Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470716
• Subject: NM_005341.4
• Aligned Length: 2064
• Identities: 2064
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGACGGCTCCTTCGTCCAGCACAGTGTGAGGGTTCTGCAGGAGCTCAACAAGCAGCGGGAGAAGGGCCAGTA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACGGCTCCTTCGTCCAGCACAGTGTGAGGGTTCTGCAGGAGCTCAACAAGCAGCGGGAGAAGGGCCAGTA  74

Query   75  CTGCGACGCCACTCTGGACGTGGGGGGCCTGGTGTTTAAGGCACACTGGAGTGTCCTTGCCTGCTGCAGTCACT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTGCGACGCCACTCTGGACGTGGGGGGCCTGGTGTTTAAGGCACACTGGAGTGTCCTTGCCTGCTGCAGTCACT  148

Query  149  TTTTCCAGAGCCTCTACGGGGATGGCTCAGGGGGCAGTGTCGTCCTCCCTGCTGGCTTCGCTGAGATCTTTGGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTTTCCAGAGCCTCTACGGGGATGGCTCAGGGGGCAGTGTCGTCCTCCCTGCTGGCTTCGCTGAGATCTTTGGC  222

Query  223  CTCTTGTTGGACTTTTTCTACACTGGTCACCTCGCTCTCACCTCAGGGAACCGGGATCAGGTGCTCCTGGCAGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTCTTGTTGGACTTTTTCTACACTGGTCACCTCGCTCTCACCTCAGGGAACCGGGATCAGGTGCTCCTGGCAGC  296

Query  297  CAGGGAGTTGCGAGTGCCAGAGGCCGTAGAGCTGTGCCAGAGCTTCAAGCCCAAAACTTCAGTGGGACAGGCAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAGGGAGTTGCGAGTGCCAGAGGCCGTAGAGCTGTGCCAGAGCTTCAAGCCCAAAACTTCAGTGGGACAGGCAG  370

Query  371  CAGGTGGCCAGAGTGGGCTGGGGCCCCCTGCCTCCCAGAATGTGAACAGCCACGTCAAGGAGCCGGCAGGCTTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGGTGGCCAGAGTGGGCTGGGGCCCCCTGCCTCCCAGAATGTGAACAGCCACGTCAAGGAGCCGGCAGGCTTG  444

Query  445  GAAGAAGAGGAAGTTTCGAGGACTCTGGGTCTAGTCCCCAGGGATCAGGAGCCCAGAGGCAGTCATAGTCCTCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAGAAGAGGAAGTTTCGAGGACTCTGGGTCTAGTCCCCAGGGATCAGGAGCCCAGAGGCAGTCATAGTCCTCA  518

Query  519  GAGGCCCCAGCTCCATTCCCCAGCTCAGAGTGAGGGCCCCTCCTCCCTCTGTGGGAAACTGAAGCAGGCCTTGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAGGCCCCAGCTCCATTCCCCAGCTCAGAGTGAGGGCCCCTCCTCCCTCTGTGGGAAACTGAAGCAGGCCTTGA  592

Query  593  AGCCTTGTCCCCTTGAGGACAAGAAACCCGAGGACTGCAAAGTGCCCCCAAGGCCCTTAGAGGCTGAAGGTGCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCCTTGTCCCCTTGAGGACAAGAAACCCGAGGACTGCAAAGTGCCCCCAAGGCCCTTAGAGGCTGAAGGTGCC  666

Query  667  CAGCTGCAGGGCGGCAGTAATGAGTGGGAAGTGGTGGTTCAAGTGGAGGATGATGGGGATGGCGATTACATGTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGCTGCAGGGCGGCAGTAATGAGTGGGAAGTGGTGGTTCAAGTGGAGGATGATGGGGATGGCGATTACATGTC  740

Query  741  TGAGCCTGAGGCTGTGCTGACCAGGAGGAAGTCAAATGTAATCCGAAAGCCCTGTGCAGCTGAGCCAGCCCTGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGAGCCTGAGGCTGTGCTGACCAGGAGGAAGTCAAATGTAATCCGAAAGCCCTGTGCAGCTGAGCCAGCCCTGA  814

Query  815  GCGCGGGCTCCCTAGCAGCTGAGCCTGCTGAGAACAGAAAAGGTACAGCGGTGCCGGTCGAATGCCCCACATGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCGCGGGCTCCCTAGCAGCTGAGCCTGCTGAGAACAGAAAAGGTACAGCGGTGCCGGTCGAATGCCCCACATGT  888

Query  889  CATAAAAAGTTCCTCAGCAAATATTATCTAAAAGTCCACAACAGGAAACATACTGGGGAGAAACCCTTTGAGTG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CATAAAAAGTTCCTCAGCAAATATTATCTAAAAGTCCACAACAGGAAACATACTGGGGAGAAACCCTTTGAGTG  962

Query  963  TCCCAAATGTGGGAAGTGTTACTTTCGGAAGGAGAACCTCCTGGAGCATGAAGCCCGGAATTGCATGAACCGCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCCCAAATGTGGGAAGTGTTACTTTCGGAAGGAGAACCTCCTGGAGCATGAAGCCCGGAATTGCATGAACCGCT  1036

