Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470553
- Subject:
- NM_172146.2
- Aligned Length:
- 1553
- Identities:
- 1335
- Gaps:
- 4
Alignment
Query 1 ATGGAGCTGGAGGAGTTGGGGATCCGAGAGGAATGTGGCGTGTTCGGGTGCATCGCCTCAGGAGAGTGGCCCAC 74
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1 ATGGAGCTGGAGGAGTTGGGGATCCGCGAGGAATGTGGTGTGTTTGGGTGCATCGCTTCTGGAGACTGGCCCAC 74
Query 75 GCAGCTGGATGTACCGCATGTGATCACTCTGGGACTCGTGGGGCTGCAGCACCGGGGTCAGGAGAGTGCTGGTA 148
||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 75 GCAGCTAGATGTGCCGCATGTGATCACTCTGGGACTCGTGGGGCTACAGCACCGAGGTCAGGAGAGCGCTGGTA 148
Query 149 TTGTGACTAGTGATGGGAGTTCCGTGCCAACATTCAAATCACACAAGGGAATGGGTCTTGTAAATCACGTCTTT 222
|||||||.||||||||||||.|.|||||.|.|||||.....||.||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 149 TTGTGACCAGTGATGGGAGTGCAGTGCCTAAATTCAGGGTGCATAAGGGAATGGGTCTTGTAAACCATGTTTTT 222
Query 223 ACTGAAGACAATTTGAAAAAATTATATGTTTCAAATCTTGGAATTGGACACACCAGGTATGCCACCACAGGAAA 296
||.||||||||||||||.|||||.||||..|||||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 223 ACCGAAGACAATTTGAAGAAATTGTATGACTCAAACCTTGGAATCGGACATACGAGGTACGCCACCACGGGAAA 296
Query 297 ATGTGAACTAGAAAATTGTCAGCCCTTCGTTGTTGAAACACTTCATGGGAAGATAGCTGTGGCACATAATGGCG 370
.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 297 GTGTGAGCTGGAAAACTGCCAGCCATTCGTAGTTGAGACGCTTCACGGAAAAATAGCTGTGGCCCATAACGGGG 370
Query 371 AATTGGTAAATGCTGCTCGATTAAGGAAAAAGCTTCTGCGTCATGGTATTGGTCTGTCTACAAGT--TCTGATA 442
||.||||.||.||.|||||.||..||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|| ||.|| |||||||
Sbjct 371 AACTGGTGAACGCCGCTCGGTTGCGGAAGAAGCTTCTGCGGCAGGGTATTGGGCTTTC--CACGTCCTCTGATA 442
Query 443 GTGAAATGATTACCCAGTTACTGGCGTATACCCCTCCTCAGGAACAAGATGACACCCCAGACTGGGTAGCCAGG 516
||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||.|||||||..|.||||||||||||||.||.
Sbjct 443 GTGAAATGATTACCCAGTTACTCGCATACACCCCTCCTCAAGAAAAAGATGATGCTCCAGACTGGGTAGCAAGA 516
Query 517 ATTAAAAACTTGATGAAGGAAGCACCCACAGCATACTCCCTGCTTATAATGCACAGAGATGTTATTTATGCAGT 590
|||||.|||||.|||||.|||||.|||.||||||||||||||.|||||||||||||.||..|.|||||.||.||
Sbjct 517 ATTAAGAACTTAATGAAAGAAGCGCCCGCAGCATACTCCCTGGTTATAATGCACAGGGACTTCATTTACGCGGT 590
Query 591 ACGAGATCCTTATGGAAATCGTCCCTTATGCATTGGTCGTCTTATTCCAGTGTCTGATATAAATGACAAAGAGA 664
.||||||||.||||||||||||||..|.|||||.||.||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||||
Sbjct 591 GCGAGATCCATATGGAAATCGTCCTCTCTGCATCGGGCGTCTTATGCCAGTCTCTGATGTAAATGACAAAGAGA 664
Query 665 AAAAAACATCAGAAACAGAAGGATGGGTGGTGTCTTCAGAATCTTGTAGCTTCTTATCTATTGGTGCAAGATAT 738
|||||.|.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||
Sbjct 665 AAAAATCCTCAGAAACTGAAGGATGGGTGGTGTCCTCAGAGTCTTGCAGCTTTTTATCCATCGGTGCCAGATAT 738
