Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470496
• Subject: XM_006502795.2
• Aligned Length: 1179
• Identities: 1033
• Gaps: 81

Alignment

Query    1  -------------------------ATG----GTTAT----------GATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGT  35
                                     |||    .||||          |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTTGAAATCAGCAGGACGCTTAATGCTGCTTTATTAAATAATGAGATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGT  74

Query   36  GTCAAATGGTCCGACATCCAATACAAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAAA  109
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  GTCAAATGGACCGACATCCAATACAAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAGA  148

Query  110  CAGGGGCAACCACAGATGACAGCAAAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAAGAA  183
            ||||.||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  CAGGCGCCGCCACAGATGACAGCAAAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAGGAA  222

Query  184  TTCAGGAGTCTCTTCGGGAGCATTGGTGAAATAGAATCCTGCAAACTTGTGAGAGACAAAATTACAGGACAGAG  257
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  TTCAGGAGTCTCTTTGGGAGCATTGGTGAAATAGAATCCTGCAAACTCGTGAGAGACAAAATCACAGGACAGAG  296

Query  258  TTTAGGGTATGGATTTGTTAACTATATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCA  331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTTAGGGTATGGATTTGTTAACTATATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCA  370

Query  332  GACTCCAGACCAAAACCATAAAGGTCTCATATGCCCGTCCGAGCTCAGCCTCAATCAGGGATGCTAACCTCTAT  405
            |||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  GACTCCAGACCAAAACCATAAAGGTGTCCTACGCCCGCCCAAGCTCGGCCTCGATCAGGGATGCTAACCTGTAT  444

Query  406  GTTAGCGGCCTTCCCAAAACCATGACCCAGAAGGAACTGGAGCAACTTTTCTCGCAATACGGCCGTATCATCAC  479
            |||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct  445  GTTAGTGGCCTTCCCAAGACCATGACCCAGAAGGAGCTGGAGCAGCTTTTCTCTCAATACGGTCGCATCATCAC  518

Query  480  CTCACGAATCCTGGTTGGTCAAGTCACAGGAGTGTCCAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTG  553
            ||||||.||||||||||.||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTCACGCATCCTGGTTGATCAAGTCACAGGGGTCTCTAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTG  592

Query  554  AGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGGCTGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACGGAACCGATTACTGTGAAGTTT  627
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGACTGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACAGAACCGATTACTGTGAAGTTT  666

Query  628  GCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCCAGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTCTACCAGTCCCCTAACCGGCGCTACCC  701
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.||||.|||||
Sbjct  667  GCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCCAGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTGTACCAGTCCCCCAACAGGCGATACCC  740

Query  702  AGGTCCACTTCACCACCAGGCTCAGAGGTTCAGGCTGGACAATTTGCTTAATATGGCCTATGGCGTAAAG----  771
            .||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct  741  TGGCCCTCTCCACCACCAGGCTCAAAGATTCAGGCTGGACAATTTGCTTAATATGGCCTATGGCGTAAAGAGAC  814

Query  772  --------------------------------------AGGTTCTCCCCAATTACCATTGATGGAATGACAAGC  807
                                                  ||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.
Sbjct  815  TGATGTCTGGACCAGTCCCCCCTTCTGCTTGTCCCCCCAGGTTCTCCCCAATCACCATTGACGGGATGACAAGT  888

Query  808  CTTGTGGGAATGAACATCCCTGGTCACACAGGAACTGGGTGGTGCATCTTTGTCTACAACCTGTCCCCCGATTC  881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  889  CTTGTGGGAATGAACATCCCTGGTCACACAGGGACAGGCTGGTGCATCTTCGTCTATAACCTGTCCCCTGATTC  962

Query  882  CGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGGAGCAGTGAACAACGTAAAGGTGATTCGTGACTTCA  955
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct  963  TGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGGCGCAGTGAACAACGTCAAGGTCATCCGTGACTTCA  1036

Query  956  ACACCAACAAGTGCAAGGGATTCGGCTTTGTCACCATGACCAACTATGATGAGGCGGCCATGGCCATCACCAGC  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||
Sbjct 1037  ACACCAACAAGTGCAAGGGATTCGGCTTCGTCACCATGACCAACTACGATGAGGCAGCCATGGCCATCGCCAGC  1110

Query 1030  CTCAACGGGTACCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAGTCC  1098
            |||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1111  CTCAATGGCTATCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAATCC  1179