Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470716
- Subject:
- XM_017319884.1
- Aligned Length:
- 2157
- Identities:
- 1789
- Gaps:
- 117
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGTGCAAGTGTCCATCTCACTCTCGGTCCAAAAGGGCTTTTCCGATTGGGGCTGAGCAGAGGGGTCATGTTTG 74
Query 1 ----------------ATGGACGGCTCCTTCGTCCAGCACAGTGTGAGGGTTCTGCAGGAGCTCAACAAGCAGC 58
||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 75 CCTTCCCTTTCAGATTATGGACGGTTCCTTCGTGCAGCACAGCGTGAGGGTTCTGCAGGAACTCAACAAGCAGC 148
Query 59 GGGAGAAGGGCCAGTACTGCGACGCCACTCTGGACGTGGGGGGCCTGGTGTTTAAGGCACACTGGAGTGTCCTT 132
|.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 149 GCGAGAAGGGCCAGTATTGCGACGCCACACTGGACGTGGGGGGCCTGGTGTTCAAGGCGCACTGGAGTGTCCTG 222
Query 133 GCCTGCTGCAGTCACTTTTTCCAGAGCCTCTACGGGGATGGCTCAGGGGGCAGTGTCGTCCTCCCTGCTGGCTT 206
||.||.|||||.||.||.||||||||..||||||||||||||.||||||||||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct 223 GCGTGTTGCAGCCATTTCTTCCAGAGAATCTACGGGGATGGCACAGGGGGCAGCGTTGTCCTCCCAGCGGGCTT 296
Query 207 CGCTGAGATCTTTGGCCTCTTGTTGGACTTTTTCTACACTGGTCACCTCGCTCTCACCTCAGGGAACCGGGATC 280
.||||||||.|||||||||.||.|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.||||||
Sbjct 297 TGCTGAGATTTTTGGCCTCCTGCTGGACTTTTTCTACACTGGCCACCTCGCCCTCACCTCAGGGAACAGGGATC 370
Query 281 AGGTGCTCCTGGCAGCCAGGGAGTTGCGAGTGCCAGAGGCCGTAGAGCTGTGCCAGAGCTTCAAGCCCAAAACT 354
||||.|||.|||||||||..||||||.|.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||.|||||.||||.
Sbjct 371 AGGTACTCTTGGCAGCCAAAGAGTTGAGGGTGCCTGAGGCTGTGGAGCTATGTCAGAGCTTCCAGCCCCAAACC 444
Query 355 TCAGTGGGACAGGCAGCAGGTGGCCAGAGTGGGCTGGGGCCCCCTGCCTCCCAGAATGTGAACAGCCACGTCAA 428
||||||||||||||| ||||||||.|||||.|..||||||||||||.|.|||||.||||||.|.||
Sbjct 445 TCAGTGGGACAGGCA---------CAGAGTGGACTGGGTCAACCTGCCTCCCAGGACGTGAAAAGCCACCTGAA 509
Query 429 GGAGCCGGCAGGCTTGGAAGAAGAGGAAGTTTCGAGGACTCTGGGTCTAGTCCCCAGGGATCAGGAGCCCAGAG 502
|||||||.|||.||||||.||.||||||||||..|||||||||.|.||.|.|.||..|||||||||||||||||
Sbjct 510 GGAGCCGACAGACTTGGATGAGGAGGAAGTTTTCAGGACTCTGAGCCTGGCCTCCGTGGATCAGGAGCCCAGAG 583
Query 503 GCAGTCATAGTCCTCAGAGGCCCCAGCTCCATTCCCCAGCTCAGAGTGAGGGCCCC---TCCTCCCTCTGTGGG 573
.|| ||.||..|||||||||...|.|.||.||||||| ||.|| .|||.||||||||||
Sbjct 584 ACA---------CTGAGCAGCCCCAGCTGGGTACACCTGCTCAGA------GCACCACGGCCTTCCTCTGTGGG 642
Query 574 AAACTGAAGCAGGCCTTGAAGCCTTGTCCCCTTGAGGACAAGAAACCCGAGGACTGCAAAGTGCCCCCAAGGCC 647
|||||.|.||||||.||||||||||.||||...||||||||..|..|.|||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 643 AAACTCACGCAGGCTTTGAAGCCTTCTCCCTCAGAGGACAAAGAGTCTGAGGACTGCAAAGAGCCCCCAAGGCC 716
Query 648 CTTAGAGGCTGAAGGTGCCCAGCTGCAGGGCGGCAGTAATGAGTGGGAAGTGGTGGTTCAAGTGGAGGATGATG 721
|||.|||||||.||||||||.|||||||||||..||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||..
