Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470496
• Subject: XM_017000538.1
• Aligned Length: 1137
• Identities: 1093
• Gaps: 39

Alignment

Query    1  -------------------------ATG-------GTTA-------TGATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGT  35
                                     |||       ||||       .|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTTGAAATCAGCAGGACGCTTAATGCTGCTTTGTTAAATAATGAGATAATTAGCACCATGGAGCCTCAGGT  74

Query   36  GTCAAATGGTCCGACATCCAATACAAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAAA  109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTCAAATGGTCCGACATCCAATACAAGCAATGGACCCTCCAGCAACAACAGAAACTGTCCTTCTCCCATGCAAA  148

Query  110  CAGGGGCAACCACAGATGACAGCAAAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAAGAA  183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGGGGCAACCACAGATGACAGCAAAACCAACCTCATCGTCAACTATTTACCCCAGAATATGACCCAAGAAGAA  222

Query  184  TTCAGGAGTCTCTTCGGGAGCATTGGTGAAATAGAATCCTGCAAACTTGTGAGAGACAAAATTACAGGACAGAG  257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCAGGAGTCTCTTCGGGAGCATTGGTGAAATAGAATCCTGCAAACTTGTGAGAGACAAAATTACAGGACAGAG  296

Query  258  TTTAGGGTATGGATTTGTTAACTATATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCA  331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTTAGGGTATGGATTTGTTAACTATATTGATCCAAAGGATGCAGAGAAAGCCATCAACACTTTAAATGGACTCA  370

Query  332  GACTCCAGACCAAAACCATAAAGGTCTCATATGCCCGTCCGAGCTCAGCCTCAATCAGGGATGCTAACCTCTAT  405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GACTCCAGACCAAAACCATAAAGGTCTCATATGCCCGTCCGAGCTCTGCCTCAATCAGGGATGCTAACCTCTAT  444

Query  406  GTTAGCGGCCTTCCCAAAACCATGACCCAGAAGGAACTGGAGCAACTTTTCTCGCAATACGGCCGTATCATCAC  479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTTAGCGGCCTTCCCAAAACCATGACCCAGAAGGAACTGGAGCAACTTTTCTCGCAATACGGCCGTATCATCAC  518

Query  480  CTCACGAATCCTGGTTGGTCAAGTCACAGGAGTGTCCAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTG  553
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTCACGAATCCTGGTTGATCAAGTCACAGGAGTGTCCAGAGGGGTGGGATTCATCCGCTTTGATAAGAGGATTG  592

Query  554  AGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGGCTGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACGGAACCGATTACTGTGAAGTTT  627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGGCAGAAGAAGCCATCAAAGGGCTGAATGGCCAGAAGCCCAGCGGTGCTACGGAACCGATTACTGTGAAGTTT  666

Query  628  GCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCCAGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTCTACCAGTCCCCTAACCGGCGCTACCC  701
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  667  GCCAACAACCCCAGCCAGAAGTCCAGCCAGGCCCTGCTCTCCCAGCTCTACCAGTCCCCCAACCGGCGCTACCC  740

Query  702  AGGTCCACTTCACCACCAGGCTCAGAGGTTCAGGCTGGACAATTTGCTTAATATGGCCTATGGCGTAAAGAGGT  775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGTCCACTTCACCACCAGGCTCAGAGGTTCAGGCTGGACAATTTGCTTAATATGGCCTATGGCGTAAAGAGGT  814

Query  776  TCTCCCCAATTACCATTGATGGAATGACAAGCCTTGTGGGAATGAACATCCCTGGTCACACAGGAACTGGGTGG  849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCTCCCCAATTACCATTGATGGAATGACAAGCCTTGTGGGAATGAACATCCCTGGTCACACAGGAACTGGGTGG  888

Query  850  TGCATCTTTGTCTACAACCTGTCCCCCGATTCCGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGGAGC  923
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGCATCTTTGTCTACAACCTGTCCCCCGATTCCGATGAGAGTGTCCTCTGGCAGCTCTTTGGCCCCTTTGGAGC  962

Query  924  AGTGAACAACGTAAAGGTGATTCGTGACTTCAACACCAACAAGTGCAAGGGATTCGGCTTTGTCACCATGACCA  997
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGTGAACAACGTAAAGGTGATTCGTGACTTCAACACCAACAAGTGCAAGGGATTCGGCTTTGTCACCATGACCA  1036

Query  998  ACTATGATGAGGCGGCCATGGCCATCACCAGCCTCAACGGGTACCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTTTCC  1071
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACTATGATGAGGCGGCCATGGCCATCGCCAGCCTCAACGGGTACCGCCTGGGAGACAGAGTGTTGCAAGTTTCC  1110

Query 1072  TTTAAAACCAACAAAGCCCACAAGTCC  1098
            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTTAAAACCAACAAAGCCCACAAGTCC  1137