Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469899
• Subject: NM_001172122.1
• Aligned Length: 1260
• Identities: 672
• Gaps: 522

Alignment

Query    1  ---------------------------ATGTACCCCCAGTACACTTACTACTATCCTCATTATCTCCAAACCAA  47
                                       |||||||||||||||||.|||||||.||||||.||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCAAACGCCTGGATCAGCCACAAATGTACCCCCAGTACACGTACTACTGTCCTCAGTACCTCCAAACCAA  74

Query   48  GCAGTCCTATGCACCAGCTCCCCACCCCATGGCTCCTCCCAGCCCCAGCACAAACAGCAGCAGCAACAACAGCA  121
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
Sbjct   75  GCAGTCCTATGCACCAGCTCCCCACCCCATGGCTCCTCCCAGCCCCAGCACAAACAGCAGCAG-----------  137

Query  122  GCAACAACAGCAGCGGGGAACAGTTGAGTAAAACCAACCTGTACATTCGAGGCCTCCCACCAGGCACCACTGAC  195
                |||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  138  ----CAACAGCAGCGGGGAACAGTTGAGTAAGACAAACCTATACATCCGAGGACTTCCACCAGGCACCACTGAC  207

Query  196  CAGGACCTAATCAAGCTGTGCCAACCGTATGGAAAAATTGTATCTACAAAGGCAATTCTTGACAAAAACACAAA  269
            ||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct  208  CAGGACCTCATCAAGCTATGTCAACCGTATGGAAAAATCGTATCCACAAAGGCAATTCTTGACAAGAATACGAA  281

Query  270  TCAGTGCAAAGGTTATGGTTTTGTAGATTTTGACAGTCCTGCAGCCGCACAGAAAGCGGTAGCATCTCTCAAGG  343
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||..|.||||
Sbjct  282  TCAGTGCAAAGGTTATGGTTTTGTAGATTTTGATAGTCCTGCAGCCGCACAGAAAGCAGTGGCGTCCTTGAAGG  355

Query  344  CAAATGGCGTGCAGGCACAGATGGCTAAGCAACAAGAGCAAGACCCAACAAACCTATACATCTCAAATCTCCCC  417
            |||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct  356  CAAATGGCGTGCAAGCACAGATGGCCAAGCAACAAGAGCAAGACCCTACGAATCTATACATCTCAAACCTTCCC  429

Query  418  ATTTCTATGGATGAGCAGGAGCTTGAGAATATGCTGAAACCCTTTGGACATGTCATTTCCACAAGAATACTAAG  491
            ||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||
Sbjct  430  ATCTCCATGGATGAGCAGGAGCTGGAGAACATGCTAAAGCCCTTTGGACACGTGATATCCACCAGAATCCTGAG  503

Query  492  AGACGCTAATGGAGTCAGCAGAGGTGTTGGCTTTGCCAGAATGGAGTCTACTGAAAAATGTGAAGTGGTAATTC  565
            .||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  504  GGATGCTAACGGAGTCAGCAGGGGCGTTGGCTTTGCCAGAATGGAGTCTACGGAAAAATGTGAAGTGGTGATTC  577

Query  566  AACATTTTAATGGAAAATATCTGAAAACACCACCAGGCATCCCAGCCCCCAGTGAGCCTTTGCTGTGCAAATTC  639
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct  578  AACATTTTAATGGAAAATATCTGAAAACACCACCAGGCATCCCAGCCCCCAGTGAGCCTTTGCTGTGCAAGTTT  651

Query  640  GCTGATGGAGGACAAAAGAAGCGACAGAATCAAAGCAAATATACCCAGAATGGGAGGCCTTGGCCCAGGGAAGG  713
            |||||.||||||||.||||||.|||||..|||.|||||..|.||||||||.||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  652  GCTGACGGAGGACAGAAGAAGAGACAGGGTCAGAGCAAGCACACCCAGAACGGGAGGCCATGGCCCAGAGAAGG  725

Query  714  AGAGGCTGGCATGGCTTTGACCTATGACCCCAC--CTGCC------AA--------------------------  753
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||  |||||      ||                          
Sbjct  726  AGAGGCTGGCATGGCTCTGACCTATGACCCCACAGCTGCCCTACAGAACGGATTTTATTCTTCACCGTACAGTC  799

Query  754  --------------------------------------------------------------------------  753
                                                                                      
Sbjct  800  TCGCAACCAACCGCATGATCCCACAGACATCTATCACGCCCTTCATTGCCGCTTCCCCTGTCTCCACATACCAG  873

Query  754  --------------------------------------------------------------------------  753
                                                                                      
Sbjct  874  GTCCAGAGCACGTCATGGACGCCACACCTGCCATACATTATGCAACCAACAGGTGCTGTGATCACACCCGCCGT  947

Query  754  --------------------------------------------------------------------------  753
                                                                                      
Sbjct  948  GGACCACCCCATGTCAATGCAGCCAACTAACATCGTGGGTCCCCTGACGCAGCAGATGAACCATCTTTCCCTGG  1021

Query  754  --------------------------------------------------------------------------  753
                                                                                      
Sbjct 1022  GGACAGCAGGAACGTATATGACTGCTGCTCCTATGCAAGGGACCTACATTCCCCAGTACACGCCTGTGCCTCCG  1095

Query  754  --------------------------------------------------------------------------  753
                                                                                      
Sbjct 1096  ACAGCTGTTTCTATTGAAGGTGTTGTTGCTGATACCTCTCCCCAGACGGTGGCCCCCTCATCCCAGGACAGCAG  1169

Query  754  --------------------------------------------------------------------------  753
                                                                                      
Sbjct 1170  TGGTCAGCAGCAACAGTTAGCAGTGGACACACCCAGTGAACACGCACCGGCATACTCCTTCCAACAGTCCAAAC  1243

Query  754  --  753
              
Sbjct 1244  CA  1245