Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471497
• Subject: XM_017007946.2
• Aligned Length: 2286
• Identities: 2232
• Gaps: 54

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------ATGGCCAGTGAAGGCACCAA  20
                                                                  ||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCAGCAGCGTGCAGGGTCAAAGACAGCCGGCCCCCCATGTCAGTGGTCTAGGATGGCCAGTGAAGGCACCAA  74

Query   21  CATCCCAAGTCCTGTGGTGCGCCAGATTGACAAGCAGTTTCTGATTTGCAGTATATGCCTGGAACGGTACAAGA  94
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATCCCAAGTCCTGTGGTGCGCCAGATTGACAAGCAGTTTCTGATTTGCAGTATATGCCTGGAACGGTACAAGA  148

Query   95  ATCCCAAGGTTCTCCCCTGTCTGCACACTTTCTGCGAGAGGTGCCTGCAGAACTACATTCCTGCCCACAGTTTA  168
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATCCCAAGGTTCTCCCCTGTCTGCACACTTTCTGCGAGAGGTGCCTGCAGAACTACATTCCTGCCCACAGTTTA  222

Query  169  ACCCTCTCCTGCCCAGTGTGCCGCCAGACCTCCATCCTGCCCGAGAAAGGGGTGGCCGCGCTCCAGAACAATTT  242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACCCTCTCCTGCCCAGTGTGCCGCCAGACCTCCATCCTGCCCGAGAAAGGGGTGGCCGCGCTCCAGAACAATTT  296

Query  243  CTTCATCACAAACCTGATGGACGTGCTGCAGCGAACTCCAGGCAGCAACGCTGAGGAGTCTTCCATCCTGGAGA  316
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTCATCACAAACCTGATGGACGTGCTGCAGCGAACTCCAGGCAGCAACGCTGAGGAGTCTTCCATCCTGGAGA  370

Query  317  CAGTCACTGCTGTGGCTGCGGGAAAGCCTCTCTCTTGCCCAAACCACGATGGGAATGTGATGGAATTTTACTGC  390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGTCACTGCTGTGGCTGCGGGAAAGCCTCTCTCTTGCCCAAACCACGATGGGAATGTGATGGAATTTTACTGC  444

Query  391  CAGTCCTGTGAGACTGCCATGTGTCGGGAGTGCACGGAGGGGGAGCACGCAGAGCACCCCACAGTTCCACTCAA  464
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGTCCTGTGAGACTGCCATGTGTCGGGAGTGCACGGAGGGGGAGCACGCAGAGCACCCCACAGTTCCACTCAA  518

Query  465  GGATGTGGTGGAACAGCACAAGGCCTCGCTCCAGGTCCAGCTGGATGCTGTCAACAAAAGGCTCCCAGAAATAG  538
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGATGTGGTGGAACAGCACAAGGCCTCGCTCCAGGTCCAGCTGGATGCTGTCAACAAAAGGCTCCCAGAAATAG  592

Query  539  ATTCTGCTCTTCAGTTCATCTCTGAAATCATTCATCAGTTAACCAACCAAAAGGCCAGCATCGTGGATGACATT  612
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATTCTGCTCTTCAGTTCATCTCTGAAATCATTCATCAGTTAACCAACCAAAAGGCCAGCATCGTGGATGACATT  666

Query  613  CATTCCACCTTTGATGAGCTCCAGAAGACTTTAAATGTGCGCAAGAGTGTGCTGCTTATGGAATTGGAGGTCAA  686
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATTCCACCTTTGATGAGCTCCAGAAGACTTTAAATGTGCGCAAGAGTGTGCTGCTTATGGAATTGGAGGTCAA  740

Query  687  CTATGGCCTCAAACACAAAGTCCTCCAGTCGCAGCTGGATACTCTGCTCCAGGGGCAGGAGAGCATTAAGAGCT  760
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTATGGCCTCAAACACAAAGTCCTCCAGTCGCAGCTGGATACTCTGCTCCAGGGGCAGGAGAGCATTAAGAGCT  814

Query  761  GCAGCAACTTCACAGCGCAGGCCCTCAACCATGGCACGGAGACCGAGGTCCTACTGGTGAAGAAGCAGATGAGC  834
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCAGCAACTTCACAGCGCAGGCCCTCAACCATGGCACGGAGACCGAGGTCCTACTGGTGAAGAAGCAGATGAGC  888

Query  835  GAGAAGCTGAACGAGCTGGCCGACCAGGACTTCCCCTTGCACCCGCGGGAGAACGACCAGCTGGATTTCATCGT  908
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGAAGCTGAACGAGCTGGCCGACCAGGACTTCCCCTTGCACCCGCGGGAGAACGACCAGCTGGATTTCATCGT  962

Query  909  GGAAACCGAGGGGCTGAAGAAGTCCATCCACAACCTCGGGACGATCTTAACCACCAACGCCGTTGCCTCAGAGA  982
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAAACCGAGGGGCTGAAGAAGTCCATCCACAACCTCGGGACGATCTTAACCACCAACGCCGTTGCCTCAGAGA  1036

Query  983  CAGTGGCCACGGGCGAGGGGCTGCGGCAGACCATCATCGGGCAGCCCATGTCCGTCACCATCACCACCAAGGAC  1056
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGTGGCCACGGGCGAGGGGCTGCGGCAGACCATCATCGGGCAGCCCATGTCCGTCACCATCACCACCAAGGAC  1110