Query 1037  CGGAACAGGTCTTCACGTGCTCTGTGTGCCAGGAGACATTCCGCCGAAGGATGGAGCTGCGGGTGCACATGGTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CGGAACAGGTCTTCACGTGCTCTGTGTGCCAGGAGACATTCCGCCGAAGGATGGAGCTGCGGGTGCACATGGTG  1110

Query 1111  TCTCACACAGGGGAGATGCCCTACAAGTGTTCCTCCTGCTCCCAGCAGTTCATGCAGAAGAAGGACTTGCAGAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCTCACACAGGGGAGATGCCCTACAAGTGTTCCTCCTGCTCCCAGCAGTTCATGCAGAAGAAGGACTTGCAGAG  1184

Query 1185  CCACATGATCAAACTTCATGGAGCCCCCAAGCCCCATGCATGCCCCACCTGTGCCAAGTGCTTCCTGTCTCGGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCACATGATCAAACTTCATGGAGCCCCCAAGCCCCATGCATGCCCCACCTGTGCCAAGTGCTTCCTGTCTCGGA  1258

Query 1259  CAGAGCTGCAGCTGCATGAAGCTTTCAAGCACCGTGGTGAGAAGCTGTTTGTGTGTGAGGAGTGTGGGCACCGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGAGCTGCAGCTGCATGAAGCTTTCAAGCACCGTGGTGAGAAGCTGTTTGTGTGTGAGGAGTGTGGGCACCGG  1332

Query 1333  GCCTCGAGCCGGAATGGCCTGCAGATGCACATCAAGGCCAAGCACAGGAATGAGAGGCCACACGTATGTGAGTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCCTCGAGCCGGAATGGCCTGCAGATGCACATCAAGGCCAAGCACAGGAATGAGAGGCCACACGTATGTGAGTT  1406

Query 1407  CTGCAGCCACGCCTTCACCCAAAAGGCCAATCTCAACATGCACCTGCGCACACACACGGGTGAGAAGCCCTTCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTGCAGCCACGCCTTCACCCAAAAGGCCAATCTCAACATGCACCTGCGCACACACACGGGTGAGAAGCCCTTCC  1480

Query 1481  AGTGCCACCTCTGTGGCAAGACCTTCCGAACCCAAGCCAGCCTGGACAAGCACAACCGCACCCACACCGGGGAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGTGCCACCTCTGTGGCAAGACCTTCCGAACCCAAGCCAGCCTGGACAAGCACAACCGCACCCACACCGGGGAA  1554

Query 1555  AGGCCCTTCAGTTGCGAGTTCTGTGAACAGCGCTTCACTGAGAAGGGGCCCCTCCTGAGGCACGTGGCCAGCCG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGGCCCTTCAGTTGCGAGTTCTGTGAACAGCGCTTCACTGAGAAGGGGCCCCTCCTGAGGCACGTGGCCAGCCG  1628

Query 1629  CCATCAGGAGGGCCGGCCCCACTTCTGCCAGATATGCGGCAAGACCTTCAAAGCCGTGGAGCAACTGCGTGTGC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCATCAGGAGGGCCGGCCCCACTTCTGCCAGATATGCGGCAAGACCTTCAAAGCCGTGGAGCAACTGCGTGTGC  1702

Query 1703  ACGTCAGACGGCACAAGGGGGTGAGGAAGTTTGAGTGCACCGAGTGTGGCTACAAGTTTACCCGACAGGCCCAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACGTCAGACGGCACAAGGGGGTGAGGAAGTTTGAGTGCACCGAGTGTGGCTACAAGTTTACCCGACAGGCCCAC  1776

Query 1777  CTGCGGAGGCACATGGAGATCCACGACCGGGTAGAGAACTACAACCCGCGGCAGCGCAAGCTCCGCAACCTGAT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTGCGGAGGCACATGGAGATCCACGACCGGGTAGAGAACTACAACCCGCGGCAGCGCAAGCTCCGCAACCTGAT  1850

Query 1851  CATCGAGGACGAGAAGATGGTGGTGGTGGCGCTGCAGCCGCCTGCAGAGCTGGAGGTGGGCTCGGCGGAGGTCA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CATCGAGGACGAGAAGATGGTGGTGGTGGCGCTGCAGCCGCCTGCAGAGCTGGAGGTGGGCTCGGCGGAGGTCA  1924

Query 1925  TTGTGGAGTCCCTGGCCCAGGGCGGCCTGGCCTCCCAGCTCCCCGGCCAGAGACTGTGTGCAGAGGAGAGCTTC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TTGTGGAGTCCCTGGCCCAGGGCGGCCTGGCCTCCCAGCTCCCCGGCCAGAGACTGTGTGCAGAGGAGAGCTTC  1998

Query 1999  ACCGGCCCAGGTGTCCTGGAGCCCTCCCTCATCATCACAGCTGCTGTCCCCGAGGACTGTGACACA  2064
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ACCGGCCCAGGTGTCCTGGAGCCCTCCCTCATCATCACAGCTGCTGTCCCCGAGGACTGTGACACA  2064