Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470689
- Subject:
- XM_006506218.3
- Aligned Length:
- 801
- Identities:
- 539
- Gaps:
- 186
Alignment
Query 1 ATGGAGCATGCCTTTACCCCGTTGGAGCCCCTGCTTTCCACTGGGAATTTGAAGTACTGCCTTGTAATTCTTAA 74
||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|.||.|||||.|||||.|||||||||||..|||||||
Sbjct 1 ATGGAGCATGCCTTTACCCCGTTGGAACCCCTGCTACCTACGGGGAACTTGAAATACTGCCTTGTGGTTCTTAA 74
Query 75 TCAGCCTTTGGA--CAACTATTTTCGTCATCTTTGGAACAAAGCTCTTTTAAGAGCCTGTGCCGATGGAGGTGC 146
|||||||||||| | ||.| |||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 75 TCAGCCTTTGGATGC-ACGA-TTTCGCCATCTTTGGAAAAAAGCTCTCTTAAGAGCCTGTGCTGATGGGGGTGC 146
Query 147 CAACCGCTTATATGATATCACCGAAGGAGAGAGAGAAAGCTTTTTGCCTGAATTCATCAATGGAGACTTTGATT 220
|||||.||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||.|||.||||||||||
Sbjct 147 CAACCACTTATATGATCTCACTGAAGGAGAGAGAGAAAGCTTCTTGCCTGAATTCGTCAGTGGGGACTTTGATT 220
Query 221 CTATTAGGCCTGAAGTCAGAGAATACTATGCTACTAAGGGATGTGAGCTCATTTCAACTCCTGATCAAGACCAC 294
||||||||||||||||||.|||.|||||..|.|..|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 221 CTATTAGGCCTGAAGTCAAAGAGTACTACACCAAGAAGGGCTGTGATCTTATTTCAACTCCTGACCAAGACCAC 294
Query 295 ACTGACTTTACTAAGTGCCTTAAAATGCTCCAAAAGAAGATAGAAGAAAAAGACTTAAAGGTTGATGTGATCGT 368
|||||||||||.|||||.|||.||.|||||||||.|||||||||.|||||.||..|..|||||||.|||||.||
Sbjct 295 ACTGACTTTACCAAGTGTCTTCAAGTGCTCCAAAGGAAGATAGAGGAAAAGGAACTGCAGGTTGACGTGATTGT 368
Query 369 GACACTGGGAGGCCTTGCTGGGCGTTTTGACCAGATTATGGCATCTGTGAATACCTTGTTCCAAGCGACTCACA 442
||||||||||||.||.|.|||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||.|.||||||||.|||||||
Sbjct 369 GACACTGGGAGGTCTCGGTGGGCGTTTTGACCAAATCATGGCCTCTGTGAATACCCTTTTCCAAGCCACTCACA 442
Query 443 TCACTCCTTTTCCAATTATAATAATCCAAGAGGAATCGCTGATCTACCTGCTCCAACCAGGAAAGCACAGGTTG 516
||||||||.|.||.|||||||||||||||.||||.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 443 TCACTCCTGTGCCGATTATAATAATCCAAAAGGACTCTCTCATCTACCTCCTCCAAC----------------- 499
Query 517 CATGTAGACACTGGAATGGAGGGTGATTGGTGTGGCCTTATTCCTGTTGGACAGCCTTGTAGTCAGGTTACAAC 590
Sbjct 500 -------------------------------------------------------------------------- 499
Query 591 CACAGGCCTCAAGTGGAACCTCACAAATGATGTGCTTGCTTTTGGAACATTGGTCAGTACTTCCAATACCTACG 664
|.||||||||||.||||..|||||||||.|||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 500 ---------------------CCCAAATGATGTTCTTGGCTTTGGAACACTGGTCAGTACTTCTAACACCTACG 552
Query 665 ACGGGTCTGGTGTTGTGACTGTGGAAACTGACCACCCACTCCTCTGGACCATGGCCATCAAAAGC--------- 729
|.|||||.||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 553 ATGGGTCCGGCCTTGTCACTGTGGAAACTGACCACCCACTCCTCTGGACCATGGCCATCAAGAGCTAACCTACA 626
Query 730 ------------------------------------------------------------- 729
Sbjct 627 GTGCGGCATCCATCTTGTGCCTGTGCCTTCCCTTACCTGCCCACTGGTTCGTTGCTCAGCA 687