Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471650
• Subject: XM_017001789.1
• Aligned Length: 1872
• Identities: 1687
• Gaps: 159

Alignment

Query    1  ATGCCCAGCAGGACCGGCCCCAAGATGGAAGGGAGCGGCGGCCGCGTCCGCCTCAAGGCGCATTACGGGGGGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCCAGCAGGACCGGCCCCAAGATGGAAGGGAGCGGCGGCCGCGTCCGCCTCAAGGCGCATTACGGGGGGGA  74

Query   75  CATCTTCATCACCAGCGTGGACGCCGCCACGACCTTCGAGGAGCTCTGTGAGGAAGTGAGAGACATGTGTCGTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATCTTCATCACCAGCGTGGACGCCGCCACGACCTTCGAGGAGCTCTGTGAGGAAGTGAGAGACATGTGTCGTC  148

Query  149  TGCACCAGCAGCACCCGCTCACCCTCAAGTGGGTGGACAGCGAAGGTGACCCTTGCACGGTGTCCTCCCAGATG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCACCAGCAGCACCCGCTCACCCTCAAGTGGGTGGACAGCGAAGGTGACCCTTGCACGGTGTCCTCCCAGATG  222

Query  223  GAGCTGGAAGAGGCTTTCCGCCTGGCCCGTCAGTGCAGGGATGAAGGCCTCATCATTCATGTTTTCCCGAGCAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGCTGGAAGAGGCTTTCCGCCTGGCCCGTCAGTGCAGGGATGAAGGCCTCATCATTCATGTTTTCCCGAGCAC  296

Query  297  CCCTGAGCAGCCTGGCCTGCCATGTCCGGGAGAAGACAAATCTATCTACCGCCGGGGAGCCAGAAGATGGAGGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCTGAGCAGCCTGGCCTGCCATGTCCGGGAGAAGACAAATCTATCTACCGCCGGGGAGCCAGAAGATGGAGGA  370

Query  371  AGCTGTACCGTGCCAACGGCCACCTCTTCCAAGCCAAGCGCTTTAACAGGAGAGCGTACTGCGGTCAGTGCAGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCTGTACCGTGCCAACGGCCACCTCTTCCAAGCCAAGCGCTTTAACAGGAGAGCGTACTGCGGTCAGTGCAGC  444

Query  445  GAGAGGATATGGGGCCTCGCGAGGCAAGGCTACAGGTGCATCAACTGCAAACTGCTGGTCCATAAGCGCTGCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGAGGATATGGGGCCTCGCGAGGCAAGGCTACAGGTGCATCAACTGCAAACTGCTGGTCCATAAGCGCTGCCA  518

Query  519  CGGCCTCGTCCCGCTGACCTGCAGGAAGCATATGGATTCTGTCATGCCTTCCCAAGAGCCTCCAGTAGACGACA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGGCCTCGTCCCGCTGACCTGCAGGAAGCATATGGATTCTGTCATGCCTTCCCAAGAGCCTCCAGTAGACGACA  592

Query  593  AGAACGAGGACGCCGACCTTCCTTCCGAGGAGACAGATGGAATTGCTTACATTTCCTCATCCCGGAAGCATGAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGAACGAGGACGCCGACCTTCCTTCCGAGGAGACAGATGGAATTGCTTACATTTCCTCATCCCGGAAGCATGAC  666

Query  667  AGCATTAAAGACGACTCGGAGGACCTTAAGCCAGTTATCGATGGGATGGATGGAATCAAAATCTCTCAGGGGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGCATTAAAGACGACTCGGAGGACCTTAAGCCAGTTATCGATGGGATGGATGGAATCAAAATCTCTCAGGGGCT  740

Query  741  TGGGCTGCAGGACTTTGACCTAATCAGAGTCATCGGGCGCGGGAGCTACGCCAAGGTTCTCCTGGTGCGGTTGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGGCTGCAGGACTTTGACCTAATCAGAGTCATCGGGCGCGGGAGCTACGCCAAGGTTCTCCTGGTGCGGTTGA  814

Query  815  AGAAGAATGACCAAATTTACGCCATGAAAGTGGTGAAGAAAGAGCTGGTGCATGATGACGAGGATATTGACTGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGAAGAATGACCAAATTTACGCCATGAAAGTGGTGAAGAAAGAGCTGGTGCATGATGACGAGGATATTGACTGG  888

Query  889  GTACAGACAGAGAAGCACGTGTTTGAGCAGGCATCCAGCAACCCCTTCCTGGTCGGATTACACTCCTGCTTCCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTACAGACAGAGAAGCACGTGTTTGAGCAGGCATCCAGCAACCCCTTCCTGGTCGGATTACACTCCTGCTTCCA  962

