Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000471812
- Subject:
- NR_029431.1
- Aligned Length:
- 2096
- Identities:
- 1393
- Gaps:
- 703
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 AAGCCCTAGAGAGGCTACCACCGGTACACCCCGCCTTCCCACCCACGGGTAAAGTGGCGCCGCCTACGCACCGG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CACAGCCCCTGGGCTCCCGCCCCGGCGCGGAGACCACCGTGGACATCCGGGGGCGGGAGGCCGCTCTGGCCCCA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AGCGGAGCCTCTCTCTGGTAGACGAGCCCGAGGGAGCCCTTCTGGGCGCGGCGCCGCGGAGCTGCTCTATGCTC 222
Query 1 -----------------------------------------------------------ATGGCGGCTGCCGCG 15
|||||||||||||||
Sbjct 223 CAACCGGAAGTGCTCTTCACCGCCGGCCTCCCACCCAGCTCTCTGGTCCCGGCGGTAAGATGGCGGCTGCCGCG 296
Query 16 GAGTGCGATGTGGTAATGGCGGCGACCGAGCCGGAGCTGCTCGACGACCAAGAGGCGAAGAGGGAAGCAGAGAC 89
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAGTGCGATGTGGTAATGGCGGCGACCGAGCCGGAGCTGCTCGACGACCAAGAGGCGAAG-------------- 356
Query 90 TTTCAAGGAACAAGGAAATGCATACTATGCCAAGAAAGATTACAATGAAGCTTATAATTATTATACAAAAGCCA 163
Sbjct 357 -------------------------------------------------------------------------- 356
Query 164 TAGATATGTGTCCTAAAAATGCTAGCTATTATGGTAATCGAGCAGCCACCTTGATGATGCTTGGAAGGTTCCGG 237
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357 -AGATATGTGTCCTAAAAATGCTAGCTATTATGGTAATCGAGCAGCCACCTTGATGATGCTTGGAAGGTTCCGG 429
Query 238 GAAGCTCTTGGAGATGCACAACAGTCAGTGAGGTTGGATGACAGTTTTGTCCGGGGACATCTACGAGAGGGCAA 311
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 430 GAAGCTCTTGGAGATGCACAACAGTCAGTGAGGTTGGATGACAGTTTTGTCCGGGGACATCTACGAGAGGGCAA 503
Query 312 GTGCCACCTCTCTCTGGGGAATGCCATGGCAGCATGTCGCAGCTTCCAGAGAGCCCTAGAACTGGATCATAAAA 385
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 504 GTGCCACCTCTCTCTGGGGAATGCCATGGCAGCATGTCGCAGCTTCCAGAGAGCCCTAGAACTGGATCATAAAA 577
Query 386 ATGCTCAGGCACAACAAGAGTTCAAGAATGCTAATGCAGTCATGGAATATGAGAAAATAGCAGAAACAGATTTT 459
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 578 ATGCTCAGGCACAACAAGAGTTCAAGAATGCTAATGCAGTCATGGAATATGAGAAAATAGCAGAAACAGATTTT 651
Query 460 GAGAAGCGAGATTTTCGGAAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCCTAGAATTTGCCCCTGCCTGCCATCGCTT 533
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 652 GAGAAGCGAGATTTTCGGAAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCCTAGAATTTGCCCCTGCCTGCCATCGCTT 725
Query 534 CAAAATCCTCAAGGCAGAATGTTTAGCAATGCTGGGTCGTTATCCAGAAGCACAGTCTGTGGCTAGTGACATTC 607
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 726 CAAAATCCTCAAGGCAGAATGTTTAGCAATGCTGGGTCGTTATCCAGAAGCACAGTCTGTGGCTAGTGACATTC 799
Query 608 TACGAATGGATTCCACCAATGCAGATGCTCTGTATGTACGAGGTCTTTGCCTTTATTACGAAGATTGTATTGAG 681
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 800 TACGAATGGATTCCACCAATGCAGATGCTCTGTATGTACGAGGTCTTTGCCTTTATTACGAAGATTGTATTGAG 873
Query 682 AAGGCAGTTCAGTTTTTCGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCCTGCATTGCCTGCAGAAA 755
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 874 AAGGCAGTTCAGTTTTTCGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCCTGCATTGCCTGCAGAAA 947
Query 756 TGCCAAAGCACTCAAAGCAAAGAAAGAAGATGGGAATAAAGCATTTAAGGAAGGAAATTACAAACTAGCATATG 829