Query 739 TACCGTGAAGTCTTGCCTGGAGAAATTGTGGAAATATCCAGACACAATGTCCAAACTCTTGATATTATATCAAG 812
|.||.|||||||...||.|||||||||||.||||||||||||||...|.||..||||||||||||.||..||||
Sbjct 739 TGCCATGAAGTCAAACCCGGAGAAATTGTAGAAATATCCAGACATGGTATCAGAACTCTTGATATAATTCCAAG 812
Query 813 GTCTGAAGGAAACCCAGTGGCTTTTTGTATCTTTGAATATGTTTATTTTGCAAGACCAGACAGTATGTTCGAAG 886
||||.|.|||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 813 GTCTAACGGAGACCCAGTGGCTTTTTGTATTTTTGAATATGTTTATTTTGCAAGACCAGATAGTATGTTTGAAG 886
Query 887 ACCAAATGGTTTATACAGTAAGATACCGTTGTGGCCAGCAGCTAGCGATTGAAGCACCTGTGGATGCAGATTTG 960
||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.|||
Sbjct 887 ACCAAATGGTTTATACAGTAAGGTACCGGTGTGGTCAGCAGCTGGCAATTGAAGCACCCGTGGAGGCGGACTTG 960
Query 961 GTTAGCACTGTTCCAGAATCTGCTACGCCTGCTGCTCTTGCTTACGCAGGAAAGTGTGGACTTCCATATGTGGA 1034
||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.|..||.|||..|||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 961 GTTAGCACAGTTCCAGAGTCTGCTACGCCTGCAGCGCTGGGATATGCAACAAAGTGTGGGCTGCCTTATGTGGA 1034
Query 1035 GGTGCTGTGTAAAAACCGGTATGTAGGGAGAACCTTCATTCAGCCAAACATGAGGTTAAGACAACTTGGTGTTG 1108
.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1035 AGTGCTGTGTAAGAACCGGTATGTAGGAAGAACCTTCATTCAACCAAACATGAGGTTAAGACAACTCGGTGTTG 1108
Query 1109 CAAAAAAATTTGGAGTATTGTCAGACAACTTTAAAGGCAAAAGAATTGTTCTTGTAGATGATTCAATTGTCAGA 1182
||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||.|||||.||.
Sbjct 1109 CAAAGAAGTTTGGCGTGTTGTCTGACAACTTTAAAGGCAAAAGAATCGTTCTCATAGATGATTCGATTGTGAGG 1182
Query 1183 GGCAATACCATCTCACCTATAATAAAACTGCTCAAAGAATCTGGTGCAAAAGAGGTACACATTCGAGTAGCTTC 1256
||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1183 GGCAATACTATCTCACCCATCATAAAACTCCTCAAAGAATCCGGTGCAAAAGAGGTGCACATTCGAGTCGCTTC 1256
Query 1257 ACCACCAATTAAATATCCATGCTTCATGGGAATAAACATTCCTACAAAAGAAGAGCTCATTGCCAATAAACCAG 1330
|||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1257 ACCACCAATAAAATATCCGTGCTTCATGGGAATAAACATTCCTACAAAAGAAGAGCTCATAGCCAATAAGCCAG 1330
Query 1331 AATTTGATCACCTTGCAGAATATCTAGGAGCAAACAGTGTTGTGTATCTGTCAGTAGAAGGACTGGTTTCATCT 1404
||||||||...||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1331 AATTTGATTGTCTTGCAGAGTACCTCGGAGCAAACAGCGTTGTGTATCTGTCAGTGGAAGGACTGGTTTCATCT 1404
Query 1405 GTACAAGAAGGGATAAAGTTTAAAAAACAGAAAGAGAAAAAGCACGATATTATGATCCAAGAAAATGGAAATGG 1478
||.|||.|||..|||||.|||||.||.|||||||.||||||.||.||||||...||.|||||||||||||||||
Sbjct 1405 GTGCAACAAGAAATAAAATTTAAGAAGCAGAAAGTGAAAAAACATGATATTGCAATTCAAGAAAATGGAAATGG 1478
Query 1479 TCTGGAATGTTTTGAAAAGAGTGGTCATTGTACAGCTTGTCTCACTGGAAAATATCCTGTAGAATTAGAATGG 1551
|.||||||.|||||||||||..||.||.|||||||||||.||||||||..|.||.|||||.||..|.||||||
Sbjct 1479 TTTGGAATATTTTGAAAAGACGGGACACTGTACAGCTTGCCTCACTGGGCAGTACCCTGTGGAGCTGGAATGG 1551