Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470496
• Subject: NM_001324215.2
• Aligned Length: 1113
• Identities: 1054
• Gaps: 54

Alignment

Query    1  ----------ATGGTT-----ATGATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGTGTCAAATGGTCCGACATCCAATAC  59
                      ||||.|     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGTGGAATGGCTTGAAGATGATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGTGTCAAATGGTCCGACATCCAATAC  74

Query   60  AAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAAACAGGGGCAACCACAGATGACAGCA  133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAAACAGGGGCAACCACAGATGACAGCA  148

Query  134  AAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAAGAATTCAGGAGTCTCTTCGGGAGCATT  207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAAGAATTCAGGAGTCTCTTCGGGAGCATT  222

Query  208  GGTGAAATAGAATCCTGCAAACTTGTGAGAGACAAAATTACAGGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTA  281
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGTGAAATAGAATCCTGCAAACTTGTGAGAGACAAAATTACAGGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTA  296

Query  282  TATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGG  355
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGG  370

Query  356  TCTCATATGCCCGTCCGAGCTCAGCCTCAATCAGGGATGCTAACCTCTATGTTAGCGGCCTTCCCAAAACCATG  429
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCTCATATGCCCGTCCGAGCTCTGCCTCAATCAGGGATGCTAACCTCTATGTTAGCGGCCTTCCCAAAACCATG  444

Query  430  ACCCAGAAGGAACTGGAGCAACTTTTCTCGCAATACGGCCGTATCATCACCTCACGAATCCTGGTTGGTCAAGT  503
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  445  ACCCAGAAGGAACTGGAGCAACTTTTCTCGCAATACGGCCGTATCATCACCTCACGAATCCTGGTTGATCAAGT  518

Query  504  CACAGGAGTGTCCAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGGC  577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACAGGAGTGTCCAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGGC  592

Query  578  TGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACGGAACCGATTACTGTGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCC  651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACGGAACCGATTACTGTGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCC  666

Query  652  AGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTCTACCAGTCCCCTAACCGGCGCTACCCAGGTCCACTTCACCACCAGGCTCA  725
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTCTACCAGTCCCCCAACCGGCGCTACCCAGGTCCACTTCACCACCAGGCTCA  740

Query  726  GAGGTTCAGGCTGGACAATTTGCTTAATATGGCCTATGGCGTAAAGAGGTTCTCCCCAATTACCATTGATGGAA  799
            |||||||                                       ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAGGTTC---------------------------------------AGGTTCTCCCCAATTACCATTGATGGAA  775

Query  800  TGACAAGCCTTGTGGGAATGAACATCCCTGGTCACACAGGAACTGGGTGGTGCATCTTTGTCTACAACCTGTCC  873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  776  TGACAAGCCTTGTGGGAATGAACATCCCTGGTCACACAGGAACTGGGTGGTGCATCTTTGTCTACAACCTGTCC  849

Query  874  CCCGATTCCGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGGAGCAGTGAACAACGTAAAGGTGATTCG  947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  850  CCCGATTCCGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGGAGCAGTGAACAACGTAAAGGTGATTCG  923

Query  948  TGACTTCAACACCAACAAGTGCAAGGGATTCGGCTTTGTCACCATGACCAACTATGATGAGGCGGCCATGGCCA  1021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  924  TGACTTCAACACCAACAAGTGCAAGGGATTCGGCTTTGTCACCATGACCAACTATGATGAGGCGGCCATGGCCA  997

Query 1022  TCACCAGCCTCAACGGGTACCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAG  1095
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  998  TCGCCAGCCTCAACGGGTACCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAG  1071

Query 1096  TCC  1098
            |||
Sbjct 1072  TCC  1074