Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470292
• Subject: XM_005269741.4
• Aligned Length: 1822
• Identities: 1495
• Gaps: 314

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGTGTCCCACAACAGTCTGTCCTTGTCTGTCCTCCTGCTCCATGATGGTGAACTTGGGAGGGCAGAGCCTGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTGGGCTCTCCCAGCCTCCTTAATACCCCACAGAGGGTCTTGGGAGTGTTTGGGGAACTCCACCTTCCTCCCTG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GGAAGAGGGGAAGGTTTCCCCTCCTCTGCCAGTGGGATAGGGGGAGACTTTCCTCCTGGTGTTTTCATGTGGTC  222

Query    1  ----------------------------------------------------------ATGAGCT----ACCCT  12
                                                                      ..|||||    .|.||
Sbjct  223  TGTGGTGTCCCGAGGCTCGAGGCTCGAGGCTTTACTGGGCCTCCCTTTCTGACCACCTGGGAGCTCTCATCTCT  296

Query   13  GGCTATCCCCCG------------CCCCCAGGTGGCTACCCACCA----------GCTGC-ACCAGGTGGTGGT  63
            |.|| |.|||||            |...||||.|||||      |          |.||| ..|||||||||||
Sbjct  297  GCCT-TTCCCCGTGTGGTGGGGGACTGGCAGGGGGCTA------AAGGGCTTGGTGTTGCTTTCAGGTGGTGGT  363

Query   64  CCCTGGGGAGGTGCTGCCTACCCTCCTCCGCCCAGCATGCCCCCCATCGGGCTGGATAACGTGGCCACCTATGC  137
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  364  CCCTGGGGAGGTGCTGCCTACCCTCCTCCGCCCAGCATGCCCCCCATCGGGCTGGATAACGTGGCCACCTATGC  437

Query  138  GGGGCAGTTCAACCAGGACTATCTCTCGGGAATGGCGGCCAACATGTCTGGGACATTTGGAGGAGCCAACATGC  211
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  438  GGGGCAGTTCAACCAGGACTATCTCTCGGGAATGGCGGCCAACATGTCTGGGACATTTGGAGGAGCCAACATGC  511

Query  212  CCAACCTGTACCCTGGGGCCCCTGGGGCTGGCTACCCACCAGTGCCCCCTGGCGGCTTTGGGCAGCCCCCCTCT  285
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  512  CCAACCTGTACCCTGGGGCCCCTGGGGCTGGCTACCCACCAGTGCCCCCTGGCGGCTTTGGGCAGCCCCCCTCT  585

Query  286  GCCCAGCAGCCTGTTCCTCCCTATGGGATGTATCCACCCCCAGGAGGAAACCCACCCTCCAGGATGCCCTCATA  359
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  586  GCCCAGCAGCCTGTTCCTCCCTATGGGATGTATCCACCCCCAGGAGGAAACCCACCCTCCAGGATGCCCTCATA  659

Query  360  TCCGCCATACCCAGGGGCCCCTGTGCCGGGCCAGCCCATGCCACCCCCCGGACAGCAGCCCCCAGGGGCCTACC  433
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  660  TCCGCCATACCCAGGGGCCCCTGTGCCGGGCCAGCCCATGCCACCCCCCGGACAGCAGCCCCCAGGGGCCTACC  733

Query  434  CTGGGCAGCCACCAGTGACCTACCCTGGTCAGCCTCCAGTGCCACTCCCTGGGCAGCAGCAGCCAGTGCCGAGC  507
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  734  CTGGGCAGCCACCAGTGACCTACCCTGGTCAGCCTCCAGTGCCACTCCCTGGGCAGCAGCAGCCAGTGCCGAGC  807

Query  508  TACCCAGGATACCCGGGGTCTGGGACTGTCACCCCCGCTGTGCCCCCAACCCAGTTTGGAAGCCGAGGCACCAT  581
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  808  TACCCAGGATACCCGGGGTCTGGGACTGTCACCCCCGCTGTGCCCCCAACCCAGTTTGGAAGCCGAGGCACCAT  881

Query  582  CACTGATGCTCCCGGCTTTGACCCCCTGCGAGATGCCGAGGTCCTGCGGAAGGCCATGAAAGGCTTCGGGACGG  655
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  882  CACTGATGCTCCCGGCTTTGACCCCCTGCGAGATGCCGAGGTCCTGCGGAAGGCCATGAAAGGCTTCGGGACGG  955

