Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470628
- Subject:
- XM_006499461.3
- Aligned Length:
- 1233
- Identities:
- 989
- Gaps:
- 129
Alignment
Query 1 ATGATGCATCCTTCACTGGATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGTTCTGCTGTTGGGCTCTT 74
||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1 ATGATGCAGCCTTCGCTGGACATCAAACCGTTCATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGCTCTGCCGTGGGGCTCTT 74
Query 75 TCCAAATTTTAACACA---------------------------------------------------------- 90
||||||.|||||||||
Sbjct 75 TCCAAACTTTAACACACCATCTTTGTCCGTGGACTTGTGCCTGTTGGCTCTCAGAGCCCCTACGCATACAGGAC 148
Query 91 --------------------------------------------------------------------ATGGAT 96
|||||.
Sbjct 149 TGAGGAAGAGACCAGGCCATCTAAAGGAGAAAAGAAGAGGCTTATTTGGGACCAATAAGTTCTGCCAGATGGAC 222
Query 97 CCTGTGCAAAAAGCGGTTATTAACCATACATTTGGAGTATCCATTCCCCCAAAGAAGAAACAAGTTATTTCTTG 170
||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 223 CCTGTGCAGAAAGCAGTCATTAACCACACATTTGGAGTCTCCATTCCCCCGAAGAAGAAACAAGTTATTTCCTG 296
Query 171 TAATGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCAGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAAACATGCCAAGA 244
|||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TAACGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCGGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAAACATGCCAAGA 370
Query 245 AGGTCAAAGCACTAGACGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAAAGGCTAATCCC 318
||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGGTCAAAGCTCTAGAGGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAAAGGCTAATCCC 444
Query 319 AGCTGCTCCATCACTCCAATCACAGGCAACAACTCTGACAAATCAGAAGATAAAGGGAAGTTAAAAGCCAGCAG 392
|||||||||||||..|||..|||||||.|||.||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||.|||
Sbjct 445 AGCTGCTCCATCAGGCCAGGCACAGGCGACAGCTCTGACAAATCAGAAGACAAAGGGAAGATAAAAGCCACCAG 518
Query 393 TTCCAGTCAGCCATCAAGCTCTGAAAGTGGCTCATTTATCCTCAAATCTGGCACAACACCCCTGCCACCTGGAG 466
||||||||||||.|||.||||.|||.|.|||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 519 TTCCAGTCAGCCCTCAGGCTCCGAAGGAGGCTCCTTTCTCCTCAAATCTGGCACAACACCCCTGCCACTTGGAG 592
Query 467 CAGCCACTTCTCCCTCCAAGAGCACAAATGGAGCTCCCGGTACTGTTGTTGAATCAGAAGAAGAAAAAGCCAAA 540
|...|.||||||||||||||||||||||.||.|||||.||..||||||.|||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCATCGCTTCTCCCTCCAAGAGCACAAACGGCGCTCCAGGGTCTGTTGCTGAGTCAGAAGAAGAAAAAGCCAAA 666
Query 541 AAATTACTTTATTGTTCACTATGCAAAGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTAGAGGCACACAACACAGGATC 614
||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 667 AAATTACTCTACTGCTCACTATGCAAGGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTGGAGGCTCACAACACAGGATC 740
Query 615 TAAACACAAGACCATGGTTGAAGCTCGTAATGGGGCTGGTCCAATTAAATCCTATCCTAGACCTGGATCAAGAT 688
|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 741 TAAACACAAGACCATGGTTGAGGCTCGTAATGGAGCTGGTCCAATTAAGTCCTATCCAAGACCTGGGTCAAGAT 814
Query 689 TAAAGATGCAGAATGGCAGTAAGGGGTCAGGACTACAGAACAAGACATTTCATTGTGAAATCTGTGATGTTCAT 762
|||||.|||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|..|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 815 TAAAGGTGCAGAACGGCAGTAAGGGCTCAGGACTACAGAACAAAATGTTTCATTGTGAGATCTGTGATGTTCAC 888
Query 763 GTTAATTCAGAAATTCAACTCAAACAGCACATTTCTAGCCGAAGGCATAAAGATCGAGTTGCAGGGAAACCACT 836
||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||
Sbjct 889 GTGAACTCAGAGATTCAACTCAAACAGCACATTTCAAGCCGAAGGCATAAAGACCGCGTGGCAGGAAAACCGCT 962
Query 837 GAAGCCAAAATACAGCCCTTACAACAAACTCCAGCGGAGCCCGAGTATTCTAGCAGCAAAACTTGCATTCCAGA 910
||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||..||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 963 GAAGCCGAAATACAGCCCCTACAACAAGCTGCAGCGGAGCCCAAGCATCTTAGCTGCAAAGCTTGCATTCCAGA 1036
Query 911 AAGATATGATGAAGCCTTTGGCCCCAGCCTTCCTGTCCTCACCTCTCGCAGCGGCGGCAGCCGTGTCCTCAGCG 984
|||||.|||||||||||.|||||||..|.||||||||.|||||.|| .|||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1037 AAGATCTGATGAAGCCTCTGGCCCCTACGTTCCTGTCTTCACCCCT---GGCGGCCGCAGCCGTGTCCTCTGCG 1107
Query 985 CTGTCACTCCCACCCCGGCCCTCTGCCTCGCTCTTCCAGGCTCCAGCCATTCCTCCAGCTCTTCTGAGGCCTGG 1058
||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||.|||||||.|||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 1108 CTGTCACTGCCACCTCGGCCATCCGCCTCTCTGTTCCAGGCTGCAGCCATCCCTCCTGCGCTGCTGAGGCCTGG 1181
Query 1059 GCATGGGCCCATCCGCGCCACTCCTGCCTCCATCCTCTTTGCTCCGTAC 1107
.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1182 CCACGGGCCCATCCGGGCCACGCCCGCCTCCATCCTCTTTGCCCCTTAC 1230