Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471497
- Subject:
- XM_006714160.1
- Aligned Length:
- 2244
- Identities:
- 2232
- Gaps:
- 12
Alignment
Query 1 ATGGCCAGTGAAGGCACCAACATCCCAAGTCCTGTGGTGCGCCAGATTGACAAGCAGTTTCTGATTTGCAGTAT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCAGTGAAGGCACCAACATCCCAAGTCCTGTGGTGCGCCAGATTGACAAGCAGTTTCTGATTTGCAGTAT 74
Query 75 ATGCCTGGAACGGTACAAGAATCCCAAGGTTCTCCCCTGTCTGCACACTTTCTGCGAGAGGTGCCTGCAGAACT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ATGCCTGGAACGGTACAAGAATCCCAAGGTTCTCCCCTGTCTGCACACTTTCTGCGAGAGGTGCCTGCAGAACT 148
Query 149 ACATTCCTGCCCACAGTTTAACCCTCTCCTGCCCAGTGTGCCGCCAGACCTCCATCCTGCCCGAGAAAGGGGTG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACATTCCTGCCCACAGTTTAACCCTCTCCTGCCCAGTGTGCCGCCAGACCTCCATCCTGCCCGAGAAAGGGGTG 222
Query 223 GCCGCGCTCCAGAACAATTTCTTCATCACAAACCTGATGGACGTGCTGCAGCGAACTCCAGGCAGCAACGCTGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCCGCGCTCCAGAACAATTTCTTCATCACAAACCTGATGGACGTGCTGCAGCGAACTCCAGGCAGCAACGCTGA 296
Query 297 GGAGTCTTCCATCCTGGAGACAGTCACTGCTGTGGCTGCGGGAAAGCCTCTCTCTTGCCCAAACCACGATGGGA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAGTCTTCCATCCTGGAGACAGTCACTGCTGTGGCTGCGGGAAAGCCTCTCTCTTGCCCAAACCACGATGGGA 370
Query 371 ATGTGATGGAATTTTACTGCCAGTCCTGTGAGACTGCCATGTGTCGGGAGTGCACGGAGGGGGAGCACGCAGAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATGTGATGGAATTTTACTGCCAGTCCTGTGAGACTGCCATGTGTCGGGAGTGCACGGAGGGGGAGCACGCAGAG 444
Query 445 CACCCCACAGTTCCACTCAAGGATGTGGTGGAACAGCACAAGGCCTCGCTCCAGGTCCAGCTGGATGCTGTCAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CACCCCACAGTTCCACTCAAGGATGTGGTGGAACAGCACAAGGCCTCGCTCCAGGTCCAGCTGGATGCTGTCAA 518
Query 519 CAAAAGGCTCCCAGAAATAGATTCTGCTCTTCAGTTCATCTCTGAAATCATTCATCAGTTAACCAACCAAAAGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAAAAGGCTCCCAGAAATAGATTCTGCTCTTCAGTTCATCTCTGAAATCATTCATCAGTTAACCAACCAAAAGG 592
Query 593 CCAGCATCGTGGATGACATTCATTCCACCTTTGATGAGCTCCAGAAGACTTTAAATGTGCGCAAGAGTGTGCTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCAGCATCGTGGATGACATTCATTCCACCTTTGATGAGCTCCAGAAGACTTTAAATGTGCGCAAGAGTGTGCTG 666
Query 667 CTTATGGAATTGGAGGTCAACTATGGCCTCAAACACAAAGTCCTCCAGTCGCAGCTGGATACTCTGCTCCAGGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTTATGGAATTGGAGGTCAACTATGGCCTCAAACACAAAGTCCTCCAGTCGCAGCTGGATACTCTGCTCCAGGG 740
Query 741 GCAGGAGAGCATTAAGAGCTGCAGCAACTTCACAGCGCAGGCCCTCAACCATGGCACGGAGACCGAGGTCCTAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCAGGAGAGCATTAAGAGCTGCAGCAACTTCACAGCGCAGGCCCTCAACCATGGCACGGAGACCGAGGTCCTAC 814
Query 815 TGGTGAAGAAGCAGATGAGCGAGAAGCTGAACGAGCTGGCCGACCAGGACTTCCCCTTGCACCCGCGGGAGAAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGTGAAGAAGCAGATGAGCGAGAAGCTGAACGAGCTGGCCGACCAGGACTTCCCCTTGCACCCGCGGGAGAAC 888
Query 889 GACCAGCTGGATTTCATCGTGGAAACCGAGGGGCTGAAGAAGTCCATCCACAACCTCGGGACGATCTTAACCAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GACCAGCTGGATTTCATCGTGGAAACCGAGGGGCTGAAGAAGTCCATCCACAACCTCGGGACGATCTTAACCAC 962
Query 963 CAACGCCGTTGCCTCAGAGACAGTGGCCACGGGCGAGGGGCTGCGGCAGACCATCATCGGGCAGCCCATGTCCG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAACGCCGTTGCCTCAGAGACAGTGGCCACGGGCGAGGGGCTGCGGCAGACCATCATCGGGCAGCCCATGTCCG 1036
Query 1037 TCACCATCACCACCAAGGACAAAGACGGTGAGCTGTGCAAAACCGGCAACGCCTACCTCACCGCCGAACTGAGC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCACCATCACCACCAAGGACAAAGACGGTGAGCTGTGCAAAACCGGCAACGCCTACCTCACCGCCGAACTGAGC 1110
