Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470628
• Subject: XM_011510717.2
• Aligned Length: 1287
• Identities: 1105
• Gaps: 180

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------------ATGATGCATCCTTC  14
                                                                        ||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGCTCGGCAGTACATGCCACACTACTACCCTTCCTGCTCTTGTGCGCACACCTACCCTGATGATGCAGCCTTC  74

Query   15  ACTGGATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGTTCTGCTGTTGGGCTCTTTCCAAATTTTAACA  88
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACTGGATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGTTCTGCTGTTGGGCTCTTTCCAAATTTTAACA  148

Query   89  CA---------------------------------------ATGGATCCTGTGCAAAAAGCGGTTATTAACCAT  123
            ||                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAAAAAGAAGAGGCTTATTTGAGACCAATAAATTTTGCCAGATGGATCCTGTGCAAAAAGCGGTTATTAACCAT  222

Query  124  ACATTTGGAGTATCCATTCCCCCAAAGAAGAAACAAGTTATTTCTTGTAATGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTC  197
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACATTTGGAGTATCCATTCCCCCAAAGAAGAAACAAGTTATTTCTTGTAATGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTC  296

Query  198  AGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAAACATGCCAAGAAGGTCAAAGCACTAGACGCAACGAAAA  271
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAAACATGCCAAGAAGGTCAAAGCACTAGACGCAACGAAAA  370

Query  272  ATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAAAGGCTAATCCCAGCTGCTCCATCACTCCAATCACAGGC  345
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAAAGGCTAATCCCAGCTGCTCCATCACTCCAATCACAGGC  444

Query  346  AACAACTCTGACAAATC---------------------------------------------------------  362
            |||||||||||||||||                                                         
Sbjct  445  AACAACTCTGACAAATCAGAGAGCACTGCCTTGAATTGGACATTCCTTATTTCAGCAAACGTATTGCTCACCTA  518

Query  363  ------------------------AGAAGATAAAGGGAAGTTAAAAGCCAGCAGTTCCAGTCAGCCATCAAGCT  412
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGCTTTCTGTACATTGGGCATAAAGAAGATAAAGGGAAGTTAAAAGCCAGCAGTTCCAGTCAGCCATCAAGCT  592

Query  413  CTGAAAGTGGCTCATTTATCCTCAAATCTGGCACAACACCCCTGCCACCTGGAGCAGCCACTTCTCCCTCCAAG  486
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTGAAAGTGGCTCATTTCTCCTCAAATCTGGCACAACACCCCTGCCACCTGGAGCAGCCACTTCTCCCTCCAAG  666

Query  487  AGCACAAATGGAGCTCCCGGTACTGTTGTTGAATCAGAAGAAGAAAAAGCCAAAAAATTACTTTATTGTTCACT  560
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGCACAAATGGAGCTCCCGGTACTGTTGTTGAATCAGAAGAAGAAAAAGCCAAAAAATTACTTTATTGTTCACT  740

Query  561  ATGCAAAGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTAGAGGCACACAACACAGGATCTAAACACAAGACCATGGTTG  634
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATGCAAAGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTAGAGGCACACAACACAGGATCTAAACACAAGACCATGGTTG  814

Query  635  AAGCTCGTAATGGGGCTGGTCCAATTAAATCCTATCCTAGACCTGGATCAAGATTAAAGATGCAGAATGGCAGT  708
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGCTCGTAATGGGGCTGGTCCAATTAAATCCTATCCTAGACCTGGATCAAGATTAAAGATGCAGAATGGCAGT  888

Query  709  AAGGGGTCAGGACTACAGAACAAGACATTTCATTGTGAAATCTGTGATGTTCATGTTAATTCAGAAATTCAACT  782
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGGGGTCAGGACTACAGAACAAGACATTTCATTGTGAAATCTGTGATGTTCATGTTAATTCAGAAATTCAACT  962

Query  783  CAAACAGCACATTTCTAGCCGAAGGCATAAAGATCGAGTTGCAGGGAAACCACTGAAGCCAAAATACAGCCCTT  856
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAACAGCACATTTCTAGCCGAAGGCATAAAGATCGAGTTGCAGGGAAACCACTGAAGCCAAAATACAGCCCTT  1036

Query  857  ACAACAAACTCCAGCGGAGCCCGAGTATTCTAGCAGCAAAACTTGCATTCCAGAAAGATATGATGAAGCCTTTG  930
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACAACAAACTCCAGCGGAGCCCGAGTATTCTAGCAGCAAAACTTGCATTCCAGAAAGATATGATGAAGCCTTTG  1110

Query  931  GCCCCAGCCTTCCTGTCCTCACCTCTCGCAGCGGCGGCAGCCGTGTCCTCAGCGCTGTCACTCCCACCCCGGCC  1004
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCCCAGCCTTCCTGTCCTCACCTCTCGCAGCGGCGGCAGCCGTGTCCTCAGCGCTGTCACTCCCACCCCGGCC  1184

Query 1005  CTCTGCCTCGCTCTTCCAGGCTCCAGCCATTCCTCCAGCTCTTCTGAGGCCTGGGCATGGGCCCATCCGCGCCA  1078
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTCTGCCTCGCTCTTCCAGGCTCCAGCCATTCCTCCAGCTCTTCTGAGGCCTGGGCATGGGCCCATCCGCGCCA  1258

Query 1079  CTCCTGCCTCCATCCTCTTTGCTCCGTAC  1107
            |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTCCTGCCTCCATCCTCTTTGCTCCGTAC  1287