Query  656  ATGAGCAGGCCATCATTGACTGCCTGGGGAGTCGCTCCAACAAGCAGCGGCAGCAGATCCTACTTTCCTTCAAG  729
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  956  ATGAGCAGGCCATCATTGACTGCCTGGGGAGTCGCTCCAACAAGCAGCGGCAGCAGATCCTACTTTCCTTCAAG  1029

Query  730  ACGGCTTACGGCAAGGATTTGATCAAAGATCTGAAATCTGAACTGTCAGGAAACTTTGAGAAGACAATCTTGGC  803
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030  ACGGCTTACGGCAAGGATTTGATCAAAGATCTGAAATCTGAACTGTCAGGAAACTTTGAGAAGACAATCTTGGC  1103

Query  804  TCTGATGAAGACCCCAGTCCTCTTTGACATTTATGAGATAAAGGAAGCCATCAAGGGGGTTGGCACTGATGAAG  877
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104  TCTGATGAAGACCCCAGTCCTCTTTGACATTTATGAGATAAAGGAAGCCATCAAGGGGGTTGGCACTGATGAAG  1177

Query  878  CCTGCCTGATTGAGATCCTCGCTTCCCGCAGCAATGAGCACATCCGAGAATTAAACAGAGCCTACAAAGCAGAA  951
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178  CCTGCCTGATTGAGATCCTCGCTTCCCGCAGCAATGAGCACATCCGAGAATTAAACAGAGCCTACAAAGCAGAA  1251

Query  952  TTCAAAAAGACCCTGGAAGAGGCCATTCGAAGCGACACATCAGGGCACTTCCAGCGGCTCCTCATCTCTCTCTC  1025
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252  TTCAAAAAGACCCTGGAAGAGGCCATTCGAAGCGACACATCAGGGCACTTCCAGCGGCTCCTCATCTCTCTCTC  1325

Query 1026  TCAGGGAAACCGTGATGAAAGCACAAACGTGGACATGTCACTCGCCCAGAGAGATGCCCAGGAGCTGTATGCGG  1099
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1326  TCAGGGAAACCGTGATGAAAGCACAAACGTGGACATGTCACTCGCCCAGAGAGATGCCCAGGAGCTGTATGCGG  1399

Query 1100  CCGGGGAGAACCGCCTGGGAACAGACGAGTCCAAGTTCAATGCGGTTCTGTGCTCCCGGAGCCGGGCCCACCTG  1173
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1400  CCGGGGAGAACCGCCTGGGAACAGACGAGTCCAAGTTCAATGCGGTTCTGTGCTCCCGGAGCCGGGCCCACCTG  1473

Query 1174  GTAGCAGTTTTCAATGAGTACCAGAGAATGACAGGCCGGGACATTGAGAAGAGCATCTGCCGGGAGATGTCCGG  1247
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1474  GTAGCAGTTTTCAATGAGTACCAGAGAATGACAGGCCGGGACATTGAGAAGAGCATCTGCCGGGAGATGTCCGG  1547

Query 1248  GGACCTGGAGGAGGGCATGCTGGCCGTGGTGAAATGTCTCAAGAATACCCCAGCCTTCTTTGCGGAGAGGCTCA  1321
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1548  GGACCTGGAGGAGGGCATGCTGGCCGTGGTGAAATGTCTCAAGAATACCCCAGCCTTCTTTGCGGAGAGGCTCA  1621

Query 1322  ACAAGGCCATGAGGGGGGCAGGAACAAAGGACCGGACCCTGATTCGCATCATGGTGTCTCGCAGCGAGACCGAC  1395
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1622  ACAAGGCCATGAGGGGGGCAGGAACAAAGGACCGGACCCTGATTCGCATCATGGTGTCTCGCAGCGAGACCGAC  1695

Query 1396  CTCCTGGACATCAGATCAGAGTATAAGCGGATGTACGGCAAGTCGCTGTACCACGACATCTCGGGAGATACTTC  1469
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1696  CTCCTGGACATCAGATCAGAGTATAAGCGGATGTACGGCAAGTCGCTGTACCACGACATCTCGGGAGATACTTC  1769

Query 1470  AGGGGATTACCGGAAGATTCTGCTGAAGATCTGTGGTGGCAATGAC  1515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1770  AGGGGATTACCGGAAGATTCTGCTGAAGATCTGTGGTGGCAATGAC  1815