Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470123
• Subject: XR_428169.4
• Aligned Length: 3134
• Identities: 2925
• Gaps: 206

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------------ATGGAGCGGCGCTG  14
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct    1  TAGTCCCTTGCAACCTGGCGCTGCCATCCGGGCCACTGTCCCAGGTCCCGGCCCGGAGCTATGGAGCGGCGCTG  74

Query   15  GCCCCTGGGGCTAGGGCTGGTGCTGCTGCTCTGCGCCCCGCTGCCCCCGGGGGCGCGCGCCAAGGAAGTTACTC  88
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCCCCTGGGGCTAGGGCTGGTGCTGCTGCTCTGCGCCCCGCTGCCCCCGGGGGCGCGCGCCAAGGAAGTTACTC  148

Query   89  TGATGGACACAAGCAAGGCACAGGGAGAGCTGGGCTGGCTGCTGGATCCCCCAAAAGATGGGTGGAGTGAACAG  162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGATGGACACAAGCAAGGCACAGGGAGAGCTGGGCTGGCTGCTGGATCCCCCAAAAGATGGGTGGAGTGAACAG  222

Query  163  CAACAGATACTGAATGGGACACCCCTGTACATGTACCAGGACTGCCCAATGCAAGGACGCAGAGACACTGACCA  236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAACAGATACTGAATGGGACACCCCTGTACATGTACCAGGACTGCCCAATGCAAGGACGCAGAGACACTGACCA  296

Query  237  CTGGCTTCGCTCCAATTGGATCTACCGCGGGGAGGAGGCTTCCCGCGTCCACGTGGAGCTGCAGTTCACCGTGC  310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTGGCTTCGCTCCAATTGGATCTACCGCGGGGAGGAGGCTTCCCGCGTCCACGTGGAGCTGCAGTTCACCGTGC  370

Query  311  GGGACTGCAAGAGTTTCCCTGGGGGAGCCGGGCCTCTGGGCTGCAAGGAGACCTTCAACCTTCTGTACATGGAG  384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGACTGCAAGAGTTTCCCTGGGGGAGCCGGGCCTCTGGGCTGCAAGGAGACCTTCAACCTTCTGTACATGGAG  444

Query  385  AGTGACCAGGATGTGGGCATTCAGCTCCGACGGCCCTTGTTCCAGAAGGTAACCACGGTGGCTGCAGACCAGAG  458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGTGACCAGGATGTGGGCATTCAGCTCCGACGGCCCTTGTTCCAGAAGGTAACCACGGTGGCTGCAGACCAGAG  518

Query  459  CTTCACCATTCGAGACCTTGCGTCTGGCTCCGTGAAGCTGAATGTGGAGCGCTGCTCTCTGGGCCGCCTGACCC  532
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTCACCATTCGAGACCTTGTGTCTGGCTCCGTGAAGCTGAATGTGGAGCGCTGCTCTCTGGGCCGCCTGACCC  592

Query  533  GCCGTGGCCTCTACCTCGCTTTCCACAACCCGGGTGCCTGTGTGGCCCTGGTGTCTGTCCGGGTCTTCTACCAG  606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCCGTGGCCTCTACCTCGCTTTCCACAACCCGGGTGCCTGTGTGGCCCTGGTGTCTGTCCGGGTCTTCTACCAG  666

Query  607  CGCTGTCCTGAGACCCTGAATGGCTTGGCCCAATTCCCAGACACTCTGCCTGGCCCCGCTGGGTTGGTGGAAGT  680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGCTGTCCTGAGACCCTGAATGGCTTGGCCCAATTCCCAGACACTCTGCCTGGCCCCGCTGGGTTGGTGGAAGT  740

Query  681  GGCGGGGACCTGCTTGCCCCACGCGCGGGCCAGCCCCAGGCCCTCAGGTGCACCCCGCATGCACTGCAGCCCTG  754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCGGGGACCTGCTTGCCCCACGCGCGGGCCAGCCCCAGGCCCTCAGGTGCACCCCGCATGCACTGCAGCCCTG  814