Sbjct 717 CTTCGAGGCTGGAGGTGCCCCGCTGCAGGGCGAGAGCAATGAGTGGGAAGTGGTGGTCCAAGTGGAGGACGACA 790
Query 722 GGGATGGCGATTACATGTCTGAGCCTGAGGCTGTGCTGACCAGGAGGAAGTCAAATGTAATCCGAAAGCCCTGT 795
||||.||.||||||.|.||||||||||||.|||||||.|||||.|||||||||||.||.||..||||.||||||
Sbjct 791 GGGACGGTGATTACGTATCTGAGCCTGAGACTGTGCTAACCAGAAGGAAGTCAAAAGTGATTAGAAAACCCTGT 864
Query 796 GCAGCTGAGCCAGCCCTGAGCGCGGGCTCCCTAGCAGCTGAGCCTGCTGAGAACAGAAAAGGTACAGCGGTGCC 869
|||||.||||||||||||.|.|||||.||.||..||||.|||||..||||.|.||||||||||.||||.||.||
Sbjct 865 GCAGCCGAGCCAGCCCTGGGTGCGGGTTCTCTCACAGCCGAGCCCACTGACAGCAGAAAAGGTGCAGCCGTTCC 938
Query 870 GGTCGAATGCCCCACATGTCATAAAAAGTTCCTCAGCAAATATTATCTAAAAGTCCACAACAGGAAACATACTG 943
|||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 939 GGTCGAATGTCCCACATGTCACAAAAAGTTCCTCAGCAAATATTACCTGAAAGTCCACAACAGGAAACACACTG 1012
Query 944 GGGAGAAACCCTTTGAGTGTCCCAAATGTGGGAAGTGTTACTTTCGGAAGGAGAACCTCCTGGAGCATGAAGCC 1017
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||.||||.|||||||||
Sbjct 1013 GGGAGAAACCCTTCGAGTGTCCCAAATGTGGGAAGTGTTACTTCCGCAAGGAGAATCTCTTGGAACATGAAGCC 1086
Query 1018 CGGAATTGCATGAACCGCTCGGAACAGGTCTTCACGTGCTCTGTGTGCCAGGAGACATTCCGCCGAAGGATGGA 1091
.|||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1087 AGGAATTGCATGAACCGCTCAGAACAGGTCTTCACATGCTCCGTATGCCAGGAGACCTTCCGACGGAGGATGGA 1160
Query 1092 GCTGCGGGTGCACATGGTGTCTCACACAGGGGAGATGCCCTACAAGTGTTCCTCCTGCTCCCAGCAGTTCATGC 1165
||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1161 GCTGCGCTTGCACATGGTGTCTCACACAGGGGAGATGCCCTACAAGTGTTCCTCCTGCTCCCAGCAGTTCATGC 1234
Query 1166 AGAAGAAGGACTTGCAGAGCCACATGATCAAACTTCATGGAGCCCCCAAGCCCCATGCATGCCCCACCTGTGCC 1239
|||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1235 AGAAGAAAGACTTGCAGAGCCACATGATCAAGCTGCACGGAGCCCCTAAACCCCACGCATGCCCCACTTGTGCC 1308
Query 1240 AAGTGCTTCCTGTCTCGGACAGAGCTGCAGCTGCATGAAGCTTTCAAGCACCGTGGTGAGAAGCTGTTTGTGTG 1313
|||||||||||||||.||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1309 AAGTGCTTCCTGTCTAGGACGGAGCTACAGCTGCACGAGGCTTTTAAGCATCGTGGAGAAAAGCTCTTTGTGTG 1382
Query 1314 TGAGGAGTGTGGGCACCGGGCCTCGAGCCGGAATGGCCTGCAGATGCACATCAAGGCCAAGCACAGGAATGAGA 1387
||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1383 TGAGGAATGCGGGCACCGGGCCTCGAGCCGCAACGGACTGCAGATGCACATCAAGGCCAAGCACAGGAATGAAA 1456
