Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470628
• Subject: XM_017318085.1
• Aligned Length: 1170
• Identities: 989
• Gaps: 66

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------------ATGATGCATCC  11
                                                                           ||||||||.||
Sbjct    1  ATGCTCCTGGGCAGCGCATGCCACACCACTACCCTTCCTGCCCTCGTGCGCACACCCACCCTGATGATGCAGCC  74

Query   12  TTCACTGGATATCAAACCATTTATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGTTCTGCTGTTGGGCTCTTTCCAAATTTTA  85
            |||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct   75  TTCGCTGGACATCAAACCGTTCATGTCTTTTCCAGTGGACAGTAGCTCTGCCGTGGGGCTCTTTCCAAACTTTA  148

Query   86  ACACAATGGATCCTGTGCAAAAAGCGGTTATTAACCATACATTTGGAGTATCCATTCCCCCAAAGAAGAAACAA  159
            ||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  ACACAATGGACCCTGTGCAGAAAGCAGTCATTAACCACACATTTGGAGTCTCCATTCCCCCGAAGAAGAAACAA  222

Query  160  GTTATTTCTTGTAATGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCAGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAA  233
            ||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTTATTTCCTGTAACGTCTGTCAGCTTCGCTTTAACTCGGATAGCCAGGCCGAGGCCCACTACAAAGGAAGTAA  296

Query  234  ACATGCCAAGAAGGTCAAAGCACTAGACGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAA  307
            |||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACATGCCAAGAAGGTCAAAGCTCTAGAGGCAACGAAAAATAAACCCAAAATGGTTCCTTCCAAGGACAGCGCAA  370

Query  308  AGGCTAATCCCAGCTGCTCCATCACTCCAATCACAGGCAACAACTCTGACAAATCAGAAGATAAAGGGAAGTTA  381
            ||||||||||||||||||||||||..|||..|||||||.|||.||||||||||||||||||.|||||||||.||
Sbjct  371  AGGCTAATCCCAGCTGCTCCATCAGGCCAGGCACAGGCGACAGCTCTGACAAATCAGAAGACAAAGGGAAGATA  444

Query  382  AAAGCCAGCAGTTCCAGTCAGCCATCAAGCTCTGAAAGTGGCTCATTTATCCTCAAATCTGGCACAACACCCCT  455
            |||||||.|||||||||||||||.|||.||||.|||.|.|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAGCCACCAGTTCCAGTCAGCCCTCAGGCTCCGAAGGAGGCTCCTTTCTCCTCAAATCTGGCACAACACCCCT  518

Query  456  GCCACCTGGAGCAGCCACTTCTCCCTCCAAGAGCACAAATGGAGCTCCCGGTACTGTTGTTGAATCAGAAGAAG  529
            |||||.||||||...|.||||||||||||||||||||||.||.|||||.||..||||||.|||.||||||||||
Sbjct  519  GCCACTTGGAGCCATCGCTTCTCCCTCCAAGAGCACAAACGGCGCTCCAGGGTCTGTTGCTGAGTCAGAAGAAG  592

Query  530  AAAAAGCCAAAAAATTACTTTATTGTTCACTATGCAAAGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTAGAGGCACAC  603
            |||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  593  AAAAAGCCAAAAAATTACTCTACTGCTCACTATGCAAGGTGGCTGTGAACTCCCTGTCACAGCTGGAGGCTCAC  666

Query  604  AACACAGGATCTAAACACAAGACCATGGTTGAAGCTCGTAATGGGGCTGGTCCAATTAAATCCTATCCTAGACC  677
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  667  AACACAGGATCTAAACACAAGACCATGGTTGAGGCTCGTAATGGAGCTGGTCCAATTAAGTCCTATCCAAGACC  740

Query  678  TGGATCAAGATTAAAGATGCAGAATGGCAGTAAGGGGTCAGGACTACAGAACAAGACATTTCATTGTGAAATCT  751
            |||.||||||||||||.|||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|..|||||||||||.||||
Sbjct  741  TGGGTCAAGATTAAAGGTGCAGAACGGCAGTAAGGGCTCAGGACTACAGAACAAAATGTTTCATTGTGAGATCT  814

Query  752  GTGATGTTCATGTTAATTCAGAAATTCAACTCAAACAGCACATTTCTAGCCGAAGGCATAAAGATCGAGTTGCA  825
            ||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct  815  GTGATGTTCACGTGAACTCAGAGATTCAACTCAAACAGCACATTTCAAGCCGAAGGCATAAAGACCGCGTGGCA  888

Query  826  GGGAAACCACTGAAGCCAAAATACAGCCCTTACAACAAACTCCAGCGGAGCCCGAGTATTCTAGCAGCAAAACT  899
            ||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||..||||.|||||.||
Sbjct  889  GGAAAACCGCTGAAGCCGAAATACAGCCCCTACAACAAGCTGCAGCGGAGCCCAAGCATCTTAGCTGCAAAGCT  962

Query  900  TGCATTCCAGAAAGATATGATGAAGCCTTTGGCCCCAGCCTTCCTGTCCTCACCTCTCGCAGCGGCGGCAGCCG  973
            ||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||..|.||||||||.|||||.||   .|||||.|||||||
Sbjct  963  TGCATTCCAGAAAGATCTGATGAAGCCTCTGGCCCCTACGTTCCTGTCTTCACCCCT---GGCGGCCGCAGCCG  1033

Query  974  TGTCCTCAGCGCTGTCACTCCCACCCCGGCCCTCTGCCTCGCTCTTCCAGGCTCCAGCCATTCCTCCAGCTCTT  1047
            |||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||.|||||||.|||||.||.||.
Sbjct 1034  TGTCCTCTGCGCTGTCACTGCCACCTCGGCCATCCGCCTCTCTGTTCCAGGCTGCAGCCATCCCTCCTGCGCTG  1107

Query 1048  CTGAGGCCTGGGCATGGGCCCATCCGCGCCACTCCTGCCTCCATCCTCTTTGCTCCGTAC  1107
            |||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1108  CTGAGGCCTGGCCACGGGCCCATCCGGGCCACGCCCGCCTCCATCCTCTTTGCCCCTTAC  1167