Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470260
• Subject: XM_011543922.1
• Aligned Length: 1636
• Identities: 1469
• Gaps: 164

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCCGCGTCCCCTCCCGCTGCGGACGGGTCCTTTGGTACATGCAGTCCGAGGTCCTCAGGATATAGCCGTGA  74

Query    1  -------------------------------------------------------ATGGATCGGATGAAGAAGA  19
                                                                   |||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTAAACACAGAAATCTACCCTGGCGGAGCTGATCTTCTAGTTGTGGCGATCGCCATGGATCGGATGAAGAAGA  148

Query   20  TCAAACGGCAGCTGTCAATGACACTCCGAGGTGGCCGAGGCATAGACAAGACCAATGGTGCCCCTGAGCAGATA  93
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCAAACGGCAGCTGTCAATGACACTCCGAGGTGGCCGAGGCATAGACAAGACCAATGGTGCCCCTGAGCAGATA  222

Query   94  GGCCTGGATGAGAGTGGTGGTGGTGGCGGCAGTGACCCTGGAGAGGCCCCCACACGTGCTGCTCCTGGGGAACT  167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGCCTGGATGAGAGTGGTGGTGGTGGCGGCAGTGACCCTGGAGAGGCCCCCACACGTGCTGCTCCTGGGGAACT  296

Query  168  TCGTTCTGCACGGGGCCCACTCAGCTCTGCACCAGAGATTGTGCACGAGGACTTGAAGATGGGGTCTGATGGGG  241
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCGTTCTGCACGGGGCCCACTCAGCTCTGCACCAGAGATTGTGCACGAGGACTTGAAGATGGGGTCTGATGGGG  370

Query  242  AGAGTGACCAGGCTTCAGCCACGTCCTCGGATGAGGTGCAGTCTCCAGTGAGAGTGCGTATGCGCAACCATCCC  315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGAGTGACCAGGCTTCAGCCACGTCCTCGGATGAGGTGCAGTCTCCAGTGAGAGTGCGTATGCGCAACCATCCC  444

Query  316  CCACGCAAGATCTCCACTGAGGACATCAACAAGCGCCTATCACTACCAGCTGACATCCGGCTGCCTGAGGGCTA  389
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCACGCAAGATCTCCACTGAGGACATCAACAAGCGCCTATCACTACCAGCTGACATCCGGCTGCCTGAGGGCTA  518

Query  390  CCTGGAGAAGCTGACCCTCAATAGCCCCATCTTTGACAAGCCCCTCAGCCGCCGCCTCCGTCGTGTCAGCCTAT  463
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCTGGAGAAGCTGACCCTCAATAGCCCCATCTTTGACAAGCCCCTCAGCCGCCGCCTCCGTCGTGTCAGCCTAT  592

Query  464  CTGAGATTGGCTTTGGGAAACTGGAGACCTACATTAAGCTGGACAAACTGGGCGAGGGTACCTATGCCACCGTC  537
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGAGATTGGCTTTGGGAAACTGGAGACCTACATTAAGCTGGACAAACTGGGCGAGGGTACCTATGCCACCGTC  666

Query  538  TACAAAGGCAAAAGCAAGCTCACAGACAACCTTGTGGCACTCAAGGAGATCAGACTGGAACATGAAGAGGGGGC  611
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TACAAAGGCAAAAGCAAGCTCACAGACAACCTTGTGGCACTCAAGGAGATCAGACTGGAACATGAAGAGGGGGC  740

Query  612  ACCCTGCACCGCCATCCGGGAAGTGTCCCTACTCAAGGACCTCAAACACGCCAACATCGTTACGCTACATGACA  685
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACCCTGCACCGCCATCCGGGAAGTGTCCCTGCTCAAGGACCTCAAACACGCCAACATCGTTACGCTACATGACA  814

