Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471789
• Subject: XM_006498086.3
• Aligned Length: 1479
• Identities: 1080
• Gaps: 240

Alignment

Query    1  ATGACCCGGGCGCTCTGCTCAGCGCTCCGCCAGGCTCTCCTGCTGCTCGCAGCGGCCGCCGAGCTCTCGCCAGG  74
            |||||||..||||.|.||||.||.||..|||.|||.|||||||||.|.||...|||||||||.||..||.||||
Sbjct    1  ATGACCCCAGCGCGCGGCTCCGCACTGAGCCTGGCCCTCCTGCTGGTGGCCCTGGCCGCCGACCTTGCGGCAGG  74

Query   75  ACTGAAGTGTGTATGTCTTTTGTGTGATTCTTCAAACTTTACCTGCCAAACAGAAGGAGCATGTTGGGCATCAG  148
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct   75  ACTGAAGTGTGTGTGTCTTTTGTGTGATTCTTCAAACTTCACCTGCCAAACGGAAGGAGCATGTTGGGCCTCCG  148

Query  149  TCATGCTAACCAATGGAAAAGAGCAGGTGATCAAATCCTGTGTCTCCCTTCCAGAACTGAATGCTCAAGTCTTC  222
            |||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct  149  TCATGCTAACCAACGGGAAAGAGCAGGTGATCAAATCGTGTGTGTCCCTCCCGGAACTAAATGCTCAGGTCTTC  222

Query  223  TGTCATAGTTCCAACAATGTTACCAAAACCGAATGCTGCTTCACAGATTTTTGCAACAACATAACACTGCACCT  296
            |||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  223  TGTCACAGTTCCAACAACGTGACCAAAACCGAATGTTGCTTCACAGACTTCTGCAACAATATCACACTGCACCT  296

Query  297  TCCAACAGCATCACCAAATGCCCCAAAACTTGGACCCATGGAGCTGGCCATCATTATTACTGTGCCTGTTTGCC  370
            |||.|||                                                                   
Sbjct  297  TCCCACA-------------------------------------------------------------------  303

Query  371  TCCTGTCCATAGCTGCGATGCTGACAGTATGGGCATGCCAGGGTCGACAGTGCTCCTACAGGAAGAAAAAGAGA  444
                                                                                      
Sbjct  304  --------------------------------------------------------------------------  303

Query  445  CCAAATGTGGAGGAACCACTCTCTGAGTGCAATCTGGTAAATGCTGGAAAAACTCTGAAAGATCTGATTTATGA  518
                                                                                      
Sbjct  304  --------------------------------------------------------------------------  303

Query  519  TGTGACCGCCTCTGGATCTGGCTCTGGTCTACCTCTGTTGGTTCAAAGGACAATTGCAAGGACGATTGTGCTTC  592
                                     |||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct  304  -------------------------GGTCTGCCTCTCTTGGTTCAAAGAACAATCGCAAGGACAATTGTACTTC  352

Query  593  AGGAAATAGTAGGAAAAGGTAGATTTGGTGAGGTGTGGCATGGAAGATGGTGTGGGGAAGATGTGGCTGTGAAA  666
            |.|||||.||||||||||||.|.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  353  AAGAAATCGTAGGAAAAGGTCGGTTTGGGGAAGTGTGGCACGGAAGATGGTGTGGAGAAGATGTGGCTGTGAAA  426

Query  667  ATATTCTCCTCCAGAGATGAAAGATATTGGTTTCGTGAGGCAGAAATTTACCAGACGGTCATGCTGCGACATGA  740
            ||||||||||||||.|||||.||||.||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||.||||.||
Sbjct  427  ATATTCTCCTCCAGGGATGAGAGATCTTGGTTCCGTGAGGCGGAAATTTATCAGACGGTGATGCTGAGACACGA  500