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 948 TGCCAAAGCACTCAAAGCAAAGAAAGAAGATGGGAATAAAGCATTTAAGGAAGGAAATTACAAACTAGCATATG 1021
Query 830 AACTGTACACAGAAGCCCTGGGGATAGACCCCAACAATATAAAAACAAATGCTAAACTCTACTGTAATCGGGGT 903
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1022 AACTGTACACAGAAGCCCTGGGGATAGACCCCAACAATATAAAAACAAATGCTAAACTCTACTGTAATCGGGGT 1095
Query 904 ACGGTTAATTCCAAGCTTAGGAAACTAGATGATGCAATAGAAGACTGCACAAATGCAGTGAAGCTTGATGACAC 977
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1096 ACGGTTAATTCCAAGCTTAGGAAACTAGATGATGCAATAGAAGACTGCACAAATGCAGTGAAGCTTGATGACAC 1169
Query 978 TTACATAAAAGCCTACTTGAGAAGAGCTCAGTGTTACATGGACACAGAACAGTATGAAGAAGCAGTACGAGACT 1051
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1170 TTACATAAAAGCCTACTTGAGAAGAGCTCAGTGTTACATGGACACAGAACAGTATGAAGAAGCAGTACGAGACT 1243
Query 1052 ATGAAAAAGTATACCAGACAGAGAAAACAAAAGAACACAAACAGCTCCTAAAAAATGCGCAGCTGGAACTGAAG 1125
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1244 ATGAAAAAGTATACCAGACAGAGAAAACAAAAGAACACAAACAGCTCCTAAAAAATGCGCAGCTGGAACTGAAG 1317
Query 1126 AAGAGTAAGAGGAAAGATTACTACAAGATTCTAGGAGTGGACAAGAATGCCTCTGAGGACGAGATCAAGAAAGC 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318 AAGAGTAAGAGGAAAGATTACTACAAGATTCTAGGAGTGGACAAGAATGCCTCTGAGGACGAGATCAAGAAAGC 1391
Query 1200 TTATCGGAAACGGGCCTTGATGCACCATCCAGATCGGCATAGTGGAGCCAGTGCTGAGGTTCAGAAGGAGGAGG 1273
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1392 TTATCGGAAACGGGCCTTGATGCACCATCCAGATCGGCATAGTGGAGCCAGTGCTGAGGTTCAGAAGGAGGAGG 1465
Query 1274 AGAAGAAGTTCAAGGAAGTTGGAGAGGCCTTTACTATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAAGACTCGCTATGACAGT 1347
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1466 AGAAGAAGTTCAAGGAAGTTGGAGAGGCCTTTACTATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAAGACTCGCTATGACAGT 1539
Query 1348 GGACAGGACCTAGATGAGGAGGGCATGAATATGGGTGATTTTGATCCAAACAATATCTTCAAGGCATTCTTTGG 1421
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1540 GGACAGGACCTAGATGAGGAGGGCATGAATATGGGTGATTTTGATCCAAACAATATCTTCAAGGCATTCTTTGG 1613
Query 1422 CGGTCCTGGCGGCTTCAGCTTTGAAGCATCTGGTCCAGGGAATTTCTTTTTTCAATTTGGC------------- 1482
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1614 CGGTCCTGGCGGCTTCAGCTTTGAAGCATCTGGTCCAGGGAATTTCTTTTTTCAATTTGGCTAATGAAGGGCAA 1687
Query 1483 -------------------------------------------------------------------------- 1482
Sbjct 1688 CCACCCAGAACCCAGAAAATGCAGATTCACTCAGTTTAATCTTGAATGTGGAAACAGTTCACCTCCTCCCTTCA 1761
Query 1483 -------------------------------------------------------------------------- 1482
Sbjct 1762 TCACGTCTCCGTGTGCTTAGAGCAGTTTCGTTTTCTCAGTTGGATGCCCTGTGTCTCTGTGAGTGGGGTGGAGC 1835
Query 1483 -------------------------------------------------------------------------- 1482
Sbjct 1836 AAAGGGAACCAATGCCGAAGACCGAGGGCAGGGGAGGGAGGCGGGGGTGGACAGGGAGGCAGCTTGTGAATTTT 1909
Query 1483 -------------------------------------------------------------------------- 1482
Sbjct 1910 TGTTTTACTGTTTAACTTTATTAAAAAAGAAAAAAAAAAGAGAATAAAATGTTTTGACCCTTCCTGGCCCTTTG 1983
Query 1483 ------------------------ 1482
Sbjct 1984 CTCTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAA 2007