Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470496
• Subject: NM_001163397.1
• Aligned Length: 1113
• Identities: 989
• Gaps: 60

Alignment

Query    1  ATGGTTAT---------------GATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGTGTCAAATGGTCCGACATCCAATAC  59
                  ||               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ------ATGAGGCTCCAGAACCAGATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGTGTCAAATGGACCGACATCCAATAC  68

Query   60  AAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAAACAGGGGCAACCACAGATGACAGCA  133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||..|||||||||||||||
Sbjct   69  AAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAGACAGGCGCCGCCACAGATGACAGCA  142

Query  134  AAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAAGAATTCAGGAGTCTCTTCGGGAGCATT  207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  143  AAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAGGAATTCAGGAGTCTCTTTGGGAGCATT  216

Query  208  GGTGAAATAGAATCCTGCAAACTTGTGAGAGACAAAATTACAGGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTA  281
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  217  GGTGAAATAGAATCCTGCAAACTCGTGAGAGACAAAATCACAGGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTA  290

Query  282  TATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGG  355
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  291  TATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGG  364

Query  356  TCTCATATGCCCGTCCGAGCTCAGCCTCAATCAGGGATGCTAACCTCTATGTTAGCGGCCTTCCCAAAACCATG  429
            |.||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  365  TGTCCTACGCCCGCCCAAGCTCGGCCTCGATCAGGGATGCTAACCTGTATGTTAGTGGCCTTCCCAAGACCATG  438

Query  430  ACCCAGAAGGAACTGGAGCAACTTTTCTCGCAATACGGCCGTATCATCACCTCACGAATCCTGGTTGGTCAAGT  503
            |||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||.||||||
Sbjct  439  ACCCAGAAGGAGCTGGAGCAGCTTTTCTCTCAATACGGTCGCATCATCACCTCACGCATCCTGGTTGATCAAGT  512

Query  504  CACAGGAGTGTCCAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGGC  577
            ||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  513  CACAGGGGTCTCTAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGAC  586

Query  578  TGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACGGAACCGATTACTGTGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCC  651
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  587  TGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACAGAACCGATTACTGTGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCC  660

Query  652  AGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTCTACCAGTCCCCTAACCGGCGCTACCCAGGTCCACTTCACCACCAGGCTCA  725
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||
Sbjct  661  AGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTGTACCAGTCCCCCAACAGGCGATACCCTGGCCCTCTCCACCACCAGGCTCA  734

Query  726  GAGGTTCAGGCTGGACAATTTGCTTAATATGGCCTATGGCGTAAAGAGGTTCTCCCCAATTACCATTGATGGAA  799
            .||.|||                                       ||||||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct  735  AAGATTC---------------------------------------AGGTTCTCCCCAATCACCATTGACGGGA  769

Query  800  TGACAAGCCTTGTGGGAATGAACATCCCTGGTCACACAGGAACTGGGTGGTGCATCTTTGTCTACAACCTGTCC  873
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  770  TGACAAGTCTTGTGGGAATGAACATCCCTGGTCACACAGGGACAGGCTGGTGCATCTTCGTCTATAACCTGTCC  843

Query  874  CCCGATTCCGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGGAGCAGTGAACAACGTAAAGGTGATTCG  947
            ||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct  844  CCTGATTCTGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGGCGCAGTGAACAACGTCAAGGTCATCCG  917

Query  948  TGACTTCAACACCAACAAGTGCAAGGGATTCGGCTTTGTCACCATGACCAACTATGATGAGGCGGCCATGGCCA  1021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  918  TGACTTCAACACCAACAAGTGCAAGGGATTCGGCTTCGTCACCATGACCAACTACGATGAGGCAGCCATGGCCA  991

Query 1022  TCACCAGCCTCAACGGGTACCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAG  1095
            ||.||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  992  TCGCCAGCCTCAATGGCTATCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAA  1065

Query 1096  TCC  1098
            |||
Sbjct 1066  TCC  1068