Query  741  AAACATCCTTGGTTTCATTGCTGCTGACAACAAAGATAATGGAACTTGGACTCAACTTTGGCTGGTATCTGAAT  814
            .||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct  501  GAACATCCTCGGTTTCATCGCAGCTGACAACAAAGATAATGGAACTTGGACACAACTCTGGCTTGTGTCAGAGT  574

Query  815  ATCATGAACAGGGCTCCTTATATGACTATTTGAATAGAAATATAGTGACCATGGCTGGAATGATCAAGCTGGCG  888
            ||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||..|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  575  ATCACGAGCAGGGCTCCTTGTATGACTATTTGAACAGAAACATAGTGACTGTGGCTGGAATGGTCAAGCTGGCG  648

Query  889  CTCTCAATTGCTAGTGGTCTGGCACACCTTCATATGGAGATTGTTGGTACACAAGGTAAACCTGCTATTGCTCA  962
            ||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  649  CTTTCCATAGCGAGTGGTCTGGCTCACCTGCACATGGAGATCGTGGGTACTCAAGGTAAGCCTGCTATTGCTCA  722

Query  963  TCGAGACATAAAATCAAAGAATATCTTAGTAAAAAAGTGTGAAACTTGTGCCATAGCGGACTTAGGGTTGGCTG  1036
            .|||||.|||||.||||||||||||.||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct  723  CCGAGATATAAAGTCAAAGAATATCCTAGTCAAAAAATGTGACACTTGTGCCATAGCTGACTTAGGGCTGGCTG  796

Query 1037  TGAAGCATGATTCAATACTGAACACTATCGACATACCTCAGAATCCTAAAGTGGGAACCAAGAGGTATATGGCT  1110
            |||||||.|||||.||..||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  797  TGAAGCACGATTCTATCATGAACACTATAGACATACCCCAGAATCCTAAAGTGGGAACCAAGAGGTACATGGCT  870

Query 1111  CCTGAAATGCTTGATGATACAATGAATGTGAATATCTTTGAGTCCTTCAAACGAGCTGACATCTATTCTGTTGG  1184
            ||.|||||||||||||||||||||||..|||..|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct  871  CCCGAAATGCTTGATGATACAATGAACCTGAGCATCTTTGAGTCCTTCAAGCGAGCTGACATCTATTCGGTGGG  944

Query 1185  TCTGGTTTACTGGGAAATAGCCCGGAGGTGTTCAGTCGGAGGAATTGTTGAGGAGTACCAATTGCCTTATTATG  1258
            .||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct  945  GCTGGTTTACTGGGAAATAGCTCGAAGGTGTTCAGTTGGAGGAGTTGTTGAGGAGTACCAGTTGCCTTACTATG  1018

Query 1259  ACATGGTGCCTTCAGATCCCTCGATAGAGGAAATGAGAAAGGTTGTTTGTGACCAGAAGTTTCGACCAAGTATC  1332
            |||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||..|.|||||||.|.||
Sbjct 1019  ACATGGTGCCTTCAGATCCTTCGATAGAAGAAATGAGGAAGGTTGTCTGTGATCAGAAACTCCGACCAAATCTC  1092

Query 1333  CCAAACCAGTGGCAAAGTTGTGAAGCACTCCGAGTCATGGGGAGAATAATGCGTGAGTGTTGGTATGCCAACGG  1406
            |||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1093  CCAAACCAGTGGCAAAGCTGTGAAGCGCTGCGGGTCATGGGAAGAATAATGCGTGAGTGCTGGTACGCCAACGG  1166

Query 1407  AGCGGCCCGCCTAACTGCTCTTCGTATTAAGAAGACTATATCTCAACTTTGTGTCAAAGAAGACTGCAAAGCC  1479
            .||.||.|||||.||.||.||.||..|.||||||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1167  GGCAGCACGCCTGACAGCCCTGCGCGTGAAGAAGACCATCTCCCAGCTGTGTGTCAAGGAAGACTGTAAAGCT  1239