Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470628
• Subject: XM_006499460.3
• Aligned Length: 1296
• Identities: 989
• Gaps: 192

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------------ATGATGCATCC  11
                                                                           ||||||||.||
Sbjct    1  ATGCTCCTGGGCAGCGCATGCCACACCACTACCCTTCCTGCCCTCGTGCGCACACCCACCCTGATGATGCAGCC  74

Query   12  TTCACTGGATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGTTCTGCTGTTGGGCTCTTTCCAAATTTTA  85
            |||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct   75  TTCGCTGGACATCAAACCGTTCATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGCTCTGCCGTGGGGCTCTTTCCAAACTTTA  148

Query   86  ACACA---------------------------------------------------------------------  90
            |||||                                                                     
Sbjct  149  ACACACCATCTTTGTCCGTGGACTTGTGCCTGTTGGCTCTCAGAGCCCCTACGCATACAGGACTGAGGAAGAGA  222

Query   91  ---------------------------------------------------------ATGGATCCTGTGCAAAA  107
                                                                     |||||.||||||||.||
Sbjct  223  CCAGGCCATCTAAAGGAGAAAAGAAGAGGCTTATTTGGGACCAATAAGTTCTGCCAGATGGACCCTGTGCAGAA  296

Query  108  AGCGGTTATTAACCATACATTTGGAGTATCCATTCCCCCAAAGAAGAAACAAGTTATTTCTTGTAATGTCTGTC  181
            |||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  297  AGCAGTCATTAACCACACATTTGGAGTCTCCATTCCCCCGAAGAAGAAACAAGTTATTTCCTGTAACGTCTGTC  370

Query  182  AGCTTCGCTTTAACTCAGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAAACATGCCAAGAAGGTCAAAGCA  255
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  AGCTTCGCTTTAACTCGGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAAACATGCCAAGAAGGTCAAAGCT  444

Query  256  CTAGACGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAAAGGCTAATCCCAGCTGCTCCAT  329
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTAGAGGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAAAGGCTAATCCCAGCTGCTCCAT  518

Query  330  CACTCCAATCACAGGCAACAACTCTGACAAATCAGAAGATAAAGGGAAGTTAAAAGCCAGCAGTTCCAGTCAGC  403
            ||..|||..|||||||.|||.||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||.||||||||||||||
Sbjct  519  CAGGCCAGGCACAGGCGACAGCTCTGACAAATCAGAAGACAAAGGGAAGATAAAAGCCACCAGTTCCAGTCAGC  592

Query  404  CATCAAGCTCTGAAAGTGGCTCATTTATCCTCAAATCTGGCACAACACCCCTGCCACCTGGAGCAGCCACTTCT  477
            |.|||.||||.|||.|.|||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||...|.|||||
Sbjct  593  CCTCAGGCTCCGAAGGAGGCTCCTTTCTCCTCAAATCTGGCACAACACCCCTGCCACTTGGAGCCATCGCTTCT  666

Query  478  CCCTCCAAGAGCACAAATGGAGCTCCCGGTACTGTTGTTGAATCAGAAGAAGAAAAAGCCAAAAAATTACTTTA  551
            |||||||||||||||||.||.|||||.||..||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  667  CCCTCCAAGAGCACAAACGGCGCTCCAGGGTCTGTTGCTGAGTCAGAAGAAGAAAAAGCCAAAAAATTACTCTA  740

Query  552  TTGTTCACTATGCAAAGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTAGAGGCACACAACACAGGATCTAAACACAAGA  625
            .||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGCTCACTATGCAAGGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTGGAGGCTCACAACACAGGATCTAAACACAAGA  814

Query  626  CCATGGTTGAAGCTCGTAATGGGGCTGGTCCAATTAAATCCTATCCTAGACCTGGATCAAGATTAAAGATGCAG  699
            ||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||
Sbjct  815  CCATGGTTGAGGCTCGTAATGGAGCTGGTCCAATTAAGTCCTATCCAAGACCTGGGTCAAGATTAAAGGTGCAG  888

Query  700  AATGGCAGTAAGGGGTCAGGACTACAGAACAAGACATTTCATTGTGAAATCTGTGATGTTCATGTTAATTCAGA  773
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|..|||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct  889  AACGGCAGTAAGGGCTCAGGACTACAGAACAAAATGTTTCATTGTGAGATCTGTGATGTTCACGTGAACTCAGA  962

Query  774  AATTCAACTCAAACAGCACATTTCTAGCCGAAGGCATAAAGATCGAGTTGCAGGGAAACCACTGAAGCCAAAAT  847
            .|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct  963  GATTCAACTCAAACAGCACATTTCAAGCCGAAGGCATAAAGACCGCGTGGCAGGAAAACCGCTGAAGCCGAAAT  1036

Query  848  ACAGCCCTTACAACAAACTCCAGCGGAGCCCGAGTATTCTAGCAGCAAAACTTGCATTCCAGAAAGATATGATG  921
            |||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||..||||.|||||.||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1037  ACAGCCCCTACAACAAGCTGCAGCGGAGCCCAAGCATCTTAGCTGCAAAGCTTGCATTCCAGAAAGATCTGATG  1110

Query  922  AAGCCTTTGGCCCCAGCCTTCCTGTCCTCACCTCTCGCAGCGGCGGCAGCCGTGTCCTCAGCGCTGTCACTCCC  995
            ||||||.|||||||..|.||||||||.|||||.||   .|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1111  AAGCCTCTGGCCCCTACGTTCCTGTCTTCACCCCT---GGCGGCCGCAGCCGTGTCCTCTGCGCTGTCACTGCC  1181

Query  996  ACCCCGGCCCTCTGCCTCGCTCTTCCAGGCTCCAGCCATTCCTCCAGCTCTTCTGAGGCCTGGGCATGGGCCCA  1069
            |||.|||||.||.|||||.||.|||||||||.|||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1182  ACCTCGGCCATCCGCCTCTCTGTTCCAGGCTGCAGCCATCCCTCCTGCGCTGCTGAGGCCTGGCCACGGGCCCA  1255

Query 1070  TCCGCGCCACTCCTGCCTCCATCCTCTTTGCTCCGTAC  1107
            ||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1256  TCCGGGCCACGCCCGCCTCCATCCTCTTTGCCCCTTAC  1293