Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470716
• Subject: XR_001737136.1
• Aligned Length: 2260
• Identities: 2060
• Gaps: 200

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ACGCTTTGACGTCACGTCCGGCGCGGAGACGGTGGAGTCTCCGCACTGTCGGCGGGGAGCTTTCTCTTGCATAC  74

Query    1  ---------------------------------------------------ATGGACGGCTCCTTCGTCCAGCA  23
                                                               |||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTCGCTTAGGCTGGCCGGGGTGTCACTTCTGCCTCCCTGCCCTCCAGACCATGGACGGCTCCTTCGTCCAGCA  148

Query   24  CAGTGTGAGGGTTCTGCAGGAGCTCAACAAGCAGCGGGAGAAGGGCCAGTACTGCGACGCCACTCTGGACGTGG  97
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGTGTGAGGGTTCTGCAGGAGCTCAACAAGCAGCGGGAGAAGGGCCAGTACTGCGACGCCACTCTGGACGTGG  222

Query   98  GGGGCCTGGTGTTTAAGGCACACTGGAGTGTCCTTGCCTGCTGCAGTCACTTTTTCCAGAGCCTCTACGGGGAT  171
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGGCCTGGTGTTTAAGGCACACTGGAGTGTCCTTGCCTGCTGCAGTCACTTTTTCCAGAGCCTCTACGGGGAT  296

Query  172  GGCTCAGGGGGCAGTGTCGTCCTCCCTGCTGGCTTCGCTGAGATCTTTGGCCTCTTGTTGGACTTTTTCTACAC  245
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCTCAGGGGGCAGTGTCGTCCTCCCTGCTGGCTTCGCTGAGATCTTTGGCCTCTTGTTGGACTTTTTCTACAC  370

Query  246  TGGTCACCTCGCTCTCACCTCAGGGAACCGGGATCAGGTGCTCCTGGCAGCCAGGGAGTTGCGAGTGCCAGAGG  319
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGTCACCTCGCTCTCACCTCAGGGAACCGGGATCAGGTGCTCCTGGCAGCCAGGGAGTTGCGAGTGCCAGAGG  444

Query  320  CCGTAGAGCTGTGCCAGAGCTTCAAGCCCAAAACTTCAGTGGGACAGGCAGCAGGTGGCCAGAGTGGGCTGGGG  393
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCGTAGAGCTGTGCCAGAGCTTCAAGCCCAAAACTTCAGTGGGACAGGCAGCAGGTGGCCAGAGTGGGCTGGGG  518

Query  394  CCCCCTGCCTCCCAGAATGTGAACAGCCACGTCAAGGAGCCGGCAGGCTTGGAAGAAGAGGAAGTTTCGAGGAC  467
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCCCCTGCCTCCCAGAATGTGAACAGCCACGTCAAGGAGCCGGCAGGCTTGGAAGAAGAGGAAGTTTCGAGGAC  592

Query  468  TCTGGGTCTAGTCCCCAGGGATCAGGAGCCCAGAGGCAGTCATAGTCCTCAGAGGCCCCAGCTCCATTCCCCAG  541
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCTGGGTCTAGTCCCCAGGGATCAGGAGCCCAGAGGCAGTCATAGTCCTCAGAGGCCCCAGCTCCATTCCCCAG  666

Query  542  CTCAGAGTGAGGGCCCCTCCTCCCTCTGTGGGAAACTGAAGCAGGCCTTGAAGCCTTGTCCCCTTGAGGACAAG  615
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTCAGAGTGAGGGCCCCTCCTCCCTCTGTGGGAAACTGAAGCAGGCCTTGAAGCCTTGTCCCCTTGAGGACAAG  740

Query  616  AAACCCGAGGACTGCAAAGTGCCCCCAAGGCCCTTAGAGGCTGAAGGTGCCCAGCTGCAGGGCGGCAGTAATGA  689
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAACCCGAGGACTGCAAAGTGCCCCCAAGGCCCTTAGAGGCTGAAGGTGCCCAGCTGCAGGGCGGCAGTAATGA  814

Query  690  GTGGGAAGTGGTGGTTCAAGTGGAGGATGATGGGGATGGCGATTACATGTCTGAGCCTGAGGCTGTGCTGACCA  763
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTGGGAAGTGGTGGTTCAAGTGGAGGATGATGGGGATGGCGATTACATGTCTGAGCCTGAGGCTGTGCTGACCA  888

Query  764  GGAGGAAGTCAAATGTAATCCGAAAGCCCTGTGCAGCTGAGCCAGCCCTGAGCGCGGGCTCCCTAGCAGCTGAG  837
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGAGGAAGTCAAATGTAATCCGAAAGCCCTGTGCAGCTGAGCCAGCCCTGAGCGCGGGCTCCCTAGCAGCTGAG  962

Query  838  CCTGCTGAGAACAGAAAAGGTACAGCGGTGCCGGTCGAATGCCCCACATGTCATAAAAAGTTCCTCAGCAAATA  911
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCTGCTGAGAACAGAAAAGGTACAGCGGTGCCGGTCGAATGCCCCACATGTCATAAAAAGTTCCTCAGCAAATA  1036

Query  912  TTATCTAAAAGTCCACAACAGGAAACATACTGGGGAGAAACCCTTTGAGTGTCCCAAATGTGGGAAGTGTTACT  985
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTATCTAAAAGTCCACAACAGGAAACATACTGGGGAGAAACCCTTTGAGTGTCCCAAATGTGGGAAGTGTTACT  1110

