Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000470716
- Subject:
- XR_001737135.2
- Aligned Length:
- 2281
- Identities:
- 2060
- Gaps:
- 221
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ACGCTTTGACGTCACGTCCGGCGCGGAGACGGTGGAGTCTCCGCACTGTCGGCGGGGTACGCATAGCCGGGCAC 74
Query 1 ------------------------------------------------------------------------AT 2
||
Sbjct 75 TAGGAGCTTTCTCTTGCATACCCTCGCTTAGGCTGGCCGGGGTGTCACTTCTGCCTCCCTGCCCTCCAGACCAT 148
Query 3 GGACGGCTCCTTCGTCCAGCACAGTGTGAGGGTTCTGCAGGAGCTCAACAAGCAGCGGGAGAAGGGCCAGTACT 76
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GGACGGCTCCTTCGTCCAGCACAGTGTGAGGGTTCTGCAGGAGCTCAACAAGCAGCGGGAGAAGGGCCAGTACT 222
Query 77 GCGACGCCACTCTGGACGTGGGGGGCCTGGTGTTTAAGGCACACTGGAGTGTCCTTGCCTGCTGCAGTCACTTT 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCGACGCCACTCTGGACGTGGGGGGCCTGGTGTTTAAGGCACACTGGAGTGTCCTTGCCTGCTGCAGTCACTTT 296
Query 151 TTCCAGAGCCTCTACGGGGATGGCTCAGGGGGCAGTGTCGTCCTCCCTGCTGGCTTCGCTGAGATCTTTGGCCT 224
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTCCAGAGCCTCTACGGGGATGGCTCAGGGGGCAGTGTCGTCCTCCCTGCTGGCTTCGCTGAGATCTTTGGCCT 370
Query 225 CTTGTTGGACTTTTTCTACACTGGTCACCTCGCTCTCACCTCAGGGAACCGGGATCAGGTGCTCCTGGCAGCCA 298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTTGTTGGACTTTTTCTACACTGGTCACCTCGCTCTCACCTCAGGGAACCGGGATCAGGTGCTCCTGGCAGCCA 444
Query 299 GGGAGTTGCGAGTGCCAGAGGCCGTAGAGCTGTGCCAGAGCTTCAAGCCCAAAACTTCAGTGGGACAGGCAGCA 372
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGGAGTTGCGAGTGCCAGAGGCCGTAGAGCTGTGCCAGAGCTTCAAGCCCAAAACTTCAGTGGGACAGGCAGCA 518
Query 373 GGTGGCCAGAGTGGGCTGGGGCCCCCTGCCTCCCAGAATGTGAACAGCCACGTCAAGGAGCCGGCAGGCTTGGA 446
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGTGGCCAGAGTGGGCTGGGGCCCCCTGCCTCCCAGAATGTGAACAGCCACGTCAAGGAGCCGGCAGGCTTGGA 592
Query 447 AGAAGAGGAAGTTTCGAGGACTCTGGGTCTAGTCCCCAGGGATCAGGAGCCCAGAGGCAGTCATAGTCCTCAGA 520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGAAGAGGAAGTTTCGAGGACTCTGGGTCTAGTCCCCAGGGATCAGGAGCCCAGAGGCAGTCATAGTCCTCAGA 666
Query 521 GGCCCCAGCTCCATTCCCCAGCTCAGAGTGAGGGCCCCTCCTCCCTCTGTGGGAAACTGAAGCAGGCCTTGAAG 594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGCCCCAGCTCCATTCCCCAGCTCAGAGTGAGGGCCCCTCCTCCCTCTGTGGGAAACTGAAGCAGGCCTTGAAG 740
Query 595 CCTTGTCCCCTTGAGGACAAGAAACCCGAGGACTGCAAAGTGCCCCCAAGGCCCTTAGAGGCTGAAGGTGCCCA 668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCTTGTCCCCTTGAGGACAAGAAACCCGAGGACTGCAAAGTGCCCCCAAGGCCCTTAGAGGCTGAAGGTGCCCA 814
Query 669 GCTGCAGGGCGGCAGTAATGAGTGGGAAGTGGTGGTTCAAGTGGAGGATGATGGGGATGGCGATTACATGTCTG 742
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCTGCAGGGCGGCAGTAATGAGTGGGAAGTGGTGGTTCAAGTGGAGGATGATGGGGATGGCGATTACATGTCTG 888
Query 743 AGCCTGAGGCTGTGCTGACCAGGAGGAAGTCAAATGTAATCCGAAAGCCCTGTGCAGCTGAGCCAGCCCTGAGC 816
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGCCTGAGGCTGTGCTGACCAGGAGGAAGTCAAATGTAATCCGAAAGCCCTGTGCAGCTGAGCCAGCCCTGAGC 962
Query 817 GCGGGCTCCCTAGCAGCTGAGCCTGCTGAGAACAGAAAAGGTACAGCGGTGCCGGTCGAATGCCCCACATGTCA 890
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCGGGCTCCCTAGCAGCTGAGCCTGCTGAGAACAGAAAAGGTACAGCGGTGCCGGTCGAATGCCCCACATGTCA 1036
Query 891 TAAAAAGTTCCTCAGCAAATATTATCTAAAAGTCCACAACAGGAAACATACTGGGGAGAAACCCTTTGAGTGTC 964
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TAAAAAGTTCCTCAGCAAATATTATCTAAAAGTCCACAACAGGAAACATACTGGGGAGAAACCCTTTGAGTGTC 1110
