Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470475
• Subject: NM_001330212.1
• Aligned Length: 1320
• Identities: 1099
• Gaps: 219

Alignment

Query    1  ATGGGTCAAAGTCAGAGTGGTGGTCATGGTCCTGGAGGTGGCAAGAAGGATGACAAGGACAAGAAAAAGAAATA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGAACCTCCTGTACCAACTAGAGTGGGGAAAAAGAAGAAGAAAACAAAGGGACCAGATGCTGCCAGCAAACTGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CACTGGTGACACCTCACACTCAGTGCCGGTTAAAATTACTGAAGTTAGAGAGAATTAAAGGCTATCTTCTCATG  222
                                                                                   |||
Sbjct    1  -----------------------------------------------------------------------ATG  3

Query  223  GAGGAAGAATTCATTAGAAATCAGGAACAAATGAAACCATTAGAAGAAAAGCAAGAGGAGGAAAGATCAAAAGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    4  GAGGAAGAATTCATTAGAAATCAGGAACAAATGAAACCATTAGAAGAAAAGCAAGAGGAGGAAAGATCAAAAGT  77

Query  297  GGATGATCTGAGGGGGACCCCGATGTCAGTAGGAACCTTGGAAGAGATTATTGATGACAATCATGCCATCGTGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   78  GGATGATCTGAGGGGGACCCCGATGTCAGTAGGAACCTTGGAAGAGATCATTGATGACAATCATGCCATCGTGT  151

Query  371  CTACATCTGTGGGCTCAGAACACTACGTCAGCATTCTTTCATTTGTAGACAAGGATCTGCTGGAACCTGGCTGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  152  CTACATCTGTGGGCTCAGAACACTACGTCAGCATTCTTTCATTTGTAGACAAGGATCTGCTGGAACCTGGCTGC  225

Query  445  TCGGTCCTGCTCAACCACAAGGTGCATGCCGTGATAGGGGTGCTGATGGATGACACGGATCCCCTGGTCACAGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  226  TCGGTCCTGCTCAACCACAAGGTGCATGCCGTGATAGGGGTGCTGATGGATGACACGGATCCCCTGGTCACAGT  299

Query  519  GATGAAGGTAGAAAAGGCCCCCCAGGAGACCTATGCAGATATTGGGGGGTTGGACAACCAAATTCAGGAAATTA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  300  GATGAAGGTAGAAAAGGCCCCCCAGGAGACCTATGCAGATATTGGGGGGTTGGACAACCAAATTCAGGAAATTA  373

Query  593  AGGAATCTGTGGAGCTTCCTCTCACCCATCCTGAATATTATGAAGAGATGGGTATAAAGCCTCCTAAGGGGGTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  374  AGGAATCTGTGGAGCTTCCTCTCACCCATCCTGAATATTATGAAGAGATGGGTATAAAGCCTCCTAAGGGGGTC  447

Query  667  ATTCTCTATGGTCCACCTGGCACAGGTAAAACCTTGTTAGCCAAAGCAGTAGCAAACCAAACCTCAGCCACTTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  448  ATTCTCTATGGTCCACCTGGCACAGGTAAAACCTTGTTAGCCAAAGCAGTAGCAAACCAAACCTCAGCCACTTT  521

Query  741  CTTGAGAGTGGTTGGCTCTGAACTTATTCAGAAGTACCTAGGTGATGGGCCCAAACTCGTACGGGAATTGTTCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  522  CTTGAGAGTGGTTGGCTCTGAACTTATTCAGAAGTACCTAGGTGATGGGCCCAAACTCGTACGGGAATTGTTCC  595

Query  815  GAGTTGCTGAAGAACATGCACCGTCCATCGTGTTTATTGATGAAATTGACGCCATTGGGACAAAAAGATATGAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  596  GAGTTGCTGAAGAACATGCACCGTCCATCGTGTTTATTGATGAAATTGACGCCATTGGGACAAAAAGATATGAC  669

Query  889  TCCAATTCTGGTGGTGAGAGAGAAATTCAGCGAACAATGTTGGAACTGCTGAACCAGTTGGATGGATTTGATTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  670  TCCAATTCTGGTGGTGAGAGAGAAATTCAGCGAACAATGTTGGAACTGCTGAACCAGTTGGATGGATTTGATTC  743

Query  963  TAGGGGAGATGTGAAAGTTATCATGGCCACAAACCGAATAGAAACTTTGGATCCAGCACTTATCAGACCAGGCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  744  TAGGGGAGATGTGAAAGTTATCATGGCCACAAACCGAATAGAAACTTTGGATCCAGCACTTATCAGACCAGGCC  817

Query 1037  GCATTGACAGGAAGATTGAGTTCCCCCTGCCTGATGAAAAGACGAAGAAGCGCATATTTCAGATTCACACAAGC  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  818  GCATTGACAGGAAGATTGAGTTCCCCCTGCCTGATGAAAAGACGAAGAAGCGCATCTTTCAGATTCACACAAGC  891

Query 1111  AGGATGACGCTGGCTGATGATGTAACCCTGGACGACCTGATCATGGCTAAAGATGACCTCTCTGGTGCTGACAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  892  AGGATGACGCTGGCTGATGATGTAACCCTGGACGACCTGATCATGGCTAAAGATGACCTCTCTGGTGCTGACAT  965

Query 1185  CAAGGCAATCTGTACAGAAGCTGGTCTGATGGCCTTAAGAGAACGTAGAATGAAAGTAACAAATGAAGACTTCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  966  CAAGGCAATCTGTACAGAAGCTGGTCTGATGGCCTTAAGAGAACGTAGAATGAAAGTAACAAATGAAGACTTCA  1039

Query 1259  AAAAATCTAAAGAAAATGTTCTTTATAAGAAACAGGAAGGCACCCCTGAGGGGCTGTATCTC  1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1040  AAAAATCTAAAGAAAATGTTCTTTATAAGAAACAGGAAGGCACCCCTGAGGGGCTGTATCTC  1101