Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471407
• Subject: XM_006501708.2
• Aligned Length: 1333
• Identities: 1153
• Gaps: 59

Alignment

Query    1  ATGCCCTGGAGGAACAAGGAGGCCTCCAGTCCCTCTTCTGCTAATCCCCCCTT-GGAAGCCCTCCAGAGCCCCA  73
            ||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||| |||..||| .||..|.|||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCCTGGAGGAAGAAAGAGGCCTCCAGCCCTTCTTCTGCTAA-CCCTGCTTCAGAGACTCTCCAGAGCCCCA  73

Query   74  GCTTCAGAGGCAACATGGCGGACAAGCTGAAGGACCCCAGCACCCTGGGCTTCCTGGAGGCGGCCGTGAAGATC  147
            |||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct   74  GCTCCAGAGGCAACATGGCGGATAAGCTGAAGGACCCCAGTGCCCTGGGCTTCCTGGAGGCAGCTGTGAAGATC  147

Query  148  AGCCACACGTCCCCAGATATCCCAGCTGAGGTGCAGATGTCGGTCAAGGAGCACATCATGCGTCACACCCGGCT  221
            ||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||...|||
Sbjct  148  AGCCACACTTCCCCAGACATCCCAGCCGAGGTGCAGATGTCGGTCAAAGAGCACATCATGCGCCACACAAAGCT  221

Query  222  GCAGCGGCAAACTACAGAGCCAGCGTCATCCACCAGGCACACGTCCTTCAAGCGCCACCTGCCAAGGCAGATGC  295
            ||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.|||||||
Sbjct  222  GCAGCGACAGACCACAGAGCCAGCATCCTCCACCAGGCACACATCCTTCAAGCGCCACCTGCCACGACAGATGC  295

Query  296  ATGTCTCCAGTGTAGACTATGGCAATGAGCTTCCAC---CAGCAGCAGAGCAGCCCACCAGCATTGGCCGCATC  366
            ||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|   |.||.||.||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  296  ATGTCTCCAGCGTGGACTATGGCAATGAGCTGCCGCCGGCTGCCGCCGAGCAGCCCACCAGTATTGGCCGTATC  369

Query  367  AAGCCTGAGCTCTACAAGCAGAAGTCGGTGGATGGGGAGGATGCCAAGTCTGAGGCCACCAAGAGCTGCGGGAA  440
            |||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||.||||||||||.|||||
Sbjct  370  AAGCCTGAGCTTTACAAGCAGAAGTCAGTGGATGGGGATGATGCCAAGTCGGAGGCCGCCAAGAGCTGTGGGAA  443

Query  441  GATCAACTTCAGCCTACGCTACGATTACGAGACCGAGACCCTGATTGTGCGTATCCTGAAGGCTTTTGACCTCC  514
            |||||||||||||||.|||||.||.||.||.|.||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  444  GATCAACTTCAGCCTCCGCTATGACTATGAAAGCGAGACGCTGATTGTGCGCATCCTGAAGGCCTTTGACCTCC  517

Query  515  CTGCCAAGGACTTTTGTGGAAGCTCTGACCCTTATGTCAAGATCTACCTCCTGCCTGACCGCAAATGCAAGCTG  588
            ||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  518  CTGCCAAGGACTTTTGCGGAAGTTCTGACCCTTATGTTAAGATCTACCTCCTGCCTGACCGCAAGTGCAAGCTG  591

Query  589  CAGACCCGGGTGCACCGCAAGACCCTGAACCCCACCTTTGATGAGAACTTCCACTTCCCTGTGCCCTATGAGGA  662
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  592  CAGACCCGGGTGCACCGCAAGACCCTGAACCCCACCTTTGATGAGAACTTCCACTTCCCCGTGCCCTACGAGGA  665

Query  663  GCTGGCTGACCGCAAGCTGCATCTCAGTGTCTTCGACTTTGACCGCTTCTCCCGCCATGACATGATTGGCGAGG  736
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  666  GCTGGCTGACCGCAAGCTGCATCTCAGTGTCTTTGACTTTGACCGCTTCTCCCGCCATGACATGATTGGGGAGG  739

Query  737  TCATCCTGGACAACCTCTTTGAGGCCTCTGACCTGTCTCGGGAAACCTCCATCTGGAAGGATATCCAATATGCC  810
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.
Sbjct  740  TCATCCTGGACAATCTCTTTGAGGCCTCTGACCTGTCCCGGGAGACCTCCATCTGGAAGGACATCCAGTACGCT  813

Query  811  ACAAGTGAAAGCGTGGACTTGGGAGAGATCATGTTCTCCCTTTGCTACCTGCCCACTGCAGGCAGGCTCACCCT  884
            ||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  814  ACTAGTGAAAGTGTGGACTTGGGAGAGATCATGTTCTCCCTCTGCTACCTGCCCACAGCAGGCAGGCTCACCCT  887

Query  885  CACAGTGATTAAGTGTCGGAACCTCAAGGCGATGGACATCACAGGCTATTCAGATCCCTATGTGAAAGTGTCCT  958
            |||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||.
Sbjct  888  CACAGTGATCAAGTGTCGAAATCTCAAAGCAATGGACATCACAGGCTACTCAGATCCCTACGTCAAAGTATCCC  961

Query  959  TGCTCTGTGATGGGCGGAGGCTGAAGAAGAAGAAAACAACCATAAAGAAAAACACTCTCAATCCTGTCTACAAT  1032
            |.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.||..|||||||.
Sbjct  962  TACTGTGTGATGGACGGAGGCTGAAAAAGAAGAAAACGACCATAAAAAAGAACACCCTAAACCCCATCTACAAC  1035

Query 1033  GAGGCCATCATCTTTGACATTCCCCCGGAAAACATGGATCAAGTCAGCCTGCTCATCTCAGTCATGGACTATGA  1106
            ||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1036  GAGGCCATCATCTTTGACATCCCCCCAGAAAACATGGACCAAGTGAGCCTGCTCATCTCCGTTATGGACTATGA  1109

Query 1107  TCGAGTGGGCCACAATGAGATCATAGGAGTCTGTCGTGTGGGGATCACTGCTGAAGGCCTGGGCAGGGACCACT  1180
            |.||||.||||||||.||||||||||||||||||.|.||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1110  TAGAGTTGGCCACAACGAGATCATAGGAGTCTGTAGAGTGGGGATCAATGCTGAAGGCCTTGGCAGGGACCACT  1183

Query 1181  GGAACGAGATGCTGGCATACCCCCGGAAGCCCATCGCACACTGGCACTCCTTGGTGGAGGTAAAGAAATCCTTC  1254
            ||||.||||||.||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  GGAATGAGATGTTGGCGTACCCACGAAAGCCCATTGCGCACTGGCACTCCTTGGTGGAGGTAAAGAAATCCTTC  1257

Query 1255  AAAGAG-GGAA-------------ACCCTCG---GT---------TG---------------------------  1275
            |||||| ||.|             |.|.|||   ||         ||                           
Sbjct 1258  AAAGAGTGGCAGGGCCGAGCTGCCAGCTTCGACAGTGAGAGCTCATGCCCGTCTCCGAAACCACCTCCGACGCC  1331

Query 1276  -  1275
             
Sbjct 1332  A  1332