Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471737
- Subject:
- NM_001310456.1
- Aligned Length:
- 1500
- Identities:
- 1246
- Gaps:
- 129
Alignment
Query 1 ----------ATGGATCGGATGAAGAAGATCAAACGGCAGCTGTCAATGACACTCCGAGGTGGCCGAGGCATAG 64
||||||..||||||||| |||.
Sbjct 1 ATGTACACAAATGGATACGATGAAGAA-------------------------------------------ATAT 31
Query 65 ACAAGACCAATGGTGCCCCTGAGCAGATAGGCCTGGATGAGAGTGGTGGTGGTGGCGGCAGTGACCCTGGAGAG 138
|..| .|.|||.| |.|.|||||||.| ||.||
Sbjct 32 ATTA---TATTGGGG-------------------GAAAGAGAGTGTT-------------------CTTGA--- 61
Query 139 GCCCCCACACGTGCTGCTCCTGGGGAAC--TTCGTTCTGCACGGGGCCCACTCAGCTCTGCACCAGAGATTGTG 210
|.|||.|.| ||||| | |||..||| .|||| |.||||||||||||
Sbjct 62 --CTCCAAAGG-------CCTGG----CCTTTCCCTCT-------CCCCA----------CCCCAGAGATTGTG 105
Query 211 CACGAGGACTTGAAGATGGGGTCTGATGGGGAGAGTGACCAGGCTTCAGCCACGTCCTCGGATGAGGTGCAGTC 284
|||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 106 CACGAGGACATGAAGATGGGATCTGATGGGGAGAGTGACCAGGCTTCAGCCACATCCTCAGATGAGGTGCAGTC 179
Query 285 TCCAGTGAGAGTGCGTATGCGCAACCATCCCCCACGCAAGATCTCCACTGAGGACATCAACAAGCGCCTATCAC 358
|||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 180 TCCAGTGAGAGTGCGCATGCGCAACCACCCCCCACGCAAGATCTCCACTGAGGACATCAACAAACGCCTGTCAC 253
Query 359 TACCAGCTGACATCCGGCTGCCTGAGGGCTACCTGGAGAAGCTGACCCTCAATAGCCCCATCTTTGACAAGCCC 432
|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 254 TACCAGCTGACATACGGCTGCCTGAGGGCTACCTTGAGAAGCTGACCCTCAATAGCCCCATCTTTGATAAGCCT 327
Query 433 CTCAGCCGCCGCCTCCGTCGTGTCAGCCTATCTGAGATTGGCTTTGGGAAACTGGAGACCTACATTAAGCTGGA 506
||.|||||.||||||||.||.|||||..|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 328 CTTAGCCGGCGCCTCCGCCGAGTCAGTTTGTCTGAGATTGGCTTTGGAAAACTGGAGACCTACATCAAGCTAGA 401
Query 507 CAAACTGGGCGAGGGTACCTATGCCACCGTCTACAAAGGCAAAAGCAAGCTCACAGACAACCTTGTGGCACTCA 580
|||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 402 CAAGCTGGGTGAGGGTACCTATGCCACTGTCTACAAAGGCAAAAGCAAGCTCACAGACAACCTTGTAGCACTTA 475
Query 581 AGGAGATCAGACTGGAACATGAAGAGGGGGCACCCTGCACCGCCATCCGGGAAGTGTCCCTACTCAAGGACCTC 654
|||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 476 AGGAGATCAGACTGGAACACGAAGAAGGGGCACCCTGTACTGCTATCCGGGAAGTATCCCTGCTTAAGGACCTC 549
Query 655 AAACACGCCAACATCGTTACGCTACATGACATTATCCACACGGAGAAGTCCCTCACCCTTGTCTTTGAGTACCT 728
||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||.|
Sbjct 550 AAGCATGCCAACATCGTCACACTACATGACATTATCCACACAGAGAAGTCCCTCACACTTGTCTTTGAATACTT 623
