Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471497
- Subject:
- XM_011240302.1
- Aligned Length:
- 2244
- Identities:
- 2030
- Gaps:
- 12
Alignment
Query 1 ATGGCCAGTGAAGGCACCAACATCCCAAGTCCTGTGGTGCGCCAGATTGACAAGCAGTTTCTGATTTGCAGTAT 74
|||||||||||.|||.|||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1 ATGGCCAGTGAGGGCGCCAGCATCCCAAGTCCCGTGGTGCGCCAGATTGACAAGCAGTTTCTGATCTGCAGTAT 74
Query 75 ATGCCTGGAACGGTACAAGAATCCCAAGGTTCTCCCCTGTCTGCACACTTTCTGCGAGAGGTGCCTGCAGAACT 148
|||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ATGCCTGGAACGGTACAAGAACCCCAAGGTCCTGCCCTGTCTGCACACTTTCTGCGAGAGGTGCCTGCAGAACT 148
Query 149 ACATTCCTGCCCACAGTTTAACCCTCTCCTGCCCAGTGTGCCGCCAGACCTCCATCCTGCCCGAGAAAGGGGTG 222
||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACATCCCAGCCCACAGTTTAACCCTCTCCTGCCCGGTGTGTCGCCAGACATCCATCCTGCCCGAGAAAGGGGTG 222
Query 223 GCCGCGCTCCAGAACAATTTCTTCATCACAAACCTGATGGACGTGCTGCAGCGAACTCCAGGCAGCAACGCTGA 296
|||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||..||
Sbjct 223 GCCGCACTTCAGAACAACTTCTTTATCACGAACCTCATGGATGTGCTGCAGCGGACGCCAGGCAGCAACGGCGA 296
Query 297 GGAGTCTTCCATCCTGGAGACAGTCACTGCTGTGGCTGCGGGAAAGCCTCTCTCTTGCCCAAACCACGATGGGA 370
|||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct 297 GGACTCTTCCATCCTGGAGACGGTCACCGCTGTGGCTGCAGGAAAGCCTCTTTCGTGCCCAAACCATGATGGAA 370
Query 371 ATGTGATGGAATTTTACTGCCAGTCCTGTGAGACTGCCATGTGTCGGGAGTGCACGGAGGGGGAGCACGCAGAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 371 ATGTGATGGAATTTTACTGCCAGTCCTGTGAGACCGCCATGTGTCGGGAGTGCACGGAGGGGGAGCACGCGGAG 444
Query 445 CACCCCACAGTTCCACTCAAGGATGTGGTGGAACAGCACAAGGCCTCGCTCCAGGTCCAGCTGGATGCTGTCAA 518
|||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 445 CACCCCACAGTCCCGCTGAAGGATGTGGTGGAGCAGCACAAGGCCTCGCTCCAGGTCCAGCTGGACGCAGTCAA 518
Query 519 CAAAAGGCTCCCAGAAATAGATTCTGCTCTTCAGTTCATCTCTGAAATCATTCATCAGTTAACCAACCAAAAGG 592
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAAAAGACTCCCAGAAATAGATTCTGCTCTTCAGTTCATCTCAGAAATCATCCATCAGTTAACCAACCAAAAGG 592
Query 593 CCAGCATCGTGGATGACATTCATTCCACCTTTGATGAGCTCCAGAAGACTTTAAATGTGCGCAAGAGTGTGCTG 666
|||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 593 CCAGCATTGTGGATGACATCCACTCCACCTTTGATGAGCTGCAGAAGACTTTAAATGTTCGCAAGAGCGTGCTG 666
Query 667 CTTATGGAATTGGAGGTCAACTATGGCCTCAAACACAAAGTCCTCCAGTCGCAGCTGGATACTCTGCTCCAGGG 740
||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 667 CTCATGGAGTTGGAGGTCAACTATGGTCTCAAACACAAAGTGCTGCAGTCGCAGCTGGATACCCTGCTCCAAGG 740
