Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470628
• Subject: XM_006499457.3
• Aligned Length: 1320
• Identities: 989
• Gaps: 216

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAATGTTACACCTGCCTCCCGGATGGCCCAGGCAGCGCATGCCACACCACTACCCTTCCTGCCCTCGTGCG  74

Query    1  -------------ATGATGCATCCTTCACTGGATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGTTCTG  61
                         ||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct   75  CACACCCACCCTGATGATGCAGCCTTCGCTGGACATCAAACCGTTCATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGCTCTG  148

Query   62  CTGTTGGGCTCTTTCCAAATTTTAACACA---------------------------------------------  90
            |.||.||||||||||||||.|||||||||                                             
Sbjct  149  CCGTGGGGCTCTTTCCAAACTTTAACACACCATCTTTGTCCGTGGACTTGTGCCTGTTGGCTCTCAGAGCCCCT  222

Query   91  --------------------------------------------------------------------------  90
                                                                                      
Sbjct  223  ACGCATACAGGACTGAGGAAGAGACCAGGCCATCTAAAGGAGAAAAGAAGAGGCTTATTTGGGACCAATAAGTT  296

Query   91  -------ATGGATCCTGTGCAAAAAGCGGTTATTAACCATACATTTGGAGTATCCATTCCCCCAAAGAAGAAAC  157
                   |||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  297  CTGCCAGATGGACCCTGTGCAGAAAGCAGTCATTAACCACACATTTGGAGTCTCCATTCCCCCGAAGAAGAAAC  370

Query  158  AAGTTATTTCTTGTAATGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCAGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGT  231
            ||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGTTATTTCCTGTAACGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCGGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGT  444

Query  232  AAACATGCCAAGAAGGTCAAAGCACTAGACGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGC  305
            |||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAACATGCCAAGAAGGTCAAAGCTCTAGAGGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGC  518

Query  306  AAAGGCTAATCCCAGCTGCTCCATCACTCCAATCACAGGCAACAACTCTGACAAATCAGAAGATAAAGGGAAGT  379
            ||||||||||||||||||||||||||..|||..|||||||.|||.||||||||||||||||||.|||||||||.
Sbjct  519  AAAGGCTAATCCCAGCTGCTCCATCAGGCCAGGCACAGGCGACAGCTCTGACAAATCAGAAGACAAAGGGAAGA  592

Query  380  TAAAAGCCAGCAGTTCCAGTCAGCCATCAAGCTCTGAAAGTGGCTCATTTATCCTCAAATCTGGCACAACACCC  453
            |||||||||.|||||||||||||||.|||.||||.|||.|.|||||.|||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAAAAGCCACCAGTTCCAGTCAGCCCTCAGGCTCCGAAGGAGGCTCCTTTCTCCTCAAATCTGGCACAACACCC  666

Query  454  CTGCCACCTGGAGCAGCCACTTCTCCCTCCAAGAGCACAAATGGAGCTCCCGGTACTGTTGTTGAATCAGAAGA  527
            |||||||.||||||...|.||||||||||||||||||||||.||.|||||.||..||||||.|||.||||||||
Sbjct  667  CTGCCACTTGGAGCCATCGCTTCTCCCTCCAAGAGCACAAACGGCGCTCCAGGGTCTGTTGCTGAGTCAGAAGA  740

Query  528  AGAAAAAGCCAAAAAATTACTTTATTGTTCACTATGCAAAGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTAGAGGCAC  601
            |||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  741  AGAAAAAGCCAAAAAATTACTCTACTGCTCACTATGCAAGGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTGGAGGCTC  814

Query  602  ACAACACAGGATCTAAACACAAGACCATGGTTGAAGCTCGTAATGGGGCTGGTCCAATTAAATCCTATCCTAGA  675
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  815  ACAACACAGGATCTAAACACAAGACCATGGTTGAGGCTCGTAATGGAGCTGGTCCAATTAAGTCCTATCCAAGA  888

Query  676  CCTGGATCAAGATTAAAGATGCAGAATGGCAGTAAGGGGTCAGGACTACAGAACAAGACATTTCATTGTGAAAT  749
            |||||.||||||||||||.|||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|..|||||||||||.||
Sbjct  889  CCTGGGTCAAGATTAAAGGTGCAGAACGGCAGTAAGGGCTCAGGACTACAGAACAAAATGTTTCATTGTGAGAT  962

Query  750  CTGTGATGTTCATGTTAATTCAGAAATTCAACTCAAACAGCACATTTCTAGCCGAAGGCATAAAGATCGAGTTG  823
            ||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct  963  CTGTGATGTTCACGTGAACTCAGAGATTCAACTCAAACAGCACATTTCAAGCCGAAGGCATAAAGACCGCGTGG  1036

Query  824  CAGGGAAACCACTGAAGCCAAAATACAGCCCTTACAACAAACTCCAGCGGAGCCCGAGTATTCTAGCAGCAAAA  897
            ||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||..||||.|||||.
Sbjct 1037  CAGGAAAACCGCTGAAGCCGAAATACAGCCCCTACAACAAGCTGCAGCGGAGCCCAAGCATCTTAGCTGCAAAG  1110

Query  898  CTTGCATTCCAGAAAGATATGATGAAGCCTTTGGCCCCAGCCTTCCTGTCCTCACCTCTCGCAGCGGCGGCAGC  971
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||..|.||||||||.|||||.||   .|||||.|||||
Sbjct 1111  CTTGCATTCCAGAAAGATCTGATGAAGCCTCTGGCCCCTACGTTCCTGTCTTCACCCCT---GGCGGCCGCAGC  1181

Query  972  CGTGTCCTCAGCGCTGTCACTCCCACCCCGGCCCTCTGCCTCGCTCTTCCAGGCTCCAGCCATTCCTCCAGCTC  1045
            |||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||.|||||||.|||||.||.|
Sbjct 1182  CGTGTCCTCTGCGCTGTCACTGCCACCTCGGCCATCCGCCTCTCTGTTCCAGGCTGCAGCCATCCCTCCTGCGC  1255

Query 1046  TTCTGAGGCCTGGGCATGGGCCCATCCGCGCCACTCCTGCCTCCATCCTCTTTGCTCCGTAC  1107
            |.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1256  TGCTGAGGCCTGGCCACGGGCCCATCCGGGCCACGCCCGCCTCCATCCTCTTTGCCCCTTAC  1317