Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470716
• Subject: XR_946621.3
• Aligned Length: 2226
• Identities: 2060
• Gaps: 166

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  AGCTCAGGGAGGACCTGCCTGGGAGCTTTCTCTTGCATACCCTCGCTTAGGCTGGCCGGGGTGTCACTTCTGCC  74

Query    1  -----------------ATGGACGGCTCCTTCGTCCAGCACAGTGTGAGGGTTCTGCAGGAGCTCAACAAGCAG  57
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCCCTGCCCTCCAGACCATGGACGGCTCCTTCGTCCAGCACAGTGTGAGGGTTCTGCAGGAGCTCAACAAGCAG  148

Query   58  CGGGAGAAGGGCCAGTACTGCGACGCCACTCTGGACGTGGGGGGCCTGGTGTTTAAGGCACACTGGAGTGTCCT  131
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGGGAGAAGGGCCAGTACTGCGACGCCACTCTGGACGTGGGGGGCCTGGTGTTTAAGGCACACTGGAGTGTCCT  222

Query  132  TGCCTGCTGCAGTCACTTTTTCCAGAGCCTCTACGGGGATGGCTCAGGGGGCAGTGTCGTCCTCCCTGCTGGCT  205
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGCCTGCTGCAGTCACTTTTTCCAGAGCCTCTACGGGGATGGCTCAGGGGGCAGTGTCGTCCTCCCTGCTGGCT  296

Query  206  TCGCTGAGATCTTTGGCCTCTTGTTGGACTTTTTCTACACTGGTCACCTCGCTCTCACCTCAGGGAACCGGGAT  279
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCGCTGAGATCTTTGGCCTCTTGTTGGACTTTTTCTACACTGGTCACCTCGCTCTCACCTCAGGGAACCGGGAT  370

Query  280  CAGGTGCTCCTGGCAGCCAGGGAGTTGCGAGTGCCAGAGGCCGTAGAGCTGTGCCAGAGCTTCAAGCCCAAAAC  353
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGGTGCTCCTGGCAGCCAGGGAGTTGCGAGTGCCAGAGGCCGTAGAGCTGTGCCAGAGCTTCAAGCCCAAAAC  444

Query  354  TTCAGTGGGACAGGCAGCAGGTGGCCAGAGTGGGCTGGGGCCCCCTGCCTCCCAGAATGTGAACAGCCACGTCA  427
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTCAGTGGGACAGGCAGCAGGTGGCCAGAGTGGGCTGGGGCCCCCTGCCTCCCAGAATGTGAACAGCCACGTCA  518

Query  428  AGGAGCCGGCAGGCTTGGAAGAAGAGGAAGTTTCGAGGACTCTGGGTCTAGTCCCCAGGGATCAGGAGCCCAGA  501
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGAGCCGGCAGGCTTGGAAGAAGAGGAAGTTTCGAGGACTCTGGGTCTAGTCCCCAGGGATCAGGAGCCCAGA  592

Query  502  GGCAGTCATAGTCCTCAGAGGCCCCAGCTCCATTCCCCAGCTCAGAGTGAGGGCCCCTCCTCCCTCTGTGGGAA  575
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGCAGTCATAGTCCTCAGAGGCCCCAGCTCCATTCCCCAGCTCAGAGTGAGGGCCCCTCCTCCCTCTGTGGGAA  666

Query  576  ACTGAAGCAGGCCTTGAAGCCTTGTCCCCTTGAGGACAAGAAACCCGAGGACTGCAAAGTGCCCCCAAGGCCCT  649
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACTGAAGCAGGCCTTGAAGCCTTGTCCCCTTGAGGACAAGAAACCCGAGGACTGCAAAGTGCCCCCAAGGCCCT  740

Query  650  TAGAGGCTGAAGGTGCCCAGCTGCAGGGCGGCAGTAATGAGTGGGAAGTGGTGGTTCAAGTGGAGGATGATGGG  723
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TAGAGGCTGAAGGTGCCCAGCTGCAGGGCGGCAGTAATGAGTGGGAAGTGGTGGTTCAAGTGGAGGATGATGGG  814

Query  724  GATGGCGATTACATGTCTGAGCCTGAGGCTGTGCTGACCAGGAGGAAGTCAAATGTAATCCGAAAGCCCTGTGC  797
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GATGGCGATTACATGTCTGAGCCTGAGGCTGTGCTGACCAGGAGGAAGTCAAATGTAATCCGAAAGCCCTGTGC  888

Query  798  AGCTGAGCCAGCCCTGAGCGCGGGCTCCCTAGCAGCTGAGCCTGCTGAGAACAGAAAAGGTACAGCGGTGCCGG  871
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGCTGAGCCAGCCCTGAGCGCGGGCTCCCTAGCAGCTGAGCCTGCTGAGAACAGAAAAGGTACAGCGGTGCCGG  962

Query  872  TCGAATGCCCCACATGTCATAAAAAGTTCCTCAGCAAATATTATCTAAAAGTCCACAACAGGAAACATACTGGG  945
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCGAATGCCCCACATGTCATAAAAAGTTCCTCAGCAAATATTATCTAAAAGTCCACAACAGGAAACATACTGGG  1036

Query  946  GAGAAACCCTTTGAGTGTCCCAAATGTGGGAAGTGTTACTTTCGGAAGGAGAACCTCCTGGAGCATGAAGCCCG  1019
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GAGAAACCCTTTGAGTGTCCCAAATGTGGGAAGTGTTACTTTCGGAAGGAGAACCTCCTGGAGCATGAAGCCCG  1110

