Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470496
• Subject: XM_006502794.3
• Aligned Length: 1187
• Identities: 1029
• Gaps: 91

Alignment

Query    1  -----------------------------------------------ATGGTTATGATAATTAGCACCATGGAG  27
                                                           |||  ...|||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTGGACGTTCAGAGCTTCAATATTGTCCAGCCAAGAAAAACAAAAATG--CCAGATAATTAGCACCATGGAG  72

Query   28  CCTCAGGTGTCAAATGGTCCGACATCCAATACAAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCC  101
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   73  CCTCAGGTGTCAAATGGACCGACATCCAATACAAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCC  146

Query  102  CATGCAAACAGGGGCAACCACAGATGACAGCAAAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATATGACCC  175
            ||||||.|||||.||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  147  CATGCAGACAGGCGCCGCCACAGATGACAGCAAAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATATGACCC  220

Query  176  AAGAAGAATTCAGGAGTCTCTTCGGGAGCATTGGTGAAATAGAATCCTGCAAACTTGTGAGAGACAAAATTACA  249
            ||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  221  AAGAGGAATTCAGGAGTCTCTTTGGGAGCATTGGTGAAATAGAATCCTGCAAACTCGTGAGAGACAAAATCACA  294

Query  250  GGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTATATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAA  323
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  GGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTATATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAA  368

Query  324  TGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGGTCTCATATGCCCGTCCGAGCTCAGCCTCAATCAGGGATGCTA  397
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  369  TGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGGTGTCCTACGCCCGCCCAAGCTCGGCCTCGATCAGGGATGCTA  442

Query  398  ACCTCTATGTTAGCGGCCTTCCCAAAACCATGACCCAGAAGGAACTGGAGCAACTTTTCTCGCAATACGGCCGT  471
            ||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.
Sbjct  443  ACCTGTATGTTAGTGGCCTTCCCAAGACCATGACCCAGAAGGAGCTGGAGCAGCTTTTCTCTCAATACGGTCGC  516

Query  472  ATCATCACCTCACGAATCCTGGTTGGTCAAGTCACAGGAGTGTCCAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAA  545
            ||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  ATCATCACCTCACGCATCCTGGTTGATCAAGTCACAGGGGTCTCTAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAA  590

Query  546  GAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGGCTGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACGGAACCGATTACTG  619
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  591  GAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGACTGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACAGAACCGATTACTG  664

Query  620  TGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCCAGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTCTACCAGTCCCCTAACCGG  693
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.||
Sbjct  665  TGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCCAGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTGTACCAGTCCCCCAACAGG  738

Query  694  CGCTACCCAGGTCCACTTCACCACCAGGCTCAGAGGTTCAGGCTGGACAATTTGCTTAATATGGCCTATGGCGT  767
            ||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  CGATACCCTGGCCCTCTCCACCACCAGGCTCAAAGATTCAGGCTGGACAATTTGCTTAATATGGCCTATGGCGT  812

Query  768  AAAG------------------------------------------AGGTTCTCCCCAATTACCATTGATGGAA  799
            ||||                                          ||||||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct  813  AAAGAGACTGATGTCTGGACCAGTCCCCCCTTCTGCTTGTCCCCCCAGGTTCTCCCCAATCACCATTGACGGGA  886

Query  800  TGACAAGCCTTGTGGGAATGAACATCCCTGGTCACACAGGAACTGGGTGGTGCATCTTTGTCTACAACCTGTCC  873
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  887  TGACAAGTCTTGTGGGAATGAACATCCCTGGTCACACAGGGACAGGCTGGTGCATCTTCGTCTATAACCTGTCC  960

Query  874  CCCGATTCCGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGGAGCAGTGAACAACGTAAAGGTGATTCG  947
            ||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct  961  CCTGATTCTGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGGCGCAGTGAACAACGTCAAGGTCATCCG  1034

Query  948  TGACTTCAACACCAACAAGTGCAAGGGATTCGGCTTTGTCACCATGACCAACTATGATGAGGCGGCCATGGCCA  1021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1035  TGACTTCAACACCAACAAGTGCAAGGGATTCGGCTTCGTCACCATGACCAACTACGATGAGGCAGCCATGGCCA  1108

Query 1022  TCACCAGCCTCAACGGGTACCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAG  1095
            ||.||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1109  TCGCCAGCCTCAATGGCTATCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAA  1182

Query 1096  TCC  1098
            |||
Sbjct 1183  TCC  1185