Query  686  TTATCCACACGGAGAAGTCCCTCACCCTTGTCTTTGAGTACCTGGACAAGGACCTGAAGCAGTACCTGGATGAC  759
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTATCCACACGGAGAAGTCCCTCACCCTTGTCTTTGAGTACCTGGACAAGGACCTGAAGCAGTACCTGGATGAC  888

Query  760  TGTGGGAACATCATCAACATGCACAACGTGAAACTGTTCCTGTTCCAGCTGCTCCGTGGCCTGGCCTACTGCCA  833
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGTGGGAACATCATCAACATGCACAACGTGAAACTGTTCCTGTTCCAGCTGCTCCGTGGCCTGGCCTACTGCCA  962

Query  834  CCGGCAGAAGGTGCTACACCGAGACCTCAAGCCCCAGAACCTGCTCATCAACGAGAGGGGAGAGCTCAAGCTGG  907
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCGGCAGAAGGTGCTACACCGAGACCTCAAGCCCCAGAACCTGCTCATCAACGAGAGGGGAGAGCTCAAGCTGG  1036

Query  908  CTGACTTTGGCCTGGCCCGAGCCAAGTCAATCCCAACAAAGACATACTCCAATGAGGTGGTGACACTGTGGTAC  981
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGACTTTGGCCTGGCCCGAGCCAAGTCAATCCCAACAAAGACATACTCCAATGAGGTGGTGACACTGTGGTAC  1110

Query  982  CGGCCCCCTGACATCCTGCTTGGGTCCACGGACTACTCCACTCAGATTGACATGTGGGGTGTGGGCTGCATCTT  1055
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGGCCCCCTGACATCCTGCTTGGGTCCACGGACTACTCCACTCAGATTGACATGTGGGGTGTGGGCTGCATCTT  1184

Query 1056  CTATGAGATGGCCACAGGCCGTCCCCTCTTTCCGGGCTCCACGGTGGAGGAACAGCTACACTTCATCTTCCGTA  1129
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTATGAGATGGCCACAGGCCGTCCCCTCTTTCCGGGCTCCACGGTGGAGGAACAGCTACACTTCATCTTCCGTA  1258

Query 1130  TCTTAGGAACCCCAACTGAGGAGACGTGGCCAGGCATCCTGTCCAACGAGGAGTTCAAGACATACAACTACCCC  1203
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCTTAGGAACCCCAACTGAGGAGACGTGGCCAGGCATCCTGTCCAACGAGGAGTTCAAGACATACAACTACCCC  1332

Query 1204  AAGTACCGAGCCGAGGCCCTTTTGAGCCACGCACCCCGACTTGATAGCGACGGGGCCGACCTCCTCACCAAGCT  1277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGTACCGAGCCGAGGCCCTTTTGAGCCACGCACCCCGACTTGATAGCGACGGGGCCGACCTCCTCACCAAGCT  1406

Query 1278  GTTGCAGTTTGAGGGTCGAAATCGGATCTCCGCAGAGGATGCCATGAAACATCCATTCTTCCTCAGTCTGGGGG  1351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTTGCAGTTTGAGGGTCGAAATCGGATCTCCGCAGAGGATGCCATGAAACATCCATTCTTCCTCAGTCTGGGGG  1480

Query 1352  AGCGGATCCACAAACTTCCTGACACTACTTCCATATTTGCACTAAAGGAGATTCAGCTACAAAAGGAGGCCAGC  1425
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGCGGATCCACAAACTTCCTGACACTACTTCCATATTTGCACTAAAGGAGATTCAGCTACAAAAGGAGGCCAGC  1554

Query 1426  CTTCGGTCTTCGTCGATGCCTGACTCAGGCAGGCCAGCTTTCCGCGTGGTGGACA------CCGAGTTC-----  1488
            ||||||||||||||||||||||||||||          ||.||    ||||||||      ||  ||.|     
Sbjct 1555  CTTCGGTCTTCGTCGATGCCTGACTCAG----------TTGCC----GGTGGACAGCATGGCC--GTGCCAGCC  1612

Query 1489  --------  1488
                    
Sbjct 1613  TCCCACAC  1620