTTCAGCATCCACTGCTGTGTCT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 104 AAAGCATTGCAAACCTCAATAGGTCGACCAGTGTTCCAGAGAACCCCAAGAGTTCAGCATCCACTGCTGTGTCT 177
Query 445 GCTGCCCCCACAGAGAAGGAGTTTCCAAAAACTCACTCTGATGTATCTTCAGAACAGCAACATTTGAAGGGCCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 178 GCTGCCCCCACAGAGAAGGAGTTTCCAAAAACTCACTCTGATGTATCTTCAGAACAGCAACATTTGAAGGGCCA 251
Query 519 GACTGGCACCAACGGTGGCAATGTGAAATTGTATACCACAGACCAAAGCACCTTTGACATTTTGCAGGATTTGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 252 GACTGGCACCAACGGTGGCAATGTGAAATTGTATACCACAGACCAAAGCACCTTTGACATTTTGCAGGATTTGG 325
Query 593 AGTTTTCTTCTGGGTCCCCAGGTAAAGAGACGAATGAGAGTCCTTGGAGATCAGACCTGTTGATAGATGAAAAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 326 AGTTTTCTTCTGGGTCCCCAGGTAAAGAGACGAATGAGAGTCCTTGGAGATCAGACCTGTTGATAGATGAAAAC 399
Query 667 TGTTTGCTTTCTCCTCTGGCGGGAGAAGACGATTCATTCCTTTTGGAAGGAAACTCGAATGAGGACTGCAAGCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 400 TGTTTGCTTTCTCCTCTGGCGGGAGAAGACGATTCATTCCTTTTGGAAGGAAACTCGAATGAGGACTGCAAGCC 473
Query 741 TCTCATTTTACCGGACACTAAACCCAAAATTAAGGATAATGGAGATCTGGTTTTGTCAAGCCCCAGTAATGTAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 474 TCTCATTTTACCGGACACTAAACCCAAAATTAAGGATAATGGAGATCTGGTTTTGTCAAGCCCCAGTAATGTAA 547
Query 815 CACTGCCCCAAGTGAAAACAGAAAAAGAAGATTTCATCGAACTCTGCACCCCTGGGGTAATTAAGCAAGAGAAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 548 CACTGCCCCAAGTGAAAACAGAAAAAGAAGATTTCATCGAACTCTGCACCCCTGGGGTAATTAAGCAAGAGAAA 621
Query 889 CTGGGCACAGTTTACTGTCAGGCAAGCTTTCCTGGAGCAAATATAATTGGTAATAAAATGTCTGCCATTTCTGT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 622 CTGGGCACAGTTTACTGTCAGGCAAGCTTTCCTGGAGCAAATATAATTGGTAATAAAATGTCTGCCATTTCTGT 695
Query 963 TCATGGTGTGAGTACCTCTGGAGGACAGATGTACCACTATGACATGAATACAGCATCCCTTTCTCAACAGCAGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 696 TCATGGTGTGAGTACCTCTGGAGGACAGATGTACCACTATGACATGAATACAGCATCCCTTTCTCAACAGCAGG 769
Query 1037 ATCAGAAGCCTATTTTTAATGTCATTCCACCAATTCCCGTTGGTTCCGAAAATTGGAATAGGTGCCAAGGATCT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 770 ATCAGAAGCCTATTTTTAATGTCATTCCACCAATTCCCGTTGGTTCCGAAAATTGGAATAGGTGCCAAGGATCT 843
Query 1111 GGAGATGACAACTTGACTTCTCTGGGGACTCTGAACTTCCCTGGTCGAACAGTTTTTTCTAATGGCTATTCAAG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 844 GGAGATGACAACTTGACTTCTCTGGGGACTCTGAACTTCCCTGGTCGAACAGTTTTTTCTAATGGCTATTCAAG 917
Query 1185 CCCCAGCATGAGACCAGATGTAAGCTCTCCTCCATCCAGCTCCTCAACAGCAACAACAGGACCACCTCCCAAAC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 918 CCCCAGCATGAGACCAGATGTAAGCTCTCCTCCATCCAGCTCCTCAACAGCAACAACAGGACCACCTCCCAAAC 991
Query 1259 TCTGCCTGGTGTGCTCTGATGAAGCTTCAGGATGTCATTATGGAGTCTTAACTTGTGGAAGCTGTAAAGTTTTC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 992 TCTGCCTGGTGTGCTCTGATGAAGCTTCAGGATGTCATTATGGAGTCTTAACTTGTGGAAGCTGTAAAGTTTTC 1065
Query 1333 TTCAAAAGAGCAGTGGAAGGACAGCACAATTACCTATGTGCTGGAAGGAATGATTGCATCATCGATAAAATTCG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1066 TTCAAAAGAGCAGTGGAAGGACAGCACAATTACCTATGTGCTGGAAGGAATGATTGCATCATCGATAAAATTCG 1139