Query  963  GACGACAAGTC------------------------GGTTGTTCCTGGTCATTGAGTACGTCAACGGCGGGGACC  1012
            |||||||||||                        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GACGACAAGTCGCCTCCGGCGCCTCTCTCCCTGCAGGTTGTTCCTGGTCATTGAGTACGTCAACGGCGGGGACC  1036

Query 1013  TGATGTTCCACATGCAGAGGCAGAGGAAGCTCCCTGAGGAGCACGCCAGGTTCTACGCGGCCGAGATCTGCATC  1086
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGATGTTCCACATGCAGAGGCAGAGGAAGCTCCCTGAGGAGCACGCCAGGTTCTACGCGGCCGAGATCTGCATC  1110

Query 1087  GCCCTCAACTTCCTGCACGAGAGGGGGATCATCTACAGGGACCTGAAGCTGGACAACGTCCTCCTGGATGCGGA  1160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCCTCAACTTCCTGCACGAGAGGGGGATCATCTACAGGGACCTGAAGCTGGACAACGTCCTCCTGGATGCGGA  1184

Query 1161  CGGGCACATCAAGCTCACAGACTACGGCATGTGCAAGGAAGGCCTGGGCCCTGGTGACACAACGAGCACTTTCT  1234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGGGCACATCAAGCTCACAGACTACGGCATGTGCAAGGAAGGCCTGGGCCCTGGTGACACAACGAGCACTTTCT  1258

Query 1235  GCGGAACCCCGAATTACATCGCCCCCGAAATCCTGCGGGGAGAGGAGTACGGGTTCAGCGTGGACTGGTGGGCG  1308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCGGAACCCCGAATTACATCGCCCCCGAAATCCTGCGGGGAGAGGAGTACGGGTTCAGCGTGGACTGGTGGGCG  1332

Query 1309  CTGGGAGTCCTCATGTTTGAGATGATGGCCGGGCGCTCCCCGTTCGACATCATCACCGACAACCCGGACATGAA  1382
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGGGAGTCCTCATGTTTGAGATGATGGCCGGGCGCTCCCCGTTCGACATCATCACCGACAACCCGGACATGAA  1406

Query 1383  CACAGAGGACTACCTTTTCCAAGTGATCCTGGAGAAGCCCATCCGGATCCCCCGGTTCCTGTCCGTCAAAGCCT  1456
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CACAGAGGACTACCTTTTCCAAGTGATCCTGGAGAAGCCCATCCGGATCCCCCGGTTCCTGTCCGTCAAAGCCT  1480

Query 1457  CCCATGTTTTAAAAGGATTTTTAAATAAGGACCCCAAAGAGAGGCTCGGCTGCCGGCCACAGACTGGATTTTCT  1530
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCCATGTTTTAAAAGGATTTTTAAATAAGGACCCCAAAGAGAGGCTCGGCTGCCGGCCACAGACTGGATTTTCT  1554

Query 1531  GACATCAAGTCCCACGCGTTCTTCCGCAGCATAGACTGGGACTTGCTGGAGAAGAAGCAGGCGCTCCCTCCATT  1604
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|                        
Sbjct 1555  GACATCAAGTCCCACGCGTTCTTCCGCAGCATAGACTGGGACTTGATGCA------------------------  1604

Query 1605  CCAGCCA---CAGAT-CACAGACGACTACGGTCTGGACAACTTTGACACACAGTTCACCAG-CGA---GCCCGT  1670
             |||.||   ||||| |||||||       |.|.||||.||.|.|||||        |||| |||   |..||.
Sbjct 1605  -CAGACAACTCAGATGCACAGAC-------GCCCGGACGACGTGGACAC--------CCAGACGATGTGGACGC  1662

Query 1671  GCAGCTGAC-------CCCAGACGATGAGGATGC--------CATAAAGA---GGATCGA-----CCAGTCAGA  1721
            .|||..|||       |.|||||||||.||||||        |.||.|.|   |||| ||     |||  ||||
Sbjct 1663  ACAGACGACATGGACGCACAGACGATGTGGATGCACGGACGACGTAGACACACGGAT-GACTCATCCA--CAGA  1733

Query 1722  GTTCGAAGGCTTTGAGT-ATAT-CA-----ACCCATTATTGCTGTC----------CACCGAGGAGTCGG----  1774
                        |||.| |.|| ||     |||||        |.|          |||.||.||..|||    
Sbjct 1734  ------------TGACTCAGATGCACGGACACCCA--------GACGACGCGGACGCACAGACGACGCGGACGC  1787

Query 1775  -----TG---------------  1776
                 ||               
Sbjct 1788  ACAGATGACGTGGACGCACAGA  1809