Query  986  TTCGGAAGGAGAACCTCCTGGAGCATGAAGCCCGGAATTGCATGAACCGCTCGGAACAGGTCTTCACGTGCTCT  1059
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTCGGAAGGAGAACCTCCTGGAGCATGAAGCCCGGAATTGCATGAACCGCTCGGAACAGGTCTTCACGTGCTCT  1184

Query 1060  GTGTGCCAGGAGACATTCCGCCGAAGGATGGAGCTGCGGGTGCACATGGTGTCTCACACAGGGGAGATGCCCTA  1133
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTGTGCCAGGAGACATTCCGCCGAAGGATGGAGCTGCGGGTGCACATGGTGTCTCACACAGGGGAGATGCCCTA  1258

Query 1134  CAAGTGTTCCTCCTGCTCCCAGCAGTTCATGCAGAAGAAGGACTTGCAGAGCCACATGATCAAACTTCATGGAG  1207
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAAGTGTTCCTCCTGCTCCCAGCAGTTCATGCAGAAGAAGGACTTGCAGAGCCACATGATCAAACTTCATGGAG  1332

Query 1208  CCCCCAAGCCCCATGCATGCCCCACCTGTGCCAAGTGCTTCCTGTCTCGGACAGAGCTGCAGCTGCATGAAGCT  1281
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCCCCAAGCCCCATGCATGCCCCACCTGTGCCAAGTGCTTCCTGTCTCGGACAGAGCTGCAGCTGCATGAAGCT  1406

Query 1282  TTCAAGCACCGTGGTGAGAAGCTGTTTGTGTGTGAGGAGTGTGGGCACCGGGCCTCGAGCCGGAATGGCCTGCA  1355
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TTCAAGCACCGTGGTGAGAAGCTGTTTGTGTGTGAGGAGTGTGGGCACCGGGCCTCGAGCCGGAATGGCCTGCA  1480

Query 1356  GATGCACATCAAGGCCAAGCACAGGAATGAGAGGCCACACGTATGTGAGTTCTGCAGCCACGCCTTCACCCAAA  1429
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GATGCACATCAAGGCCAAGCACAGGAATGAGAGGCCACACGTATGTGAGTTCTGCAGCCACGCCTTCACCCAAA  1554

Query 1430  AGGCCAATCTCAACATGCACCTGCGCACACACACGGGTGAGAAGCCCTTCCAGTGCCACCTCTGTGGCAAGACC  1503
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGGCCAATCTCAACATGCACCTGCGCACACACACGGGTGAGAAGCCCTTCCAGTGCCACCTCTGTGGCAAGACC  1628

Query 1504  TTCCGAACCCAAGCCAGCCTGGACAAGCACAACCGCACCCACACCGGGGAAAGGCCCTTCAGTTGCGAGTTCTG  1577
            |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TTCCGAACCCA----AGCCTGGACAAGCACAACCGCACCCACACCGGGGAAAGGCCCTTCAGTTGCGAGTTCTG  1698

Query 1578  TGAACAGCGCTTCACTGAGAAGGGGCCCCTCCTGAGGCACGTGGCCAGCCGCCATCAGGAGGGCCGGCCCCACT  1651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699  TGAACAGCGCTTCACTGAGAAGGGGCCCCTCCTGAGGCACGTGGCCAGCCGCCATCAGGAGGGCCGGCCCCACT  1772

Query 1652  TCTGCCAGATATGCGGCAAGACCTTCAAAGCCGTGGAGCAACTGCGTGTGCACGTCAGACGGCACAAGGGGGTG  1725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773  TCTGCCAGATATGCGGCAAGACCTTCAAAGCCGTGGAGCAACTGCGTGTGCACGTCAGACGGCACAAGGGGGTG  1846

Query 1726  AGGAAGTTTGAGTGCACCGAGTGTGGCTACAAGTTTACCCGACAGGCCCACCTGCGGAGGCACATGGAGATCCA  1799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847  AGGAAGTTTGAGTGCACCGAGTGTGGCTACAAGTTTACCCGACAGGCCCACCTGCGGAGGCACATGGAGATCCA  1920

Query 1800  CGACCGGGTAGAGAACTACAACCCGCGGCAGCGCAAGCTCCGCAACCTGATCATCGAGGACGAGAAGATGGTGG  1873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921  CGACCGGGTAGAGAACTACAACCCGCGGCAGCGCAAGCTCCGCAACCTGATCATCGAGGACGAGAAGATGGTGG  1994

Query 1874  TGGTGGCGCTGCAGCCGCCTGCAGAGCTGGAGGTGGGCTCGGCGGAGGTCATTGTGGAGTCCCTGGCCCAGGGC  1947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995  TGGTGGCGCTGCAGCCGCCTGCAGAGCTGGAGGTGGGCTCGGCGGAGGTCATTGTGGAGTCCCTGGCCCAGGGC  2068

Query 1948  GGCCTGGCCTCCCAGCTCCCCGGCCAGAGACTGTGTGCAGAGGAGAGCTTCACCGGCCCAGGTGTCCTGGAGCC  2021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069  GGCCTGGCCTCCCAGCTCCCCGGCCAGAGACTGTGTGCAGAGGAGAGCTTCACCGGCCCAGGTGTCCTGGAGCC  2142

Query 2022  CTCCCTCATCATCACAGCTGCTGTCCCCGAGGACTGTGACACA-------------------------------  2064
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct 2143  CTCCCTCATCATCACAGCTGCTGTCCCCGAGGACTGTGACACATAGCCCATTCTGGCCACCAGAGCCCACTTGG  2216

Query 2065  ----------------------------------------  2064
                                                    
Sbjct 2217  CCCCACCCCTCAATAAACCGTGTGGCTTTGGACTCTCGTA  2256