Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470123
• Subject: NM_005232.5
• Aligned Length: 2928
• Identities: 2925
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAGCGGCGCTGGCCCCTGGGGCTAGGGCTGGTGCTGCTGCTCTGCGCCCCGCTGCCCCCGGGGGCGCGCGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCGGCGCTGGCCCCTGGGGCTAGGGCTGGTGCTGCTGCTCTGCGCCCCGCTGCCCCCGGGGGCGCGCGC  74

Query   75  CAAGGAAGTTACTCTGATGGACACAAGCAAGGCACAGGGAGAGCTGGGCTGGCTGCTGGATCCCCCAAAAGATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAAGGAAGTTACTCTGATGGACACAAGCAAGGCACAGGGAGAGCTGGGCTGGCTGCTGGATCCCCCAAAAGATG  148

Query  149  GGTGGAGTGAACAGCAACAGATACTGAATGGGACACCCCTGTACATGTACCAGGACTGCCCAATGCAAGGACGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGTGGAGTGAACAGCAACAGATACTGAATGGGACACCCCTGTACATGTACCAGGACTGCCCAATGCAAGGACGC  222

Query  223  AGAGACACTGACCACTGGCTTCGCTCCAATTGGATCTACCGCGGGGAGGAGGCTTCCCGCGTCCACGTGGAGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGAGACACTGACCACTGGCTTCGCTCCAATTGGATCTACCGCGGGGAGGAGGCTTCCCGCGTCCACGTGGAGCT  296

Query  297  GCAGTTCACCGTGCGGGACTGCAAGAGTTTCCCTGGGGGAGCCGGGCCTCTGGGCTGCAAGGAGACCTTCAACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAGTTCACCGTGCGGGACTGCAAGAGTTTCCCTGGGGGAGCCGGGCCTCTGGGCTGCAAGGAGACCTTCAACC  370

Query  371  TTCTGTACATGGAGAGTGACCAGGATGTGGGCATTCAGCTCCGACGGCCCTTGTTCCAGAAGGTAACCACGGTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTCTGTACATGGAGAGTGACCAGGATGTGGGCATTCAGCTCCGACGGCCCTTGTTCCAGAAGGTAACCACGGTG  444

Query  445  GCTGCAGACCAGAGCTTCACCATTCGAGACCTTGCGTCTGGCTCCGTGAAGCTGAATGTGGAGCGCTGCTCTCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCTGCAGACCAGAGCTTCACCATTCGAGACCTTGTGTCTGGCTCCGTGAAGCTGAATGTGGAGCGCTGCTCTCT  518

Query  519  GGGCCGCCTGACCCGCCGTGGCCTCTACCTCGCTTTCCACAACCCGGGTGCCTGTGTGGCCCTGGTGTCTGTCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGGCCGCCTGACCCGCCGTGGCCTCTACCTCGCTTTCCACAACCCGGGTGCCTGTGTGGCCCTGGTGTCTGTCC  592

Query  593  GGGTCTTCTACCAGCGCTGTCCTGAGACCCTGAATGGCTTGGCCCAATTCCCAGACACTCTGCCTGGCCCCGCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGTCTTCTACCAGCGCTGTCCTGAGACCCTGAATGGCTTGGCCCAATTCCCAGACACTCTGCCTGGCCCCGCT  666

Query  667  GGGTTGGTGGAAGTGGCGGGGACCTGCTTGCCCCACGCGCGGGCCAGCCCCAGGCCCTCAGGTGCACCCCGCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGGTTGGTGGAAGTGGCGGGGACCTGCTTGCCCCACGCGCGGGCCAGCCCCAGGCCCTCAGGTGCACCCCGCAT  740

Query  741  GCACTGCAGCCCTGATGGCGAGTGGCTGGTGCCTGTAGGACGGTGCCACTGTGAGCCTGGCTATGAGGAAGGTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCACTGCAGCCCTGATGGCGAGTGGCTGGTGCCTGTAGGACGGTGCCACTGTGAGCCTGGCTATGAGGAAGGTG  814

Query  815  GCAGTGGCGAAGCATGTGTTGCCTGCCCTAGCGGCTCCTACCGGATGGACATGGACACACCCCATTGTCTCACG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCAGTGGCGAAGCATGTGTTGCCTGCCCTAGCGGCTCCTACCGGATGGACATGGACACACCCCATTGTCTCACG  888

Query  889  TGCCCCCAGCAGAGCACTGCTGAGTCTGAGGGGGCCACCATCTGTACCTGTGAGAGCGGCCATTACAGAGCTCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGCCCCCAGCAGAGCACTGCTGAGTCTGAGGGGGCCACCATCTGTACCTGTGAGAGCGGCCATTACAGAGCTCC  962