Query 1388 GGCCACACGTATGTGAGTTCTGCAGCCACGCCTTCACCCAAAAGGCCAATCTCAACATGCACCTGCGCACACAC 1461
||||..|.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1457 GGCCTTATGTCTGTGAGTTCTGCAGCCATGCCTTCACCCAGAAGGCCAACCTCAACATGCACCTGCGCACACAC 1530
Query 1462 ACGGGTGAGAAGCCCTTCCAGTGCCACCTCTGTGGCAAGACCTTCCGAACCCAAGCCAGCCTGGACAAGCACAA 1535
||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||..|||||||||||||
Sbjct 1531 ACCGGCGAGAAGCCTTTCCAGTGCCACCTCTGTGGGAAGACCTTCCGCACCCAAGCCAGTTTGGACAAGCACAA 1604
Query 1536 CCGCACCCACACCGGGGAAAGGCCCTTCAGTTGCGAGTTCTGTGAACAGCGCTTCACTGAGAAGGGGCCCCTCC 1609
||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1605 CCGCACCCACACGGGCGAGAGGCCTTTCAGCTGTGAATTCTGTGAGCAGCGCTTCACTGAGAAGGGCCCCCTTC 1678
Query 1610 TGAGGCACGTGGCCAGCCGCCATCAGGAGGGCCGGCCCCACTTCTGCCAGATATGCGGCAAGACCTTCAAAGCC 1683
|||||||.|||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1679 TGAGGCATGTGGCCAGCCGCCATCAAGAGGGCAGGCCCCACTTCTGCCAGATCTGTGGCAAGACCTTCAAAGCT 1752
Query 1684 GTGGAGCAACTGCGTGTGCACGTCAGACGGCACAAGGGGGTGAGGAAGTTTGAGTGCACCGAGTGTGGCTACAA 1757
|||||.||..|.||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1753 GTGGAACAGTTACGAGTGCACGTCAGGCGACACAAAGGTGTGAGAAAGTTCGAGTGCACCGAGTGTGGCTACAA 1826
Query 1758 GTTTACCCGACAGGCCCACCTGCGGAGGCACATGGAGATCCACGACCGGGTAGAGAACTACAACCCGCGGCAGC 1831
|||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1827 GTTCACGCGGCAGGCTCACCTGCGGAGGCACATGGAGATCCACGACAGAGTGGAGAACTACAATCCCCGGCAGC 1900
Query 1832 GCAAGCTCCGCAACCTGATCATCGAGGACGAGAAGATGGTGGTGGTGGCGCTGCAGCCGCCTGCAGAGCTGGAG 1905
||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 1901 GCAAGCTCCGGAACCTCATCATTGAGGATGAGAAGATGGTGGTCGTGGCTCTCCAGCCCCCTGCAGACCTGGAG 1974
Query 1906 GTGGGCTCGGCGGAGGTCATTGTGGAGTCCCTGGCCCAGGGCGGCCTGGCCTCCCAGCTCCCCGGCCAGAGACT 1979
||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||||||||.|||||..||||||||||
Sbjct 1975 GTGGGCTCTGCTGAGGTCATTGTGGAGTCCCTGACCCAGGGTGGCCTTGCCTCCCAACTCCCTAGCCAGAGACT 2048
Query 1980 GTGTGCAGAGGAGAGCTTCACCGGCCCAGGTGTCCTGGAGCCCTCCCTCATCATCACAGCTGCTGTCCCCGAGG 2053
||||.|||||||||||||..|..||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 2049 GTGTTCAGAGGAGAGCTTTGCTAGCCCTGGCGTCCTGGAGCCCTCTCTCATCATCACCGCTGCTGTTCCCGAGG 2122
Query 2054 ACTGTGACACA 2064
||||||||||.
Sbjct 2123 ACTGTGACACG 2133