Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470496
• Subject: XM_006502803.3
• Aligned Length: 1151
• Identities: 993
• Gaps: 94

Alignment

Query    1  -----------------------------------------------------ATGGTTATGATAATTAGCACC  21
                                                                 ||  |||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGATTACTTCTTTTAAGGGAAATTGTTATTAATGAGTCAAGAAACTGCTCAT--TTATGATAATTAGCACC  72

Query   22  ATGGAGCCTCAGGTGTCAAATGGTCCGACATCCAATACAAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCC  95
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   73  ATGGAGCCTCAGGTGTCAAATGGACCGACATCCAATACAAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCC  146

Query   96  TTCTCCCATGCAAACAGGGGCAACCACAGATGACAGCAAAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATA  169
            ||||||||||||.|||||.||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  147  TTCTCCCATGCAGACAGGCGCCGCCACAGATGACAGCAAAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATA  220

Query  170  TGACCCAAGAAGAATTCAGGAGTCTCTTCGGGAGCATTGGTGAAATAGAATCCTGCAAACTTGTGAGAGACAAA  243
            ||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  221  TGACCCAAGAGGAATTCAGGAGTCTCTTTGGGAGCATTGGTGAAATAGAATCCTGCAAACTCGTGAGAGACAAA  294

Query  244  ATTACAGGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTATATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACAC  317
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  ATCACAGGACAGAGTTTAGGGTATGGATTTGTTAACTATATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACAC  368

Query  318  TTTAAATGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGGTCTCATATGCCCGTCCGAGCTCAGCCTCAATCAGGG  391
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct  369  TTTAAATGGACTCAGACTCCAGACCAAAACCATAAAGGTGTCCTACGCCCGCCCAAGCTCGGCCTCGATCAGGG  442

Query  392  ATGCTAACCTCTATGTTAGCGGCCTTCCCAAAACCATGACCCAGAAGGAACTGGAGCAACTTTTCTCGCAATAC  465
            ||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  443  ATGCTAACCTGTATGTTAGTGGCCTTCCCAAGACCATGACCCAGAAGGAGCTGGAGCAGCTTTTCTCTCAATAC  516

Query  466  GGCCGTATCATCACCTCACGAATCCTGGTTGGTCAAGTCACAGGAGTGTCCAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTT  539
            ||.||.||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  GGTCGCATCATCACCTCACGCATCCTGGTTGATCAAGTCACAGGGGTCTCTAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTT  590

Query  540  TGATAAGAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGGCTGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACGGAACCGA  613
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  591  TGATAAGAGGATTGAGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGACTGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACAGAACCGA  664

Query  614  TTACTGTGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCCAGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTCTACCAGTCCCCT  687
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  665  TTACTGTGAAGTTTGCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCCAGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTGTACCAGTCCCCC  738

Query  688  AACCGGCGCTACCCAGGTCCACTTCACCACCAGGCTCAGAGGTTCAGGCTGGACAATTTGCTTAATATGGCCTA  761
            |||.||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||                             
Sbjct  739  AACAGGCGATACCCTGGCCCTCTCCACCACCAGGCTCAAAGATTC-----------------------------  783

Query  762  TGGCGTAAAGAGGTTCTCCCCAATTACCATTGATGGAATGACAAGCCTTGTGGGAATGAACATCCCTGGTCACA  835
                      ||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  784  ----------AGGTTCTCCCCAATCACCATTGACGGGATGACAAGTCTTGTGGGAATGAACATCCCTGGTCACA  847

Query  836  CAGGAACTGGGTGGTGCATCTTTGTCTACAACCTGTCCCCCGATTCCGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCTCTTT  909
            ||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  848  CAGGGACAGGCTGGTGCATCTTCGTCTATAACCTGTCCCCTGATTCTGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCTCTTT  921

Query  910  GGCCCCTTTGGAGCAGTGAACAACGTAAAGGTGATTCGTGACTTCAACACCAACAAGTGCAAGGGATTCGGCTT  983
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  922  GGCCCCTTTGGCGCAGTGAACAACGTCAAGGTCATCCGTGACTTCAACACCAACAAGTGCAAGGGATTCGGCTT  995

Query  984  TGTCACCATGACCAACTATGATGAGGCGGCCATGGCCATCACCAGCCTCAACGGGTACCGCCTGGGAGACAGAG  1057
            .|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct  996  CGTCACCATGACCAACTACGATGAGGCAGCCATGGCCATCGCCAGCCTCAATGGCTATCGCCTGGGAGACAGAG  1069

Query 1058  TGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAGTCC  1098
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1070  TGTTGCAAGTTTCCTTTAAAACCAACAAAGCCCACAAATCC  1110