Query 741 GCAGGAGAGCATTAAGAGCTGCAGCAACTTCACAGCGCAGGCCCTCAACCATGGCACGGAGACCGAGGTCCTAC 814
.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 741 CCAGGAAAGCATTAAGAGCTGCAGCAACTTCACGGCTCAGGCCCTCAACCATGGCACGGAGACGGAGGTGCTGC 814
Query 815 TGGTGAAGAAGCAGATGAGCGAGAAGCTGAACGAGCTGGCCGACCAGGACTTCCCCTTGCACCCGCGGGAGAAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..||||||||||.||||||
Sbjct 815 TGGTGAAGAAGCAGATGAGCGAGAAGCTGAACGAACTGGCGGACCAGGACTTCCCACTGCACCCGCGCGAGAAC 888
Query 889 GACCAGCTGGATTTCATCGTGGAAACCGAGGGGCTGAAGAAGTCCATCCACAACCTCGGGACGATCTTAACCAC 962
||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||.|.|||||
Sbjct 889 GACCAGCTGGATTTTATCGTGGAAACGGAGGGACTGAAGAAGTCTATCCACAACCTGGGGACCATCCTCACCAC 962
Query 963 CAACGCCGTTGCCTCAGAGACAGTGGCCACGGGCGAGGGGCTGCGGCAGACCATCATCGGGCAGCCCATGTCCG 1036
.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TAACGCGGTCGCCTCTGAGACGGTGGCCACGGGGGAGGGGCTGCGGCAGACCATCATCGGGCAGCCCATGTCCG 1036
Query 1037 TCACCATCACCACCAAGGACAAAGACGGTGAGCTGTGCAAAACCGGCAACGCCTACCTCACCGCCGAACTGAGC 1110
|.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||
Sbjct 1037 TTACTATAACCACCAAGGACAAAGACGGAGAGCTGTGCAAGACAGGCAACGCATACCTCACCGCTGAGCTCAGC 1110
Query 1111 ACCCCCGACGGGAGCGTGGCAGACGGGGAGATCCTGGACAACAAGAACGGCACCTATGAGTTTTTGTACACTGT 1184
|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 1111 ACCCCGGACGGCAGCGTGGCCGACGGAGAGATCCTGGACAACAAGAACGGCACCTACGAGTTCTTGTATACTGT 1184
Query 1185 CCAGAAGGAAGGGGACTTTACCCTGTCTCTGAGACTCTATGACCAGCACATCCGAGGCAGCCCGTTTAAGCTGA 1258
.||||||||.||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1185 GCAGAAGGAGGGGGACTTCACCCTGTCCCTCAGGCTCTACGACCAGCATATCCGAGGCAGCCCGTTTAAGCTCA 1258
Query 1259 AAGTGATCCGATCCGCTGATGTGTCTCCCACCACAGAAGGCGTGAAGAGGCGCGTTAAGTCCCCGGGGAGCGGC 1332
|.||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||.|.||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1259 AGGTCATCCGCTCTGCCGACGTGTCCCCCACCACCGAGGGCGTGAAGCGACGAGTCAAGTCCCCGGGGAGCGGG 1332
Query 1333 CACGTCAAGCAGAAAGCTGTGAAAAGACCCGCAAGCATGTACAGCACTGGAAAACGAAAAGAGAATCCCATCGA 1406
||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1333 CACGTCAAGCAGAAGGCTGTGAAGAGACCTGCCAGCATGTACAGCACCGGCAAGCGAAAAGAGAACCCCATCGA 1406
Query 1407 AGACGATTTGATCTTTCGAGTGGGTACCAAAGGAAGAAATAAAGGAGAGTTTACAAATCTTCAGGGGGTAGCTG 1480
.|||||..|||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||
Sbjct 1407 GGACGACCTGATCTTCCGAGTCGGTACCAAAGGAAGAAACAAAGGAGAATTTACAAACCTGCAGGGTGTGGCTG 1480