Query  755  ATGGCGAGTGGCTGGTGCCTGTAGGACGGTGCCACTGTGAGCCTGGCTATGAGGAAGGTGGCAGTGGCGAAGCA  828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGGCGAGTGGCTGGTGCCTGTAGGACGGTGCCACTGTGAGCCTGGCTATGAGGAAGGTGGCAGTGGCGAAGCA  888

Query  829  TGTGTTGCCTGCCCTAGCGGCTCCTACCGGATGGACATGGACACACCCCATTGTCTCACGTGCCCCCAGCAGAG  902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGTGTTGCCTGCCCTAGCGGCTCCTACCGGATGGACATGGACACACCCCATTGTCTCACGTGCCCCCAGCAGAG  962

Query  903  CACTGCTGAGTCTGAGGGGGCCACCATCTGTACCTGTGAGAGCGGCCATTACAGAGCTCCCGGGGAGGGCCCCC  976
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CACTGCTGAGTCTGAGGGGGCCACCATCTGTACCTGTGAGAGCGGCCATTACAGAGCTCCCGGGGAGGGCCCCC  1036

Query  977  AGGTGGCATGCACAGGTCCCCCCTCGGCCCCCCGAAACCTGAGCTTCTCTGCCTCAGGGACTCAGCTCTCCCTG  1050
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGTGGCATGCACAGGTCCCCCCTCGGCCCCCCGAAACCTGAGCTTCTCTGCCTCAGGGACTCAGCTCTCCCTG  1110

Query 1051  CGTTGGGAACCCCCAGCAGATACGGGGGGACGCCAGGATGTCAGATACAGTGTGAGGTGTTCCCAGTGTCAGGG  1124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGTTGGGAACCCCCAGCAGATACGGGGGGACGCCAGGATGTCAGATACAGTGTGAGGTGTTCCCAGTGTCAGGG  1184

Query 1125  CACAGCACAGGACGGGGGGCCCTGCCAGCCCTGTGGGGTGGGCGTGCACTTCTCGCCGGGGGCCCGGGGGCTCA  1198
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CACAGCACAGGACGGGGGGCCCTGCCAGCCCTGTGGGGTGGGCGTGCACTTCTCGCCGGGGGCCCGGGGGCTCA  1258

Query 1199  CCACACCTGCAGTGCATGTCAATGGCCTTGAACCTTATGCCAACTACACCTTTAATGTGGAAGCCCAAAATGGA  1272
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCACACCTGCAGTGCATGTCAATGGCCTTGAACCTTATGCCAACTACACCTTTAATGTGGAAGCCCAAAATGGA  1332

Query 1273  GTGTCAGGGCTGGGCAGCTCTGGCCATGCCAGCACCTCAGTCAGCATCAGCATGGGGCATGCAGAGTCACTGTC  1346
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTGTCAGGGCTGGGCAGCTCTGGCCATGCCAGCACCTCAGTCAGCATCAGCATGGGGCATGCAGAGTCACTGTC  1406

Query 1347  AGGCCTGTCTCTGAGACTGGTGAAGAAAGAACCGAGGCAACTAGAGCTGACCTGGGCGGGGTCCCGGCCCCGAA  1420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGGCCTGTCTCTGAGACTGGTGAAGAAAGAACCGAGGCAACTAGAGCTGACCTGGGCGGGGTCCCGGCCCCGAA  1480

Query 1421  GCCCTGGGGCGAACCTGACCTATGAGCTGCACGTGCTGAACCAGGATGAAGAACGGTACCAGATGGTTCTAGAA  1494
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCCCTGGGGCGAACCTGACCTATGAGCTGCACGTGCTGAACCAGGATGAAGAACGGTACCAGATGGTTCTAGAA  1554

