Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471096
• Subject: NM_133787.2
• Aligned Length: 1509
• Identities: 1379
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAGTATATGGCAGAATCCACCGACCGCAGCCCTGGACACATCTTGTGCTGTGAGTGTGGTGTTCCGATAAG  74
            ||||||||.||||||||.||||..||.|.||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||
Sbjct    1  ATGGAGTACATGGCAGAGTCCATTGAGCACAGCCCGGGACACATCTTGTGCTGTGAATGTGGTGTCCCAATTAG  74

Query   75  TCCAAATCCTGCCAATATTTGTGTGGCCTGTTTGCGAAGTAAAGTGGACATCAGCCAAGGTATTCCGAAACAAG  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||.|
Sbjct   75  TCCAAATCCTGCCAATATTTGTGTGGCCTGTTTACGAAGTAAAGTTGACATCAGCCAAGGTGTTCCAAAGCAGG  148

Query  149  TCTCGATTTCGTTCTGCAAACAATGTCAAAGGTATTTTCAACCACCAGGAACTTGGATACAGTGTGCTTTAGAA  222
            ||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||.|.|.|||.||||||||||||||||.
Sbjct  149  TCTCCATTTCTTTCTGCAAACAGTGTCAGAGATATTTTCAGCCACCAGCATCATGGGTACAGTGTGCTTTAGAG  222

Query  223  TCCAGGGAACTTCTTGCTTTGTGCTTGAAAAAAATCAAAGCCCCTCTGAGTAAGGTACGGCTTGTAGATGCAGG  296
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  223  TCCAGGGAACTTCTTGCTTTGTGTTTGAAAAAAATTAAAGCTCCTCTGAGTAAGGTTCGGCTTGTCGATGCAGG  296

Query  297  CTTTGTTTGGACTGAGCCTCATTCTAAGAGACTTAAAGTTAAACTGACTATTCAGAAAGAGGTGATGAATGGTG  370
            ||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTTGTTTGGACTGAGCCCCATTCCAAGAGACTTAAAGTTAAATTGACAATTCAGAAAGAGGTGATGAATGGTG  370

Query  371  CTATCCTTCAACAAGTGTTTGTGGTGGATTATGTTGTTCAGTCCCAAATGTGTGGAGATTGCCATAGAGTAGAA  444
            |||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  371  CTATCCTGCAGCAAGTGTTTGTGGTGGATTATGTTGTTCAGTCCCAAATGTGTGGAGACTGCCATAGAGTGGAA  444

Query  445  GCTAAGGATTTCTGGAAGGCTGTGATTCAAGTGAGGCAAAAGACTTTGCATAAAAAAACTTTCTACTATCTGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||.|.||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  445  GCTAAGGATTTCTGGAAGGCTGTGATCCAAGTCAGGCAAAAGACTCTACACAAGAAAACATTCTACTATCTGGA  518

Query  519  ACAGTTAATTCTGAAATATGGAATGCATCAGAATACACTTCGTATCAAAGAGATTCATGATGGTCTGGATTTTT  592
            ||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACAGTTGATTTTAAAATATGGAATGCATCAGAATACACTGCGTATCAAGGAGATTCATGATGGTCTGGATTTTT  592

Query  593  ATTATTCCTCAAAACAACATGCTCAGAAGATGGTCGAATTTCTTCAGTGTACAGTTCCCTGTAGATACAAAGCA  666
            |||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||.|||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATTATTCTTCAAAACAGCATGCTCAGAAGATGGTGGAGTTTCTTCAGGGTATAGTTCCCTGTAGATACAAAGCA  666

Query  667  TCACAAAGACTGATCTCTCAAGATATCCATAGTAACACATACAATTACAAAAGCACTTTTTCTGTGGAAATTGT  740
            |||||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCACAAAGATTGATCTCTCAGGATATTCATAGTAACACATACAATTACAAGAGTACTTTTTCTGTGGAAATTGT  740