Query  963  CGGGGAGGGCCCCCAGGTGGCATGCACAGGTCCCCCCTCGGCCCCCCGAAACCTGAGCTTCTCTGCCTCAGGGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGGGGAGGGCCCCCAGGTGGCATGCACAGGTCCCCCCTCGGCCCCCCGAAACCTGAGCTTCTCTGCCTCAGGGA  1036

Query 1037  CTCAGCTCTCCCTGCGTTGGGAACCCCCAGCAGATACGGGGGGACGCCAGGATGTCAGATACAGTGTGAGGTGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCAGCTCTCCCTGCGTTGGGAACCCCCAGCAGATACGGGGGGACGCCAGGATGTCAGATACAGTGTGAGGTGT  1110

Query 1111  TCCCAGTGTCAGGGCACAGCACAGGACGGGGGGCCCTGCCAGCCCTGTGGGGTGGGCGTGCACTTCTCGCCGGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCCCAGTGTCAGGGCACAGCACAGGACGGGGGGCCCTGCCAGCCCTGTGGGGTGGGCGTGCACTTCTCGCCGGG  1184

Query 1185  GGCCCGGGGGCTCACCACACCTGCAGTGCATGTCAATGGCCTTGAACCTTATGCCAACTACACCTTTAATGTGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGCCCGGGGGCTCACCACACCTGCAGTGCATGTCAATGGCCTTGAACCTTATGCCAACTACACCTTTAATGTGG  1258

Query 1259  AAGCCCAAAATGGAGTGTCAGGGCTGGGCAGCTCTGGCCATGCCAGCACCTCAGTCAGCATCAGCATGGGGCAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAGCCCAAAATGGAGTGTCAGGGCTGGGCAGCTCTGGCCATGCCAGCACCTCAGTCAGCATCAGCATGGGGCAT  1332

Query 1333  GCAGAGTCACTGTCAGGCCTGTCTCTGAGACTGGTGAAGAAAGAACCGAGGCAACTAGAGCTGACCTGGGCGGG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCAGAGTCACTGTCAGGCCTGTCTCTGAGACTGGTGAAGAAAGAACCGAGGCAACTAGAGCTGACCTGGGCGGG  1406

Query 1407  GTCCCGGCCCCGAAGCCCTGGGGCGAACCTGACCTATGAGCTGCACGTGCTGAACCAGGATGAAGAACGGTACC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTCCCGGCCCCGAAGCCCTGGGGCGAACCTGACCTATGAGCTGCACGTGCTGAACCAGGATGAAGAACGGTACC  1480

Query 1481  AGATGGTTCTAGAACCCAGGGTCTTGCTGACAGAGCTGCAGCCTGACACCACATACATCGTCAGAGTCCGAATG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGATGGTTCTAGAACCCAGGGTCTTGCTGACAGAGCTGCAGCCTGACACCACATACATCGTCAGAGTCCGAATG  1554

Query 1555  CTGACCCCACTGGGTCCTGGCCCTTTCTCCCCTGATCATGAGTTTCGGACCAGCCCACCAGTGTCCAGGGGCCT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTGACCCCACTGGGTCCTGGCCCTTTCTCCCCTGATCATGAGTTTCGGACCAGCCCACCAGTGTCCAGGGGCCT  1628

Query 1629  GACTGGAGGAGAGATTGTAGCCGTCATCTTTGGGCTGCTGCTTGGTGCAGCCTTGCTGCTTGGGATTCTCGTTT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GACTGGAGGAGAGATTGTAGCCGTCATCTTTGGGCTGCTGCTTGGTGCAGCCTTGCTGCTTGGGATTCTCGTTT  1702

Query 1703  TCCGGTCCAGGAGAGCCCAGCGGCAGAGGCAGCAGAGGCAGCGTGACCGCGCCACCGATGTGGATCGAGAGGAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TCCGGTCCAGGAGAGCCCAGCGGCAGAGGCAGCAGAGGCAGCGTGACCGCGCCACCGATGTGGATCGAGAGGAC  1776

Query 1777  AAGCTGTGGCTGAAGCCTTATGTGGACCTCCAGGCATACGAGGACCCTGCACAGGGAGCCCTGGACTTTACCCG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AAGCTGTGGCTGAAGCCTTATGTGGACCTCCAGGCATACGAGGACCCTGCACAGGGAGCCCTGGACTTTACCCG  1850

Query 1851  GGAGCTTGATCCAGCGTGGCTGATGGTGGACACTGTCATAGGAGAAGGAGAGTTTGGGGAAGTGTATCGAGGGA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGAGCTTGATCCAGCGTGGCTGATGGTGGACACTGTCATAGGAGAAGGAGAGTTTGGGGAAGTGTATCGAGGGA  1924

