Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471350
• Subject: NM_025814.2
• Aligned Length: 1224
• Identities: 1080
• Gaps: 66

Alignment

Query    1  ATGCCTGGGCACTTACAGGAAGGCTTCGGCTGCGTGGTCACCAACCGATTCGACCAGTTATTTGACGACGAATC  74
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTGGGCACCTACAGGAAGGCTTCGGCTGCGTGGTCACCAACCGATTCGACCAGCTATTTGACGACGAATC  74

Query   75  GGACCCCTTCGAGGTGCTGAAGGCAGCAGAGAACAAGAAAAAAGAAGCCGGCGGGGGCGGCGTTGGGGGCCCTG  148
            ||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  GGACCCTTTCGAGGTACTGAAGGCAGCAGAGAACAAGAAAAAAGAAGCCGGCGGGGGCGGCGTTGGGGGCCCCG  148

Query  149  GGGCCAAGAGCGCAGCTCAGGCCGCGGCCCAGACCAACTCCAACGCGGCAGGCAAACAGCTGCGCAAGGAGTCC  222
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||.||.||||||
Sbjct  149  GGGCCAAGAGCGCGGCTCAGGCCGCGGCCCAGACCAACTCCAACGCGGCGGGCAAACAGTTGCGTAAAGAGTCC  222

Query  223  CAGAAAGACCGCAAGAACCCGCTGCCCCCCAGCGTTGGCGTGGTTGACAAGAAAGAGGAGACGCAGCCGCCCGT  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..|||||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  223  CAGAAAGACCGCAAGAACCCGCTGCCCCCCAGCGTCGGCGTGGCCGACAAAAAGGAGGAGACGCAGCCGCCGGT  296

Query  297  GGCGCTTAAGAAAGAAGGAATAAGACGAGTTGGAAGAAGACCTGATCAACAACTTCAGGGTGAAGGGAAAATAA  370
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||.|||
Sbjct  297  GGCGCTTAAGAAAGAAGGAATAAGGCGAGTTGGAAGAAGACCCGATCAACAACTACAGGGTGATGGGAAACTAA  370

Query  371  TTGATAGAAGACCAGAAAGGCGACCACCTCGTGAACGAAGATTCGAAAAGCCACTTGAAGAAAAGGGTGAAGGA  444
            |||||||.|||.||||||||||||||||.||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  371  TTGATAGGAGAGCAGAAAGGCGACCACCCCGTGAAAGAAGATTTGAAAAGCCACTTGAAGAAAAAGGTGAAGGA  444

Query  445  GGCGAATTTTCAGTTGATAGACCGATTATTGACCGACCTATTCGAGGTCGTGGTGGTCTTGGAAGAGGTCGAGG  518
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  GGTGAATTTTCAGTTGATAGACCGATTATCGAACGGCCTATCCGAGGCCGAGGTGGTCTTGGAAGGGGTCGAGG  518

Query  519  GGGCCGTGGACGTGGAATGGGCCGAGGAGATGGATTTGATTCTCGTGGCAAACGTGAATTTGATAGGCATAGTG  592
            .||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGCCGTGGACGTGGAATGGGCCGAGGCGATGGATTTGATTCTCGTGGCAAGCGTGAATTTGATAGGCATAGTG  592

Query  593  GAAGTGATAGATC------------------TGGCCTGAAGCACGAGGACAAACGTGGAGGTAGCGGATCTCAC  648
            |||||||||||||                  ||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  593  GAAGTGATAGATCTTCTTTTTCACATTACAGTGGCCTGAAGCATGAGGACAAACGCGGAGGTAGCGGCTCTCAC  666

Query  649  AACTGGGGAACTGTCAAAGACGAATTAAC---------------------------------------------  677
            ||||||||||||||||||||.||||||||                                             
Sbjct  667  AACTGGGGAACTGTCAAAGATGAATTAACAGAGTCACCCAAATACATTCAGAAACAAATATCTTATAATTGCAG  740

Query  678  TGACTTGGATCAATCAAATGTGACTGAGGAAACACCTGAAGGTGAAGAACATCATCCAGTGGCAGACACTGAAA  751
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct  741  TGATTTGGATCAATCAAATGTGACTGAGGAAACACCTGAAGGTGAAG---AGCACCCTGTGGCAGATACTGAAA  811

Query  752  ATAAGGAGAATGAAGTTGAAGAGGTAAAAGAGGAGGGTCCAAAAGAGATGACTTTGGATGAGTGGAAGGCTATT  825
            ||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||
Sbjct  812  ATAAGGAGAACGAAGTTGAAGAGGTTAAGGAAGAGGGTCCAAAAGAGATGACTCTGGATGAGTGGAAAGCTATT  885

Query  826  CAAAATAAGGACCGGGCAAAAGTAGAATTTAATATCCGAAAACCAAATGAAGGTGCTGATGGGCAGTGGAAGAA  899
            ||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||
Sbjct  886  CAAAATAAAGACCGAGCAAAAGTAGAATTTAATATCCGAAAACCAAATGAAGGCGCCGATGGACAATGGAAAAA  959

Query  900  GGGATTTGTTCTTCATAAATCAAAGAGTGAAGAGGCTCATGCTGAAGATTCGGTTATGGACCATCATTTCCGGA  973
            ||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  GGGATTTGTTCTGCATAAATCAAAAAGTGAAGAGGCTCATGCTGAAGATTCAGTTATGGACCATCATTTCCGGA  1033

Query  974  AGCCAGCAAATGATATAACGTCTCAGCTGGAGATCAATTTTGGAGACCTTGGCCGCCCAGGACGTGGCGGCAGG  1047
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1034  AGCCAGCAAATGATATAACATCTCAACTGGAGATCAATTTTGGAGACTTAGGCCGCCCAGGACGTGGTGGCAGA  1107

Query 1048  GGAGGACGAGGTGGACGTGGGCGTGGTGGGCGCCCAAACCGTGGCAGCAGGACCGACAAGTCAAGTGCTTCTGC  1121
            ||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1108  GGAGGACGTGGTGGGCGTGGGCGTGGTGGACGTCCAAACCGTGGCAGCAGGACTGATAAGTCAAGTGCTTCTGC  1181

Query 1122  TCCTGATGTGGATGACCCAGAGGCATTCCCAGCTCTGGCT  1161
            |||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1182  TCCTGATGTAGATGACCCAGAGGCCTTCCCAGCTCTGGCC  1221