Query 729 GGACAAGGACCTGAAGCAGTACCTGGATGACTGTGGGAACATCATCAACATGCACAACGTGAAACTGTTCCTGT 802
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 624 GGACAAGGACCTGAAGCAGTACCTGGATGACTGTGGAAATGTCATCAACATGCACAATGTGAAACTGTTCCTGT 697
Query 803 TCCAGCTGCTCCGTGGCCTGGCCTACTGCCACCGGCAGAAGGTGCTACACCGAGACCTCAAGCCCCAGAACCTG 876
|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 698 TCCAGTTGCTCCGTGGCCTGGCCTACTGCCACAGGCAGAAGGTGCTACACCGAGACCTCAAGCCCCAGAACCTA 771
Query 877 CTCATCAACGAGAGGGGAGAGCTCAAGCTGGCTGACTTTGGCCTGGCCCGAGCCAAGTCAATCCCAACAAAGAC 950
||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.||
Sbjct 772 CTCATCAACGAGAGGGGAGAGCTCAAACTGGCAGATTTTGGCCTGGCTCGTGCCAAGTCAATTCCTACTAAAAC 845
Query 951 ATACTCCAATGAGGTGGTGACACTGTGGTACCGGCCCCCTGACATCCTGCTTGGGTCCACGGACTACTCCACTC 1024
|||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 846 ATACTCCAACGAAGTGGTGACACTGTGGTACCGGCCCCCTGACATCCTACTTGGGTCCACAGACTACTCTACCC 919
Query 1025 AGATTGACATGTGGGGTGTGGGCTGCATCTTCTATGAGATGGCCACAGGCCGTCCCCTCTTTCCGGGCTCCACG 1098
|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.
Sbjct 920 AAATTGACATGTGGGGTGTAGGCTGCATCTTCTATGAGATGGCCACCGGCCGGCCCCTCTTCCCAGGCTCCACA 993
Query 1099 GTGGAGGAACAGCTACACTTCATCTTCCGTATCTTAGGAACCCCAACTGAGGAGACGTGGCCAGGCATCCTGTC 1172
|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 994 GTGGAAGAACAGCTGCACTTCATCTTCCGCATTTTGGGAACCCCAACTGAGGAGACATGGCCAGGTATCCTGTC 1067
Query 1173 CAACGAGGAGTTCAAGACATACAACTACCCCAAGTACCGAGCCGAGGCCCTTTTGAGCCACGCACCCCGACTTG 1246
|||.||||||||.|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||
Sbjct 1068 CAATGAGGAGTTTAGAACATACAACTACCCCAAGTACCGAGCCGAGGCCCTTCTGAGCCATGCACCCCGACTTG 1141
Query 1247 ATAGCGACGGGGCCGACCTCCTCACCAAGCTGTTGCAGTTTGAGGGTCGAAATCGGATCTCCGCAGAGGATGCC 1320
|||||||.||.||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1142 ATAGCGATGGAGCTGACCTCCTCACCAAGCTGCTGCAGTTTGAGGGTCGCAATCGGATCTCTGCTGAGGATGCC 1215
Query 1321 ATGAAACATCCATTCTTCCTCAGTCTGGGGGAGCGGATCCACAAACTTCCTGACACTACTTCCATATTTGCACT 1394
|.|||||||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1216 AGGAAACATCCATTCTTTCTCAGCTTGGGGGAGCGGATCCACAAACTTCCTGACACTACTTCCATATTTGCACT 1289
Query 1395 AAAGGAGATTCAGCTACAAAAGGAGGCCAGCCTTCGGTCTTCGTCGATGCCTGACTCAGGCAGGCCAGCTTTCC 1468
|||||||.|.|||||||||||||||||||.|.|||||||..|.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1290 AAAGGAGGTACAGCTACAAAAGGAGGCCAACATTCGGTCCACTTCTATGCCTGACTCAGGCAGGCCAGCTTTCC 1363
Query 1469 GCGTGGTGGACACCGAGTTC 1488
|.||||||||.|||||||||
Sbjct 1364 GTGTGGTGGATACCGAGTTC 1383