Query 1925  CCCTGAGGCTCCCCAGCCAGGACTGCAAGACTGTGGCCATTAAGACCTTAAAAGACACATCCCCAGGTGGCCAG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCCTGAGGCTCCCCAGCCAGGACTGCAAGACTGTGGCCATTAAGACCTTAAAAGACACATCCCCAGGTGGCCAG  1998

Query 1999  TGGTGGAACTTCCTTCGAGAGGCAACTATCATGGGCCAGTTTAGCCACCCGCATATTCTGCATCTGGAAGGCGT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TGGTGGAACTTCCTTCGAGAGGCAACTATCATGGGCCAGTTTAGCCACCCGCATATTCTGCATCTGGAAGGCGT  2072

Query 2073  CGTCACAAAGCGAAAGCCGATCATGATCATCACAGAATTTATGGAGAATGGAGCCCTGGATGCCTTCCTGAGGG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CGTCACAAAGCGAAAGCCGATCATGATCATCACAGAATTTATGGAGAATGGAGCCCTGGATGCCTTCCTGAGGG  2146

Query 2147  AGCGGGAGGACCAGCTGGTCCCTGGGCAGCTAGTGGCCATGCTGCAGGGCATAGCATCTGGCATGAACTACCTC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGCGGGAGGACCAGCTGGTCCCTGGGCAGCTAGTGGCCATGCTGCAGGGCATAGCATCTGGCATGAACTACCTC  2220

Query 2221  AGTAATCACAATTATGTCCACCGGGACCTGGCTGCCAGAAACATCTTGGTGAATCAAAACCTGTGCTGCAAGGT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  AGTAATCACAATTATGTCCACCGGGACCTGGCTGCCAGAAACATCTTGGTGAATCAAAACCTGTGCTGCAAGGT  2294

Query 2295  GTCTGACTTTGGCCTGACTCGCCTCCTGGATGACTTTGATGGCACATACGAAACCCAGGGAGGAAAGATCCCTA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GTCTGACTTTGGCCTGACTCGCCTCCTGGATGACTTTGATGGCACATACGAAACCCAGGGAGGAAAGATCCCTA  2368

Query 2369  TCCGTTGGACAGCCCCTGAAGCCATTGCCCATCGGATCTTCACCACAGCCAGCGATGTGTGGAGCTTTGGGATT  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TCCGTTGGACAGCCCCTGAAGCCATTGCCCATCGGATCTTCACCACAGCCAGCGATGTGTGGAGCTTTGGGATT  2442

Query 2443  GTGATGTGGGAGGTGCTGAGCTTTGGGGACAAGCCTTATGGGGAGATGAGCAATCAGGAGGTTATGAAGAGCAT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GTGATGTGGGAGGTGCTGAGCTTTGGGGACAAGCCTTATGGGGAGATGAGCAATCAGGAGGTTATGAAGAGCAT  2516

Query 2517  TGAGGATGGGTACCGGTTGCCCCCTCCTGTGGACTGCCCTGCCCCTCTGTATGAGCTCATGAAGAACTGCTGGG  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TGAGGATGGGTACCGGTTGCCCCCTCCTGTGGACTGCCCTGCCCCTCTGTATGAGCTCATGAAGAACTGCTGGG  2590

Query 2591  CATATGACCGTGCCCGCCGGCCACACTTCCAGAAGCTTCAGGCACATCTGGAGCAACTGCTTGCCAACCCCCAC  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  CATATGACCGTGCCCGCCGGCCACACTTCCAGAAGCTTCAGGCACATCTGGAGCAACTGCTTGCCAACCCCCAC  2664

Query 2665  TCCCTGCGGACCATTGCCAACTTTGACCCCAGGGTGACTCTTCGCCTGCCCAGCCTGAGTGGCTCAGATGGGAT  2738
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  TCCCTGCGGACCATTGCCAACTTTGACCCCAGGATGACTCTTCGCCTGCCCAGCCTGAGTGGCTCAGATGGGAT  2738

Query 2739  CCCGTATCGAACCGTCTCTGAGTGGCTCGAGTCCATACGCATGAAACGCTACATCCTGCACTTCCACTCGGCTG  2812
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CCCATATCGAACCGTCTCTGAGTGGCTCGAGTCCATACGCATGAAACGCTACATCCTGCACTTCCACTCGGCTG  2812

Query 2813  GGCTGGACACCATGGAGTGTGTGCTGGAGCTGACCGCTGAGGACCTGACGCAGATGGGAATCACACTGCCCGGG  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  GGCTGGACACCATGGAGTGTGTGCTGGAGCTGACCGCTGAGGACCTGACGCAGATGGGAATCACACTGCCCGGG  2886

Query 2887  CACCAGAAGCGCATTCTTTGCAGTATTCAGGGATTCAAGGAC  2928
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  CACCAGAAGCGCATTCTTTGCAGTATTCAGGGATTCAAGGAC  2928