Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469904
• Subject: XM_011243517.2
• Aligned Length: 1088
• Identities: 874
• Gaps: 151

Alignment

Query    1  ATGGAGTCCAAGGTCTCAGAAGGTGGCCTGAATGTGACCCTCACCATCCGCCTGCTGATGCATGGAAAGGAAGT  74
            |||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAATCTAAGGTCTCGGAAGGTGGCCTGAACGTAACCCTGACCATCCGCCTACTGATGCATGGAAAGGAAGT  74

Query   75  TGGAAGCATCATCGGGAAGAAAGGAGAAACTGTGAAGAAGATGCGTGAGGAGAGTGGTGCAAGGATCAACATCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct   75  TGGAAGCATCATCGGGAAGAAAGGAGAAACAGTAAAGAAGATGCGTGAAGAGAGTGGCGCCAGGATCAACATCT  148

Query  149  CAGAGGGAAACTGCCCAGAGAGGATTGTGACCATCACAGGCCCCACAGACGCCATCTTCAAGGCCTTTGCCATG  222
            ||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  CAGAGGGAAACTGCCCAGAGAGAATCGTTACAATCACAGGCCCAACTGACGCCATCTTCAAGGCCTTTGCTATG  222

Query  223  ATCGCATACAAGTTTGAGGAGGATATCATCAACTCCATGAGCAACAGCCCTGCCACCAGCAAGCCCCCAGTGAC  296
            |||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  223  ATCGCGTACAAGTTTGAGGAGGACATCATTAATTCCATGAGCAACAGCCCTGCCACCAGCAAGCCTCCAGTGAC  296

Query  297  GCTGAGGCTGGTGGTGCCTGCCAGCCAGTGCGGGTCCCTGATCGGCAAAGGAGGCTCCAAGATCAAGGAGATCA  370
            .|||.|.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.
Sbjct  297  ACTGCGACTAGTGGTCCCTGCCAGCCAGTGTGGGTCCCTGATCGGCAAAGGTGGCTCCAAGATCAAGGAGATCC  370

Query  371  GGGAGTCCACAGGTGCCCAGGTGCAGGTGGCTGGGGACATGCTGCCCAACTCCACGGAGCGAGCGGTGACCATC  444
            ||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct  371  GGGAGTCCACAGGTGCTCAGGTCCAGGTGGCAGGTGACATGCTGCCCAACTCCACAGAGCGGGCAGTGACTATC  444

Query  445  TCGGGGACCCCAGATGCCATCATCCAGTGCGTCAAGCAGATCTGTGTGGTCATGCTGGAG--------------  504
            ||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||              
Sbjct  445  TCAGGGACCCCAGACGCCATCATCCAGTGTGTGAAACAGATCTGTGTGGTCATGCTGGAGTCCCCACCGAAAGG  518

Query  505  --------------------------------------------------------------------------  504
                                                                                      
Sbjct  519  TGCCACCATTCCCTACCGCCCAAAGCCCGCCTCCACCCCTGTCATTTTTGCAGGTGGTCAGGTAAGAGCCGACC  592

Query  505  --------------------------------------------------------GCCTACACAATCCAGGGA  522
                                                                    ||||||||||||||||||
Sbjct  593  CGCTCGCGGCCTCCACTGCCAACCTCAGCCTTTTACTGCAGCATCCGCCGCTGCCCGCCTACACAATCCAGGGA  666

Query  523  CAGTATGCCATCCCTCACCCGGAT---TTGACCAAGCTCCACCAGTTGGCCATGCAGCAAACCCCCTTTCCTCC  593
            |||||.||||||||.|||||.|||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGTACGCCATCCCCCACCCAGATCAGTTGACCAAGCTCCACCAGTTGGCCATGCAGCAAACCCCCTTTCCTCC  740

Query  594  CCTCGGACAGACCAACCCCGCTTTCCCCGGAGAAAAGCTGCCTTTACACTCCTCCGAAGAAGCTCAAAATCTGA  667
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTCGGACAGACCAACCCCGCTTTCCCCGGAGAAAAGCTGCCTTTACACTCCTCCGAAGAAGCTCAAAATCTGA  814

Query  668  TGGGCCAGTCATCAGGTCTGGACGCCAGCCCACCGGCCAGCACTCATGAGCTCACCATTCCCAATGATCTAATA  741
            ||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  815  TGGGCCAGTCGTCAGGTCTGGATGCCAGCCCACCGGCCAGCACTCATGAGCTCACCATTCCCAATGATCTTATA  888

Query  742  GGCTGCATAATTGGACGCCAAGGGACCAAAATCAATGAAATTCGACAGATGTCTGGAGCTCAGATCAAAATCGC  815
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGCTGCATAATTGGACGCCAAGGCACCAAAATCAATGAAATCCGACAGATGTCTGGAGCTCAGATCAAAATCGC  962

Query  816  CAACGCCACGGAAGGGTCCTCAGAGCGTCAGATCACCATCACGGGGACCCCGGCCAACATCAGCCTTGCCCAGT  889
            |||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAATGCCACTGAAGGGTCGTCAGAGCGCCAGATTACCATCACAGGGACCCCAGCCAACATCAGCCTTGCCCAGT  1036

Query  890  ATCTCATCAACGCCAGGCTGACGTCCGAGGTCACCGGGATGG--GCACGCTG  939
            |||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||  ||||.|  
Sbjct 1037  ATCTCATCAACGCTAGGCTGACGTCTGAGGTCACCGGGATGGGTGCACTC--  1086