Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470689
• Subject: XM_011516035.3
• Aligned Length: 829
• Identities: 674
• Gaps: 128

Alignment

Query   1  ATGGAGCATGCCTTTACCCCGTTGGAGCCCCTGCTTTCCACTGGGAATTTGAAGTACTGCCTTGTAATTCTTAA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGAGCATGCCTTTACCCCGTTGGAGCCCCTGCTTTCCACTGGGAATTTGAAGTACTGCCTTGTAATTCTTAA  74

Query  75  TCAGCCTTTGGACAACTATTTTCGTCATCTTTGGAACAAAGCTCTTTTAAGAGCCTGTGCCGATGGAGGTGCCA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TCAGCCTTTGGACAACTATTTTCGTCATCTTTGGAACAAAGCTCTTTTAAGAGCCTGTGCCGATGGAGGTGCCA  148

Query 149  ACCGCTTATATGATATCACCGAAGGAGAGAGAGAAAGCTTTTTGCCTGAATTCATCAATGGAGACTTTGATTCT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ACCGCTTATATGATATCACCGAAGGAGAGAGAGAAAGCTTTTTGCCTGAATTCATCAATGGAGACTTTGATTCT  222

Query 223  ATTAGGCCTGAAGTCAGAGAATACTATGCTACT-----------------------------------------  255
           |||||||||||||||||||||||||||||||||                                         
Sbjct 223  ATTAGGCCTGAAGTCAGAGAATACTATGCTACTAAGGTGTTAATTTTCTCAATATTGGGCACATCTTTCAAAGA  296

Query 256  -------------------------------------AAGGGATGTGAGCTCATTTCAACTCCTGATCAAGACC  292
                                                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  AGAGAAGGAACCTTTCTCAGGAAGGAGGGAAGAGAAAAAGGGATGTGAGCTCATTTCAACTCCTGATCAAGACC  370

Query 293  ACACTGACTTTACTAAGTGCCTTAAAATGCTCCAAAAGAAGATAGAAGAAAAAGACTTAAAGGTTGATGTGATC  366
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  ACACTGACTTTACTAAGTGCCTTAAAATGCTCCAAAAGAAGATAGAAGAAAAAGACTTAAAGGTTGATGTGATC  444

Query 367  GTGACACTGGGAGGCCTTGCTGGGCGTTTTGACCAGATTATGGCATCTGTGAATACCTTGTTCCAAGCGACTCA  440
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  GTGACACTGGGAGGCCTTGCTGGGCGTTTTGACCAGATTATGGCATCTGTGAATACCTTGTTCCAAGCGACTCA  518

Query 441  CATCACTCCTTTTCCAATTATAATAATCCAAGAGGAATCGCTGATCTACCTGCTCCAACCAGGAAAGCACAGGT  514
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  CATCACTCCTTTTCCAATTATAATAATCCAAGAGGAATCGCTGATCTACCTGCTCCAACCAGGAAAGCACAGGT  592

Query 515  TGCATGTAGACACTGGAATGGAGGGTGATTGGTGTGGCCTTATTCCTGTTGGACAGCCTTGTAGTCAGGTTACA  588
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||
Sbjct 593  TGCATGTAGACACTGGAATGGAGGGTGATTGGTGTGGCCTTATTCCTGTTGGACAGCCTTGTATGCAGGTTACA  666

Query 589  ACCACAGGCCTCAAGTGGAACCTCACAAATGATGTGCTTGCTTTTGGAACA-TTGGTCAGTACTTCCA---ATA  658
           |||||||||||||||||||||||||.||.|  ||||..|.|..|.|||.|| .|||..||     |||   |||
Sbjct 667  ACCACAGGCCTCAAGTGGAACCTCAGAACT--TGTGACTACACTAGGACCACCTGGATAG-----CCAAGGATA  733

Query 659  -------CCTACGACGGGTCTGGTGT--TGTGAC---------TGTGGAAACTGACCACCCACTCCTCTGGACC  714
                  ||.|.|||...||.|.| |  |..|||         |.||.|||.|          |||||      
Sbjct 734  ATCCCGTCCCAAGACTAATCAGAT-TAATCAGACTTAATCACATCTGTAAAGT----------TCCTC------  790

Query 715  ATGGCCATCAAAAGC  729
            |.|||||||||   
Sbjct 791  -TTGCCATCAAA---  801