Query 1057  AAAGACGGTGAGCTGTGCAAAACCGGCAACGCCTACCTCACCGCCGAACTGAGCACCCCCGACGGGAGCGTGGC  1130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAGACGGTGAGCTGTGCAAAACCGGCAACGCCTACCTCACCGCCGAACTGAGCACCCCCGACGGGAGCGTGGC  1184

Query 1131  AGACGGGGAGATCCTGGACAACAAGAACGGCACCTATGAGTTTTTGTACACTGTCCAGAAGGAAGGGGACTTTA  1204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGACGGGGAGATCCTGGACAACAAGAACGGCACCTATGAGTTTTTGTACACTGTCCAGAAGGAAGGGGACTTTA  1258

Query 1205  CCCTGTCTCTGAGACTCTATGACCAGCACATCCGAGGCAGCCCGTTTAAGCTGAAAGTGATCCGATCCGCTGAT  1278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCCTGTCTCTGAGACTCTATGACCAGCACATCCGAGGCAGCCCGTTTAAGCTGAAAGTGATCCGATCCGCTGAT  1332

Query 1279  GTGTCTCCCACCACAGAAGGCGTGAAGAGGCGCGTTAAGTCCCCGGGGAGCGGCCACGTCAAGCAGAAAGCTGT  1352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTGTCTCCCACCACAGAAGGCGTGAAGAGGCGCGTTAAGTCCCCGGGGAGCGGCCACGTCAAGCAGAAAGCTGT  1406

Query 1353  GAAAAGACCCGCAAGCATGTACAGCACTGGAAAACGAAAAGAGAATCCCATCGAAGACGATTTGATCTTTCGAG  1426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAAAAGACCCGCAAGCATGTACAGCACTGGAAAACGAAAAGAGAATCCCATCGAAGACGATTTGATCTTTCGAG  1480

Query 1427  TGGGTACCAAAGGAAGAAATAAAGGAGAGTTTACAAATCTTCAGGGGGTAGCTGCATCTACAAATGGAAAGATA  1500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGGGTACCAAAGGAAGAAATAAAGGAGAGTTTACAAATCTTCAGGGGGTAGCTGCATCTACAAATGGAAAGATA  1554

Query 1501  TTAATTGCAGACAGTAACAACCAATGTGTGCAGATATTTTCCAATGATGGCCAGTTCAAAAGTCGTTTTGGCAT  1574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTAATTGCAGACAGTAACAACCAATGTGTGCAGATATTTTCCAATGATGGCCAGTTCAAAAGTCGTTTTGGCAT  1628

Query 1575  ACGGGGACGCTCTCCGGGGCAGCTGCAGCGGCCCACAGGAGTGGCTGTACATCCCAGTGGGGACATAATCATTG  1648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ACGGGGACGCTCTCCGGGGCAGCTGCAGCGGCCCACAGGAGTGGCTGTACATCCCAGTGGGGACATAATCATTG  1702

Query 1649  CCGATTATGATAATAAATGGGTCAGCATTTTCTCCTCCGATGGGAAATTTAAGACAAAAATTGGATCAGGAAAG  1722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCGATTATGATAATAAATGGGTCAGCATTTTCTCCTCCGATGGGAAATTTAAGACAAAAATTGGATCAGGAAAG  1776

Query 1723  CTGATGGGACCCAAAGGAGTTTCTGTGGACCGCAATGGGCACATTATTGTTGTGGACAACAAGGCGTGCTGCGT  1796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTGATGGGACCCAAAGGAGTTTCTGTGGACCGCAATGGGCACATTATTGTTGTGGACAACAAGGCGTGCTGCGT  1850

Query 1797  GTTTATCTTCCAGCCAAACGGGAAAATAGTCACCAGGTTTGGTAGCCGAGGAAATGGGGACAGGCAGTTTGCAG  1870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GTTTATCTTCCAGCCAAACGGGAAAATAGTCACCAGGTTTGGTAGCCGAGGAAATGGGGACAGGCAGTTTGCAG  1924

Query 1871  GTCCCCATTTTGCAGCTGTAAATAGCAATAATGAGATTATTATTACAGATTTCCATAATCATTCTGTCAAGGTG  1944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GTCCCCATTTTGCAGCTGTAAATAGCAATAATGAGATTATTATTACAGATTTCCATAATCATTCTGTCAAGGTG  1998

Query 1945  TTTAATCAGGAAGGAGAATTCATGTTGAAGTTTGGCTCAAATGGAGAAGGAAATGGGCAGTTTAATGCTCCAAC  2018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TTTAATCAGGAAGGAGAATTCATGTTGAAGTTTGGCTCAAATGGAGAAGGAAATGGGCAGTTTAATGCTCCAAC  2072

Query 2019  AGGTGTAGCAGTGGATTCAAATGGAAACATCATTGTGGCCGACTGGGGAAACAGCAGGATCCAGGTTTTTGATG  2092
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AGGTGTAGCAGTGGATTCAAATGGAAACATCATTGTGGCCGACTGGGGAAACAGCAGGATCCAGGTTTTTGATG  2146

Query 2093  GGAGTGGATCATTTTTGTCCTACATTAACACATCTGCTGACCCACTCTATGGCCCCCAAGGCCTGGCCCTAACT  2166
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GGAGTGGATCATTTTTGTCCTACATTAACACATCTGCTGACCCACTCTATGGCCCCCAAGGCCTGGCCCTAACT  2220

Query 2167  TCAGATGGTCATGTTGTGGTTGCAGACTCTGGAAATCACTGTTTCAAAGTCTATCGATACTTACAG  2232
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TCAGATGGTCATGTTGTGGTTGCAGACTCTGGAAATCACTGTTTCAAAGTCTATCGATACTTACAG  2286