Query 1020  GAATTGCATGAACCGCTCGGAACAGGTCTTCACGTGCTCTGTGTGCCAGGAGACATTCCGCCGAAGGATGGAGC  1093
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAATTGCATGAACCGCTCGGAACAGGTCTTCACGTGCTCTGTGTGCCAGGAGACATTCCGCCGAAGGATGGAGC  1184

Query 1094  TGCGGGTGCACATGGTGTCTCACACAGGGGAGATGCCCTACAAGTGTTCCTCCTGCTCCCAGCAGTTCATGCAG  1167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCGGGTGCACATGGTGTCTCACACAGGGGAGATGCCCTACAAGTGTTCCTCCTGCTCCCAGCAGTTCATGCAG  1258

Query 1168  AAGAAGGACTTGCAGAGCCACATGATCAAACTTCATGGAGCCCCCAAGCCCCATGCATGCCCCACCTGTGCCAA  1241
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAGAAGGACTTGCAGAGCCACATGATCAAACTTCATGGAGCCCCCAAGCCCCATGCATGCCCCACCTGTGCCAA  1332

Query 1242  GTGCTTCCTGTCTCGGACAGAGCTGCAGCTGCATGAAGCTTTCAAGCACCGTGGTGAGAAGCTGTTTGTGTGTG  1315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTGCTTCCTGTCTCGGACAGAGCTGCAGCTGCATGAAGCTTTCAAGCACCGTGGTGAGAAGCTGTTTGTGTGTG  1406

Query 1316  AGGAGTGTGGGCACCGGGCCTCGAGCCGGAATGGCCTGCAGATGCACATCAAGGCCAAGCACAGGAATGAGAGG  1389
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGGAGTGTGGGCACCGGGCCTCGAGCCGGAATGGCCTGCAGATGCACATCAAGGCCAAGCACAGGAATGAGAGG  1480

Query 1390  CCACACGTATGTGAGTTCTGCAGCCACGCCTTCACCCAAAAGGCCAATCTCAACATGCACCTGCGCACACACAC  1463
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCACACGTATGTGAGTTCTGCAGCCACGCCTTCACCCAAAAGGCCAATCTCAACATGCACCTGCGCACACACAC  1554

Query 1464  GGGTGAGAAGCCCTTCCAGTGCCACCTCTGTGGCAAGACCTTCCGAACCCAAGCCAGCCTGGACAAGCACAACC  1537
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGGTGAGAAGCCCTTCCAGTGCCACCTCTGTGGCAAGACCTTCCGAACCCA----AGCCTGGACAAGCACAACC  1624

Query 1538  GCACCCACACCGGGGAAAGGCCCTTCAGTTGCGAGTTCTGTGAACAGCGCTTCACTGAGAAGGGGCCCCTCCTG  1611
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625  GCACCCACACCGGGGAAAGGCCCTTCAGTTGCGAGTTCTGTGAACAGCGCTTCACTGAGAAGGGGCCCCTCCTG  1698

Query 1612  AGGCACGTGGCCAGCCGCCATCAGGAGGGCCGGCCCCACTTCTGCCAGATATGCGGCAAGACCTTCAAAGCCGT  1685
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699  AGGCACGTGGCCAGCCGCCATCAGGAGGGCCGGCCCCACTTCTGCCAGATATGCGGCAAGACCTTCAAAGCCGT  1772

Query 1686  GGAGCAACTGCGTGTGCACGTCAGACGGCACAAGGGGGTGAGGAAGTTTGAGTGCACCGAGTGTGGCTACAAGT  1759
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773  GGAGCAACTGCGTGTGCACGTCAGACGGCACAAGGGGGTGAGGAAGTTTGAGTGCACCGAGTGTGGCTACAAGT  1846

Query 1760  TTACCCGACAGGCCCACCTGCGGAGGCACATGGAGATCCACGACCGGGTAGAGAACTACAACCCGCGGCAGCGC  1833
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847  TTACCCGACAGGCCCACCTGCGGAGGCACATGGAGATCCACGACCGGGTAGAGAACTACAACCCGCGGCAGCGC  1920

Query 1834  AAGCTCCGCAACCTGATCATCGAGGACGAGAAGATGGTGGTGGTGGCGCTGCAGCCGCCTGCAGAGCTGGAGGT  1907
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921  AAGCTCCGCAACCTGATCATCGAGGACGAGAAGATGGTGGTGGTGGCGCTGCAGCCGCCTGCAGAGCTGGAGGT  1994

Query 1908  GGGCTCGGCGGAGGTCATTGTGGAGTCCCTGGCCCAGGGCGGCCTGGCCTCCCAGCTCCCCGGCCAGAGACTGT  1981
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995  GGGCTCGGCGGAGGTCATTGTGGAGTCCCTGGCCCAGGGCGGCCTGGCCTCCCAGCTCCCCGGCCAGAGACTGT  2068

Query 1982  GTGCAGAGGAGAGCTTCACCGGCCCAGGTGTCCTGGAGCCCTCCCTCATCATCACAGCTGCTGTCCCCGAGGAC  2055
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069  GTGCAGAGGAGAGCTTCACCGGCCCAGGTGTCCTGGAGCCCTCCCTCATCATCACAGCTGCTGTCCCCGAGGAC  2142

Query 2056  TGTGACACA-----------------------------------------------------------------  2064
            |||||||||                                                                 
Sbjct 2143  TGTGACACATAGCCCATTCTGGCCACCAGAGCCCACTTGGCCCCACCCCTCAATAAACCGTGTGGCTTTGGACT  2216

Query 2065  ------  2064
                  
Sbjct 2217  CTCGTA  2222