Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470496
• Subject: NM_001163399.1
• Aligned Length: 1113
• Identities: 1033
• Gaps: 15

Alignment

Query    1  ----------ATGGTT-----ATGATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGTGTCAAATGGTCCGACATCCAATAC  59
                      ||||.|     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGTGGAATGGCTTGAAGATGATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGTGTCAAATGGACCGACATCCAATAC  74

Query   60  AAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAAACAGGGGCAACCACAGATGACAGCA  133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||..|||||||||||||||
Sbjct   75  AAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAGACAGGCGCCGCCACAGATGACAGCA  148

Query  134  AAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAAGAATTCAGGAGTCTCTTCGGGAGCATT  207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  AAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAGGAATTCAGGAGTCTCTTTGGGAGCATT  222

Query  208  GGTGAAATAGAATCCTGCAAACTTGTGAGAGACAAAATTACAGGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTA  281
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGTGAAATAGAATCCTGCAAACTCGTGAGAGACAAAATCACAGGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTA  296

Query  282  TATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGG  355
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGG  370

Query  356  TCTCATATGCCCGTCCGAGCTCAGCCTCAATCAGGGATGCTAACCTCTATGTTAGCGGCCTTCCCAAAACCATG  429
            |.||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  371  TGTCCTACGCCCGCCCAAGCTCGGCCTCGATCAGGGATGCTAACCTGTATGTTAGTGGCCTTCCCAAGACCATG  444

Query  430  ACCCAGAAGGAACTGGAGCAACTTTTCTCGCAATACGGCCGTATCATCACCTCACGAATCCTGGTTGGTCAAGT  503
            |||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||.||||||
Sbjct  445  ACCCAGAAGGAGCTGGAGCAGCTTTTCTCTCAATACGGTCGCATCATCACCTCACGCATCCTGGTTGATCAAGT  518

Query  504  CACAGGAGTGTCCAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGGC  577
            ||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  CACAGGGGTCTCTAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGAC  592

Query  578  TGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACGGAACCGATTACTGTGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCC  651
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACAGAACCGATTACTGTGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCC  666

Query  652  AGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTCTACCAGTCCCCTAACCGGCGCTACCCAGGTCCACTTCACCACCAGGCTCA  725
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||
Sbjct  667  AGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTGTACCAGTCCCCCAACAGGCGATACCCTGGCCCTCTCCACCACCAGGCTCA  740

Query  726  GAGGTTCAGGCTGGACAATTTGCTTAATATGGCCTATGGCGTAAAGAGGTTCTCCCCAATTACCATTGATGGAA  799
            .||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct  741  AAGATTCAGGCTGGACAATTTGCTTAATATGGCCTATGGCGTAAAGAGGTTCTCCCCAATCACCATTGACGGGA  814

Query  800  TGACAAGCCTTGTGGGAATGAACATCCCTGGTCACACAGGAACTGGGTGGTGCATCTTTGTCTACAACCTGTCC  873
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  815  TGACAAGTCTTGTGGGAATGAACATCCCTGGTCACACAGGGACAGGCTGGTGCATCTTCGTCTATAACCTGTCC  888

Query  874  CCCGATTCCGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGGAGCAGTGAACAACGTAAAGGTGATTCG  947
            ||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct  889  CCTGATTCTGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGGCGCAGTGAACAACGTCAAGGTCATCCG  962

Query  948  TGACTTCAACACCAACAAGTGCAAGGGATTCGGCTTTGTCACCATGACCAACTATGATGAGGCGGCCATGGCCA  1021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  963  TGACTTCAACACCAACAAGTGCAAGGGATTCGGCTTCGTCACCATGACCAACTACGATGAGGCAGCCATGGCCA  1036

Query 1022  TCACCAGCCTCAACGGGTACCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAG  1095
            ||.||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037  TCGCCAGCCTCAATGGCTATCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAA  1110

Query 1096  TCC  1098
            |||
Sbjct 1111  TCC  1113