Query 1481 CATCTACAAATGGAAAGATATTAATTGCAGACAGTAACAACCAATGTGTGCAGATATTTTCCAATGATGGCCAG 1554
|||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1481 CATCTACAAGTGGAAAGATATTAATTGCAGATAGTAACAACCAGTGTGTGCAGATCTTTTCCAATGATGGACAG 1554
Query 1555 TTCAAAAGTCGTTTTGGCATACGGGGACGCTCTCCGGGGCAGCTGCAGCGGCCCACAGGAGTGGCTGTACATCC 1628
||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||
Sbjct 1555 TTCAAAAGTCGTTTCGGCATCCGAGGACGATCACCCGGACAGCTCCAGCGGCCCACGGGGGTAGCGGTGCACCC 1628
Query 1629 CAGTGGGGACATAATCATTGCCGATTATGATAATAAATGGGTCAGCATTTTCTCCTCCGATGGGAAATTTAAGA 1702
||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||||||...||||||||.|||||||
Sbjct 1629 CAGTGGGGACATCATCATTGCAGATTATGACAACAAGTGGGTTAGCATTTTCTCCAATGATGGGAAGTTTAAGA 1702
Query 1703 CAAAAATTGGATCAGGAAAGCTGATGGGACCCAAAGGAGTTTCTGTGGACCGCAATGGGCACATTATTGTTGTG 1776
|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1703 CAAAAATTGGATCAGGAAAACTGATGGGGCCCAAAGGAGTTTCTGTGGACCGCAATGGGCACATTATTGTGGTG 1776
Query 1777 GACAACAAGGCGTGCTGCGTGTTTATCTTCCAGCCAAACGGGAAAATAGTCACCAGGTTTGGTAGCCGAGGAAA 1850
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GACAACAAGGCGTGCTGTGTGTTTATCTTCCAGCCCAACGGGAAAATAGTCACCAGGTTTGGTAGCCGAGGAAA 1850
Query 1851 TGGGGACAGGCAGTTTGCA------------GGTCCCCATTTTGCAGCTGTAAATAGCAATAATGAGATTATTA 1912
.|||||||||||||||||| ||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1851 CGGGGACAGGCAGTTTGCAGGTACACTCGATGGTCCCCACTTTGCAGCTGTGAATAGCAATAATGAGATCATCA 1924
Query 1913 TTACAGATTTCCATAATCATTCTGTCAAGGTGTTTAATCAGGAAGGAGAATTCATGTTGAAGTTTGGCTCAAAT 1986
|||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1925 TTACAGATTTCCATAATCACTCTGTCAAGGTATTTAATCAGGAAGGAGAATTCATGTTGAAGTTTGGCTCCAAT 1998
Query 1987 GGAGAAGGAAATGGGCAGTTTAATGCTCCAACAGGTGTAGCAGTGGATTCAAATGGAAACATCATTGTGGCCGA 2060
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1999 GGAGAAGGAAATGGGCAGTTTAATGCACCAACAGGTGTGGCCGTGGACTCAAATGGGAACATCATTGTGGCTGA 2072
Query 2061 CTGGGGAAACAGCAGGATCCAGGTTTTTGATGGGAGTGGATCATTTTTGTCCTACATTAACACATCTGCTGACC 2134
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 2073 CTGGGGGAACAGCAGGATCCAGGTTTTTGATGGGAGTGGATCATTTTTGTCCTATATCAACACATCTGCTGACC 2146
Query 2135 CACTCTATGGCCCCCAAGGCCTGGCCCTAACTTCAGATGGTCATGTTGTGGTTGCAGACTCTGGAAATCACTGT 2208
|.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 2147 CGCTCTATGGCCCCCAGGGCCTGGCTCTCACTTCAGATGGCCATGTTGTGGTTGCAGACTCCGGAAACCACTGT 2220
Query 2209 TTCAAAGTCTATCGATACTTACAG 2232
|||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 2221 TTCAAGGTCTACCGGTACTTACAG 2244