Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470496
• Subject: XM_006502797.3
• Aligned Length: 1172
• Identities: 1011
• Gaps: 94

Alignment

Query    1  -----------------------------------------------------ATGGTTATGATAATTAGCACC  21
                                                                 ||  |||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGATTACTTCTTTTAAGGGAAATTGTTATTAATGAGTCAAGAAACTGCTCAT--TTATGATAATTAGCACC  72

Query   22  ATGGAGCCTCAGGTGTCAAATGGTCCGACATCCAATACAAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCC  95
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   73  ATGGAGCCTCAGGTGTCAAATGGACCGACATCCAATACAAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCC  146

Query   96  TTCTCCCATGCAAACAGGGGCAACCACAGATGACAGCAAAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATA  169
            ||||||||||||.|||||.||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  147  TTCTCCCATGCAGACAGGCGCCGCCACAGATGACAGCAAAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATA  220

Query  170  TGACCCAAGAAGAATTCAGGAGTCTCTTCGGGAGCATTGGTGAAATAGAATCCTGCAAACTTGTGAGAGACAAA  243
            ||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  221  TGACCCAAGAGGAATTCAGGAGTCTCTTTGGGAGCATTGGTGAAATAGAATCCTGCAAACTCGTGAGAGACAAA  294

Query  244  ATTACAGGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTATATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACAC  317
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  ATCACAGGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTATATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACAC  368

Query  318  TTTAAATGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGGTCTCATATGCCCGTCCGAGCTCAGCCTCAATCAGGG  391
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct  369  TTTAAATGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGGTGTCCTACGCCCGCCCAAGCTCGGCCTCGATCAGGG  442

Query  392  ATGCTAACCTCTATGTTAGCGGCCTTCCCAAAACCATGACCCAGAAGGAACTGGAGCAACTTTTCTCGCAATAC  465
            ||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  443  ATGCTAACCTGTATGTTAGTGGCCTTCCCAAGACCATGACCCAGAAGGAGCTGGAGCAGCTTTTCTCTCAATAC  516

Query  466  GGCCGTATCATCACCTCACGAATCCTGGTTGGTCAAGTCACAGGAGTGTCCAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTT  539
            ||.||.||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  GGTCGCATCATCACCTCACGCATCCTGGTTGATCAAGTCACAGGGGTCTCTAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTT  590

Query  540  TGATAAGAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGGCTGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACGGAACCGA  613
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  591  TGATAAGAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGACTGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACAGAACCGA  664

Query  614  TTACTGTGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCCAGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTCTACCAGTCCCCT  687
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  665  TTACTGTGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCCAGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTGTACCAGTCCCCC  738

Query  688  AACCGGCGCTACCCAGGTCCACTTCACCACCAGGCTCAGAGGTTCA-------GGCTGGACAA---------TT  745
            |||.||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.||.||||       |.||||||.|         |.
Sbjct  739  AACAGGCGATACCCTGGCCCTCTCCACCACCAGGCTCAAAGATTCAGACTGATGTCTGGACCAGTCCCCCCTTC  812

Query  746  TGCTTAATATGG-----CCTATGGCGTAAAGAGGTTCTCCCCAATTACCATTGATGGAATGACAAGCCTTGTGG  814
            |||||      |     ||            ||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct  813  TGCTT------GTCCCCCC------------AGGTTCTCCCCAATCACCATTGACGGGATGACAAGTCTTGTGG  868

Query  815  GAATGAACATCCCTGGTCACACAGGAACTGGGTGGTGCATCTTTGTCTACAACCTGTCCCCCGATTCCGATGAG  888
            |||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  869  GAATGAACATCCCTGGTCACACAGGGACAGGCTGGTGCATCTTCGTCTATAACCTGTCCCCTGATTCTGATGAG  942

Query  889  AGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGGAGCAGTGAACAACGTAAAGGTGATTCGTGACTTCAACACCAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  943  AGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGGCGCAGTGAACAACGTCAAGGTCATCCGTGACTTCAACACCAA  1016

Query  963  CAAGTGCAAGGGATTCGGCTTTGTCACCATGACCAACTATGATGAGGCGGCCATGGCCATCACCAGCCTCAACG  1036
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||||||||||.|
Sbjct 1017  CAAGTGCAAGGGATTCGGCTTCGTCACCATGACCAACTACGATGAGGCAGCCATGGCCATCGCCAGCCTCAATG  1090

Query 1037  GGTACCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAGTCC  1098
            |.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1091  GCTATCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAATCC  1152