Query 1407 AAGAAAAAACTGCCCAGCATGCCGCTATCGAAAATGTCTTCAGGCTGGAATGAACCTGGAAGCTCGAAAAACAA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1140 AAGAAAAAACTGCCCAGCATGCCGCTATCGAAAATGTCTTCAGGCTGGAATGAACCTGGAAGCTCGAAAAACAA 1213
Query 1481 AGAAAAAAATAAAAGGAATTCAGCAGGCCACTACAGGAGTCTCACAAGAAACCTCTGAAAATCCTGGTAACAAA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1214 AGAAAAAAATAAAAGGAATTCAGCAGGCCACTACAGGAGTCTCACAAGAAACCTCTGAAAATCCTGGTAACAAA 1287
Query 1555 ACAATAGTTCCTGCAACGTTACCACAACTCACCCCTACCCTGGTGTCACTGTTGGAGGTTATTGAACCTGAAGT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1288 ACAATAGTTCCTGCAACGTTACCACAACTCACCCCTACCCTGGTGTCACTGTTGGAGGTTATTGAACCTGAAGT 1361
Query 1629 GTTATATGCAGGATATGATAGCTCTGTTCCAGACTCAACTTGGAGGATCATGACTACGCTCAACATGTTAGGAG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1362 GTTATATGCAGGATATGATAGCTCTGTTCCAGACTCAACTTGGAGGATCATGACTACGCTCAACATGTTAGGAG 1435
Query 1703 GGCGGCAAGTGATTGCAGCAGTGAAATGGGCAAAGGCAATACCAGGTTTCAGGAACTTACACCTGGATGACCAA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1436 GGCGGCAAGTGATTGCAGCAGTGAAATGGGCAAAGGCAATACCAGGTTTCAGGAACTTACACCTGGATGACCAA 1509
Query 1777 ATGACCCTACTGCAGTACTCCTGGATGTTTCTTATGGCATTTGCTCTGGGGTGGAGATCATATAGACAATCAAG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1510 ATGACCCTACTGCAGTACTCCTGGATGTTTCTTATGGCATTTGCTCTGGGGTGGAGATCATATAGACAATCAAG 1583
Query 1851 TGCAAACCTGCTGTGTTTTGCTCCTGATCTGATTATTAATGAGCAGAGAATGACTCTACCCTGCATGTACGACC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1584 TGCAAACCTGCTGTGTTTTGCTCCTGATCTGATTATTAATGAGCAGAGAATGACTCTACCCTGCATGTACGACC 1657
Query 1925 AATGTAAACACATGCTGTATGTTTCCTCTGAGTTACACAGGCTTCAGGTATCTTATGAAGAGTATCTCTGTATG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1658 AATGTAAACACATGCTGTATGTTTCCTCTGAGTTACACAGGCTTCAGGTATCTTATGAAGAGTATCTCTGTATG 1731
Query 1999 AAAACCTTACTGCTTCTCTCTTCAGTTCCTAAGGACGGTCTGAAGAGCCAAGAGCTATTTGATGAAATTAGAAT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1732 AAAACCTTACTGCTTCTCTCTTCAGTTCCTAAGGACGGTCTGAAGAGCCAAGAGCTATTTGATGAAATTAGAAT 1805
Query 2073 GACCTACATCAAAGAGCTAGGAAAAGCCATTGTCAAGAGGGAAGGAAACTCCAGCCAGAACTGGCAGCGGTTTT 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1806 GACCTACATCAAAGAGCTAGGAAAAGCCATTGTCAAGAGGGAAGGAAACTCCAGCCAGAACTGGCAGCGGTTTT 1879
Query 2147 ATCAACTGACAAAACTCTTGGATTCTATGCATGAAGTGGTTGAAAATCTCCTTAACTATTGCTTCCAAACATTT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1880 ATCAACTGACAAAACTCTTGGATTCTATGCATGAAGTGGTTGAAAATCTCCTTAACTATTGCTTCCAAACATTT 1953
Query 2221 TTGGATAAGACCATGAGTATTGAATTCCCCGAGATGTTAGCTGAAATCATCACCAATCAGATACCAAAATATTC 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1954 TTGGATAAGACCATGAGTATTGAATTCCCCGAGATGTTAGCTGAAATCATCACCAATCAGATACCAAAATATTC 2027
Query 2295 AAATGGAAATATCAAAAAACTTCTGTTTCATCAAAAG 2331
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2028 AAATGGAAATATCAAAAAACTTCTGTTTCATCAAAAG 2064