Query 1111 ACCCCCGACGGGAGCGTGGCAGACGGGGAGATCCTGGACAACAAGAACGGCACCTATGAGTTTTTGTACACTGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACCCCCGACGGGAGCGTGGCAGACGGGGAGATCCTGGACAACAAGAACGGCACCTATGAGTTTTTGTACACTGT 1184
Query 1185 CCAGAAGGAAGGGGACTTTACCCTGTCTCTGAGACTCTATGACCAGCACATCCGAGGCAGCCCGTTTAAGCTGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCAGAAGGAAGGGGACTTTACCCTGTCTCTGAGACTCTATGACCAGCACATCCGAGGCAGCCCGTTTAAGCTGA 1258
Query 1259 AAGTGATCCGATCCGCTGATGTGTCTCCCACCACAGAAGGCGTGAAGAGGCGCGTTAAGTCCCCGGGGAGCGGC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAGTGATCCGATCCGCTGATGTGTCTCCCACCACAGAAGGCGTGAAGAGGCGCGTTAAGTCCCCGGGGAGCGGC 1332
Query 1333 CACGTCAAGCAGAAAGCTGTGAAAAGACCCGCAAGCATGTACAGCACTGGAAAACGAAAAGAGAATCCCATCGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CACGTCAAGCAGAAAGCTGTGAAAAGACCCGCAAGCATGTACAGCACTGGAAAACGAAAAGAGAATCCCATCGA 1406
Query 1407 AGACGATTTGATCTTTCGAGTGGGTACCAAAGGAAGAAATAAAGGAGAGTTTACAAATCTTCAGGGGGTAGCTG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGACGATTTGATCTTTCGAGTGGGTACCAAAGGAAGAAATAAAGGAGAGTTTACAAATCTTCAGGGGGTAGCTG 1480
Query 1481 CATCTACAAATGGAAAGATATTAATTGCAGACAGTAACAACCAATGTGTGCAGATATTTTCCAATGATGGCCAG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CATCTACAAATGGAAAGATATTAATTGCAGACAGTAACAACCAATGTGTGCAGATATTTTCCAATGATGGCCAG 1554
Query 1555 TTCAAAAGTCGTTTTGGCATACGGGGACGCTCTCCGGGGCAGCTGCAGCGGCCCACAGGAGTGGCTGTACATCC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TTCAAAAGTCGTTTTGGCATACGGGGACGCTCTCCGGGGCAGCTGCAGCGGCCCACAGGAGTGGCTGTACATCC 1628
Query 1629 CAGTGGGGACATAATCATTGCCGATTATGATAATAAATGGGTCAGCATTTTCTCCTCCGATGGGAAATTTAAGA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CAGTGGGGACATAATCATTGCCGATTATGATAATAAATGGGTCAGCATTTTCTCCTCCGATGGGAAATTTAAGA 1702
Query 1703 CAAAAATTGGATCAGGAAAGCTGATGGGACCCAAAGGAGTTTCTGTGGACCGCAATGGGCACATTATTGTTGTG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CAAAAATTGGATCAGGAAAGCTGATGGGACCCAAAGGAGTTTCTGTGGACCGCAATGGGCACATTATTGTTGTG 1776
Query 1777 GACAACAAGGCGTGCTGCGTGTTTATCTTCCAGCCAAACGGGAAAATAGTCACCAGGTTTGGTAGCCGAGGAAA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GACAACAAGGCGTGCTGCGTGTTTATCTTCCAGCCAAACGGGAAAATAGTCACCAGGTTTGGTAGCCGAGGAAA 1850
Query 1851 TGGGGACAGGCAGTTTGCA------------GGTCCCCATTTTGCAGCTGTAAATAGCAATAATGAGATTATTA 1912
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TGGGGACAGGCAGTTTGCAGGTACACTCGATGGTCCCCATTTTGCAGCTGTAAATAGCAATAATGAGATTATTA 1924
Query 1913 TTACAGATTTCCATAATCATTCTGTCAAGGTGTTTAATCAGGAAGGAGAATTCATGTTGAAGTTTGGCTCAAAT 1986
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TTACAGATTTCCATAATCATTCTGTCAAGGTGTTTAATCAGGAAGGAGAATTCATGTTGAAGTTTGGCTCAAAT 1998
Query 1987 GGAGAAGGAAATGGGCAGTTTAATGCTCCAACAGGTGTAGCAGTGGATTCAAATGGAAACATCATTGTGGCCGA 2060
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GGAGAAGGAAATGGGCAGTTTAATGCTCCAACAGGTGTAGCAGTGGATTCAAATGGAAACATCATTGTGGCCGA 2072
Query 2061 CTGGGGAAACAGCAGGATCCAGGTTTTTGATGGGAGTGGATCATTTTTGTCCTACATTAACACATCTGCTGACC 2134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CTGGGGAAACAGCAGGATCCAGGTTTTTGATGGGAGTGGATCATTTTTGTCCTACATTAACACATCTGCTGACC 2146
Query 2135 CACTCTATGGCCCCCAAGGCCTGGCCCTAACTTCAGATGGTCATGTTGTGGTTGCAGACTCTGGAAATCACTGT 2208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CACTCTATGGCCCCCAAGGCCTGGCCCTAACTTCAGATGGTCATGTTGTGGTTGCAGACTCTGGAAATCACTGT 2220
Query 2209 TTCAAAGTCTATCGATACTTACAG 2232
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TTCAAAGTCTATCGATACTTACAG 2244