Query 1495  CCCAGGGTCTTGCTGACAGAGCTGCAGCCTGACACCACATACATCGTCAGAGTCCGAATGCTGACCCCACTGGG  1568
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCCAGGGTCTTGCTGACAGAGCTGCAGCCTGACACCACATACATCGTCAGAGTCCGAATGCTGACCCCACTGGG  1628

Query 1569  TCCTGGCCCTTTCTCCCCTGATCATGAGTTTCGGACCAGCCCACCAGTGTCCAGGGGCCTGACTGGAGGAGAGA  1642
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TCCTGGCCCTTTCTCCCCTGATCATGAGTTTCGGACCAGCCCACCAGTGTCCAGGGGCCTGACTGGAGGAGAGA  1702

Query 1643  TTGTAGCCGTCATCTTTGGGCTGCTGCTTGGTGCAGCCTTGCTGCTTGGGATTCTCGTTTTCCGGTCCAGGAGA  1716
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TTGTAGCCGTCATCTTTGGGCTGCTGCTTGGTGCAGCCTTGCTGCTTGGGATTCTCGTTTTCCGGTCCAGGAGA  1776

Query 1717  GCCCAGCGGCAGAGGCAGCAGAGGCAGCGTGACCGCGCCACCGATGTGGATCGAGAGGACAAGCTGTGGCTGAA  1790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCCCAGCGGCAGAGGCAGCAGAGGCAGCGTGACCGCGCCACCGATGTGGATCGAGAGGACAAGCTGTGGCTGAA  1850

Query 1791  GCCTTATGTGGACCTCCAGGCATACGAGGACCCTGCACAGGGAGCCCTGGACTTTACCCGGGAGCTTGATCCAG  1864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCCTTATGTGGACCTCCAGGCATACGAGGACCCTGCACAGGGAGCCCTGGACTTTACCCGGGAGCTTGATCCAG  1924

Query 1865  CGTGGCTGATGGTGGACACTGTCATAGGAGAAGGAGAGTTTGGGGAAGTGTATCGAGGGACCCTGAGGCTCCCC  1938
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CGTGGCTGATGGTGGACACTGTCATAGGAGAAGGAGAGTTTGGGGAAGTGTATCGAGGGACCCTGAGGCTCCCC  1998

Query 1939  AGCCAGGACTGCAAGACTGTGGCCATTAAGACCTTAAAAGACACATCCCCAGGTGGCCAGTGGTGGAACTTCCT  2012
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AGCCAGGACTGCAAGACTGTGGCCATTAAGACCTTAAAAGACACATCCCCAGGTGGCCAGTGGTGGAACTTCCT  2072

Query 2013  TCGAGAGGCAACTATCATGGGCCAGTTTAGCCACCCGCATATTCTGCATCTGGAAGGCGTCGTCACAAAGCGAA  2086
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TCGAGAGGCAACTATCATGGGCCAGTTTAGCCACCCGCATATTCTGCATCTGGAAGGCGTCGTCACAAAGCGAA  2146

Query 2087  AGCCGATCATGATCATCACAGAATTTATGGAGAATGGAGCCCTGGATGCCTTCCTGAGGGAGCGGGAGGACCAG  2160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGCCGATCATGATCATCACAGAATTTATGGAGAATGGAGCCCTGGATGCCTTCCTGAGGGAGCGGGAGGACCAG  2220

Query 2161  CTGGTCCCTGGGCAGCTAGTGGCCATGCTGCAGGGCATAGCATCTGGCATGAACTACCTCAGTAATCACAATTA  2234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTGGTCCCTGGGCAGCTAGTGGCCATGCTGCAGGGCATAGCATCTGGCATGAACTACCTCAGTAATCACAATTA  2294

Query 2235  TGTCCACCGGGACCTGGCTGCCAGAAACATCTTGGTGAATCAAAACCTGTGCTGCAAGGTGTCTGACTTTGGCC  2308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TGTCCACCGGGACCTGGCTGCCAGAAACATCTTGGTGAATCAAAACCTGTGCTGCAAGGTGTCTGACTTTGGCC  2368