Query 965 CCAAATGTGGGAAGTGTTACTTTCGGAAGGAGAACCTCCTGGAGCATGAAGCCCGGAATTGCATGAACCGCTCG 1038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CCAAATGTGGGAAGTGTTACTTTCGGAAGGAGAACCTCCTGGAGCATGAAGCCCGGAATTGCATGAACCGCTCG 1184
Query 1039 GAACAGGTCTTCACGTGCTCTGTGTGCCAGGAGACATTCCGCCGAAGGATGGAGCTGCGGGTGCACATGGTGTC 1112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GAACAGGTCTTCACGTGCTCTGTGTGCCAGGAGACATTCCGCCGAAGGATGGAGCTGCGGGTGCACATGGTGTC 1258
Query 1113 TCACACAGGGGAGATGCCCTACAAGTGTTCCTCCTGCTCCCAGCAGTTCATGCAGAAGAAGGACTTGCAGAGCC 1186
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCACACAGGGGAGATGCCCTACAAGTGTTCCTCCTGCTCCCAGCAGTTCATGCAGAAGAAGGACTTGCAGAGCC 1332
Query 1187 ACATGATCAAACTTCATGGAGCCCCCAAGCCCCATGCATGCCCCACCTGTGCCAAGTGCTTCCTGTCTCGGACA 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACATGATCAAACTTCATGGAGCCCCCAAGCCCCATGCATGCCCCACCTGTGCCAAGTGCTTCCTGTCTCGGACA 1406
Query 1261 GAGCTGCAGCTGCATGAAGCTTTCAAGCACCGTGGTGAGAAGCTGTTTGTGTGTGAGGAGTGTGGGCACCGGGC 1334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GAGCTGCAGCTGCATGAAGCTTTCAAGCACCGTGGTGAGAAGCTGTTTGTGTGTGAGGAGTGTGGGCACCGGGC 1480
Query 1335 CTCGAGCCGGAATGGCCTGCAGATGCACATCAAGGCCAAGCACAGGAATGAGAGGCCACACGTATGTGAGTTCT 1408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTCGAGCCGGAATGGCCTGCAGATGCACATCAAGGCCAAGCACAGGAATGAGAGGCCACACGTATGTGAGTTCT 1554
Query 1409 GCAGCCACGCCTTCACCCAAAAGGCCAATCTCAACATGCACCTGCGCACACACACGGGTGAGAAGCCCTTCCAG 1482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GCAGCCACGCCTTCACCCAAAAGGCCAATCTCAACATGCACCTGCGCACACACACGGGTGAGAAGCCCTTCCAG 1628
Query 1483 TGCCACCTCTGTGGCAAGACCTTCCGAACCCAAGCCAGCCTGGACAAGCACAACCGCACCCACACCGGGGAAAG 1556
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TGCCACCTCTGTGGCAAGACCTTCCGAACCCA----AGCCTGGACAAGCACAACCGCACCCACACCGGGGAAAG 1698
Query 1557 GCCCTTCAGTTGCGAGTTCTGTGAACAGCGCTTCACTGAGAAGGGGCCCCTCCTGAGGCACGTGGCCAGCCGCC 1630
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699 GCCCTTCAGTTGCGAGTTCTGTGAACAGCGCTTCACTGAGAAGGGGCCCCTCCTGAGGCACGTGGCCAGCCGCC 1772
Query 1631 ATCAGGAGGGCCGGCCCCACTTCTGCCAGATATGCGGCAAGACCTTCAAAGCCGTGGAGCAACTGCGTGTGCAC 1704
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773 ATCAGGAGGGCCGGCCCCACTTCTGCCAGATATGCGGCAAGACCTTCAAAGCCGTGGAGCAACTGCGTGTGCAC 1846
Query 1705 GTCAGACGGCACAAGGGGGTGAGGAAGTTTGAGTGCACCGAGTGTGGCTACAAGTTTACCCGACAGGCCCACCT 1778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847 GTCAGACGGCACAAGGGGGTGAGGAAGTTTGAGTGCACCGAGTGTGGCTACAAGTTTACCCGACAGGCCCACCT 1920
Query 1779 GCGGAGGCACATGGAGATCCACGACCGGGTAGAGAACTACAACCCGCGGCAGCGCAAGCTCCGCAACCTGATCA 1852
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 GCGGAGGCACATGGAGATCCACGACCGGGTAGAGAACTACAACCCGCGGCAGCGCAAGCTCCGCAACCTGATCA 1994
Query 1853 TCGAGGACGAGAAGATGGTGGTGGTGGCGCTGCAGCCGCCTGCAGAGCTGGAGGTGGGCTCGGCGGAGGTCATT 1926
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995 TCGAGGACGAGAAGATGGTGGTGGTGGCGCTGCAGCCGCCTGCAGAGCTGGAGGTGGGCTCGGCGGAGGTCATT 2068
Query 1927 GTGGAGTCCCTGGCCCAGGGCGGCCTGGCCTCCCAGCTCCCCGGCCAGAGACTGTGTGCAGAGGAGAGCTTCAC 2000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069 GTGGAGTCCCTGGCCCAGGGCGGCCTGGCCTCCCAGCTCCCCGGCCAGAGACTGTGTGCAGAGGAGAGCTTCAC 2142
Query 2001 CGGCCCAGGTGTCCTGGAGCCCTCCCTCATCATCACAGCTGCTGTCCCCGAGGACTGTGACACA---------- 2064
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2143 CGGCCCAGGTGTCCTGGAGCCCTCCCTCATCATCACAGCTGCTGTCCCCGAGGACTGTGACACATAGCCCATTC 2216
Query 2065 ------------------------------------------------------------- 2064
Sbjct 2217 TGGCCACCAGAGCCCACTTGGCCCCACCCCTCAATAAACCGTGTGGCTTTGGACTCTCGTA 2277