Query  741  TCCAATATGCAAGGATAATGTTGTCTGTCTGTCTCCAAAACTGGCACAAAGCCTGGGAAATATGAACCAGATTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||..|||||.|
Sbjct  741  TCCAATATGCAAGGATAATGTTGTCTGTCTATCACCAAAACTGGCACAGAGCCTTGGAAATATGAGTCAGATAT  814

Query  815  GTGTGTGTATTCGAGTAACCAGTGCCATTCACCTCATTGATCCAAACACCCTACAAGTGGCAGATATTGATGGG  888
            ||.|.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  815  GTATTTGTATACGAGTAACTAGTGCCATCCACCTCATAGACCCAAATACCCTACAAGTTGCAGATATTGATGGA  888

Query  889  AGCACTTTCTGGAGTCACCCTTTCAATAGTTTATGTCATCCCAAACAGCTAGAGGAGTTTATTGTGATGGAATG  962
            |.|||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  889  AACACTTTCTGGAGTCATCCTTTCAATAGTTTATGCCATCCTAAACAGCTCGAAGAGTTTATTGTGATAGAATG  962

Query  963  CAGCATAGTCCAAGATATAAAACGTGCTGCAGGTGCTGGAATGATATCAAAAAAGCATACCCTCGGGGAAGTCT  1036
            |||||.|||||.||||.|.||.||...|||.||.||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct  963  CAGCACAGTCCGAGATCTGAAGCGAAGTGCGGGGGCTGGAGTGATATCAAAAAAGCACACCCTTGGGGAAGTCT  1036

Query 1037  GGGTACAGAAGACATCTGAAATGAATACAGATAAACAGTATTTTTGTCGTACTCATTTGGGACATCTTCTAAAT  1110
            ||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||.|||||
Sbjct 1037  GGATCCAGAAGACATCTGAAATGAATACAGATAAACAGTATTTTTGCCGAACTCACTTGGGACATCTTTTAAAT  1110

Query 1111  CCCGGAGACCTGGTGTTAGGGTTTGATTTGGCCAACTGTAACTTAAATGATGAGCATGTCAACAAAATGAACTC  1184
            ||.||||||||||||.|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCTGGAGACCTGGTGCTGGGATTTGATTTGGCCAACTGTAACTTAAATGATGAGTATGTCAACAAAATGAACTC  1184

Query 1185  AGATAGAGTTCCAGATGTGGTATTAATCAAGAAGAGCTATGACCGGACCAAACGTCAGCGTCGTAGAAACTGGA  1258
            |||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1185  AGACAGAGTTCCAGATGTGGTGTTAATTAAGAAGAGCTATGACCGCACCAAACGCCAGCGCCGTAGAAACTGGA  1258

Query 1259  AATTGAAAGAGCTTGCAAGAGAGAGAGAAAACATGGATACAGATGATGAAAGGCAATACCAAGATTTTCTTGAA  1332
            ||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1259  AACTGAAAGAGCTTGCAAGAGACAGAGAAAACATGGACACAGATGATGAAAGGCAATATCAAGATTTTCTTGAA  1332

Query 1333  GATCTTGAAGAAGATGAGGCAATTCGAAAAAATGTCAACATTTACAGAGATTCAGCCATCCCTGTGGAAAGTGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GATCTTGAAGAAGATGAGGCAATTAGAAAACATGTCAACATTTACAGAGATGCAACCATCCCTGTGGAAAGTGA  1406

Query 1407  CACCGATGATGAAGGAGCACCTCGAATTAGTCTGGCTGAGATGCTTGAAGACCTTCATATTTCCCAAGATGCCA  1480
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1407  CACAGATGATGAAGGAGCACCTCGAATTAGTCTGGCTGAGATGCTTGAAGACCTTCATATTTCTCAAGATGCCA  1480

Query 1481  CTGGTGAAGAAGGTGCATCAATGCTGACA  1509
            |||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1481  CTGGTGAAGAAGGTGCATCAATGATGTCA  1509