Query 2309  TGACTCGCCTCCTGGATGACTTTGATGGCACATACGAAACCCAGGGAGGAAAGATCCCTATCCGTTGGACAGCC  2382
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TGACTCGCCTCCTGGATGACTTTGATGGCACATACGAAACCCAGGGAGGAAAGATCCCTATCCGTTGGACAGCC  2442

Query 2383  CCTGAAGCCATTGCCCATCGGATCTTCACCACAGCCAGCGATGTGTGGAGCTTTGGGATTGTGATGTGGGAGGT  2456
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CCTGAAGCCATTGCCCATCGGATCTTCACCACAGCCAGCGATGTGTGGAGCTTTGGGATTGTGATGTGGGAGGT  2516

Query 2457  GCTGAGCTTTGGGGACAAGCCTTATGGGGAGATGAGCAATCAGGAGGTTATGAAGAGCATTGAGGATGGGTACC  2530
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GCTGAGCTTTGGGGACAAGCCTTATGGGGAGATGAGCAATCAGGAGGTTATGAAGAGCATTGAGGATGGGTACC  2590

Query 2531  GGTTGCCCCCTCCTGTGGACTGCCCTGCCCCTCTGTATGAGCTCATGAAGAACTGCTGGGCATATGACCGTGCC  2604
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  GGTTGCCCCCTCCTGTGGACTGCCCTGCCCCTCTGTATGAGCTCATGAAGAACTGCTGGGCATATGACCGTGCC  2664

Query 2605  CGCCGGCCACACTTCCAGAAGCTTCAGGCACATCTGGAGCAACTGCTTGCCAACCCCCACTCCCTGCGGACCAT  2678
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CGCCGGCCACACTTCCAGAAGCTTCAGGCACATCTGGAGCAACTGCTTGCCAACCCCCACTCCCTGCGGACCAT  2738

Query 2679  TGCCAACTTTGACCCCAGGGTGACTCTTCGCCTGCCCAGCCTGAGTGGCTCAGATGGGATCCCGTATCGAACCG  2752
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2739  TGCCAACTTTGACCCCAGGATGACTCTTCGCCTGCCCAGCCTGAGTGGCTCAGATGGGATCCCATATCGAACCG  2812

Query 2753  TCTCTGAGTGGCTCGAGTCCATACGCATGAAACGCTACATCCTGCACTTCCACTCGGCTGGGCTGGACACCATG  2826
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  TCTCTGAGTGGCTCGAGTCCATACGCATGAAACGCTACATCCTGCACTTCCACTCGGCTGGGCTGGACACCATG  2886

Query 2827  GAGTGTGTGCTGGAGCTGACCGCTGAGGACCTGACGCAGATGGGAATCACACTGCCCGGGCACCAGAAGCGCAT  2900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  GAGTGTGTGCTGGAGCTGACCGCTGAGGACCTGACGCAGATGGGAATCACACTGCCCGGGCACCAGAAGCGCAT  2960

Query 2901  TCTTTGCAGTATTCAGGGATTCAAGGAC----------------------------------------------  2928
            ||||||||||||||||||||||||||||                                              
Sbjct 2961  TCTTTGCAGTATTCAGGGATTCAAGGACTGATCCCTCCTCTCACCCCATGCCCAATCAGGGTGCAAGGAGCAAG  3034

Query 2929  --------------------------------------------------------------------------  2928
                                                                                      
Sbjct 3035  GACGGGGCCAAGGAACTGATTTTCTGCCTCCATCCCACCCATGAGGGCTGCAGGCACTACAAAAGAGCTGACTA  3108

Query 2929  --------------------------  2928
                                      
Sbjct 3109  CTGAGAATTCTGGAAAACAAGGTTTT  3134