Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469904
• Subject: XM_006513925.3
• Aligned Length: 1115
• Identities: 815
• Gaps: 238

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGGGAAGGTGACGCCATCTGGGCCCCACCCATCCTTCCTCACAGCACCCTCGGCACCTTAAGCCACCACCC  74

Query    1  ----------------------ATGGAGTCCAAGGTCTCAGAAGGTGGCCTGAATGTGACCCTCACCATCCGCC  52
                                  |||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct   75  TGAGCTACATTTTGGAGGGAAGATGGAATCTAAGGTCTCGGAAGGTGGCCTGAACGTAACCCTGACCATCCGCC  148

Query   53  TGCTGATGCATGGAAAGGAAGTTGGAAGCATCATCGGGAAGAAAGGAGAAACTGTGAAGAAGATGCGTGAGGAG  126
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  149  TACTGATGCATGGAAAGGAAGTTGGAAGCATCATCGGGAAGAAAGGAGAAACAGTAAAGAAGATGCGTGAAGAG  222

Query  127  AGTGGTGCAAGGATCAACATCTCAGAGGGAAACTGCCCAGAGAGGATTGTGACCATCACAGGCCCCACAGACGC  200
            |||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct  223  AGTGGCGCCAGGATCAACATCTCAGAGGGAAACTGCCCAGAGAGAATCGTTACAATCACAGGCCCAACTGACGC  296

Query  201  CATCTTCAAGGCCTTTGCCATGATCGCATACAAGTTTGAGGAGGATATCATCAACTCCATGAGCAACAGCCCTG  274
            ||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATCTTCAAGGCCTTTGCTATGATCGCGTACAAGTTTGAGGAGGACATCATTAATTCCATGAGCAACAGCCCTG  370

Query  275  CCACCAGCAAGCCCCCAGTGACGCTGAGGCTGGTGGTGCCTGCCAGCCAGTGCGGGTCCCTGATCGGCAAAGGA  348
            |||||||||||||.||||||||.|||.|.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  CCACCAGCAAGCCTCCAGTGACACTGCGACTAGTGGTCCCTGCCAGCCAGTGTGGGTCCCTGATCGGCAAAGGT  444

Query  349  GGCTCCAAGATCAAGGAGATCAGGGAGTCCACAGGTGCCCAGGTGCAGGTGGCTGGGGACATGCTGCCCAACTC  422
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCTCCAAGATCAAGGAGATCCGGGAGTCCACAGGTGCTCAGGTCCAGGTGGCAGGTGACATGCTGCCCAACTC  518

Query  423  CACGGAGCGAGCGGTGACCATCTCGGGGACCCCAGATGCCATCATCCAGTGCGTCAAGCAGATCTGTGTGGTCA  496
            |||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct  519  CACAGAGCGGGCAGTGACTATCTCAGGGACCCCAGACGCCATCATCCAGTGTGTGAAACAGATCTGTGTGGTCA  592

Query  497  TGCTGG--------------------------------------------------------------------  502
            ||||||                                                                    
Sbjct  593  TGCTGGAGTCCCCACCGAAAGGTGCCACCATTCCCTACCGCCCAAAGCCCGCCTCCACCCCTGTCATTTTTGCA  666

Query  503  -------AGGCCTACACAATCCAGGGACAGTATGCCATCCCTCACCCGGAT---TTGACCAAGCTCCACCAGTT  566
                   |||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||   ||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGTGGTCAGGCCTACACAATCCAGGGACAGTACGCCATCCCCCACCCAGATCAGTTGACCAAGCTCCACCAGTT  740

Query  567  GGCCATGCAGCAAACCCCCTTTCCTCCCCTCGGACAGACCAACCCCGCTTTCCCCGGAGAAAAGCTGCCTTTAC  640
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct  741  GGCCATGCAGCAAACCCCCTTTCCTCCCCTCGGACAGACCAACCCCGCTTTCCCC-------------------  795

Query  641  ACTCCTCCGAAGAAGCTCAAAATCTGATGGGCCAGTCATCAGGTCTGGACGCCAGCCCACCGGCCAGCACTCAT  714
                                                     ||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  796  -----------------------------------------GGTCTGGATGCCAGCCCACCGGCCAGCACTCAT  828

Query  715  GAGCTCACCATTCCCAATGATCTAATAGGCTGCATAATTGGACGCCAAGGGACCAAAATCAATGAAATTCGACA  788
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  829  GAGCTCACCATTCCCAATGATCTTATAGGCTGCATAATTGGACGCCAAGGCACCAAAATCAATGAAATCCGACA  902

Query  789  GATGTCTGGAGCTCAGATCAAAATCGCCAACGCCACGGAAGGGTCCTCAGAGCGTCAGATCACCATCACGGGGA  862
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct  903  GATGTCTGGAGCTCAGATCAAAATCGCCAATGCCACTGAAGGGTCGTCAGAGCGCCAGATTACCATCACAGGGA  976

Query  863  CCCCGGCCAACATCAGCCTTGCCCAGTATCTCATCAACGCCAGGCTGACGTCCGAGGTCACCGGGATGG--GCA  934
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||  |||
Sbjct  977  CCCCAGCCAACATCAGCCTTGCCCAGTATCTCATCAACGCTAGGCTGACGTCTGAGGTCACCGGGATGGGTGCA  1050

Query  935  CGCTG  939
            |.|  
Sbjct 1051  CTC--  1053