Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471812
• Subject: XR_001780034.1
• Aligned Length: 1915
• Identities: 1358
• Gaps: 433

Alignment

Query    1  -------------------------------------------------ATGGCGGCTGCCGCGGAGTGCGATG  25
                                                             |||||||||.|||||||||||||||
Sbjct    1  TGCTCTACACCGTCTGCCTCCCACCCGGCTCTCTGGTCCCGGCGGTAAGATGGCGGCTACCGCGGAGTGCGATG  74

Query   26  TGGTAATGGCGGCGACCGAGCCGGAGCTGCTCGACGACCAAGAGGCGAAGAGGGAAGCAGAGACTTTCAAGGAA  99
            ||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||.||||.||.||||||||||||||..|.|||||||||
Sbjct   75  TGGTAATGGCGGCGACCGAGCCTGAACTGCTGGAGGACGAAGACGCCAAGAGGGAAGCAGAATCCTTCAAGGAA  148

Query  100  CAAGGAAATGCATACTATGCCAAGAAAGATTACAATGAAGCTTATAATTATTATACAAAAGCCATAGATATGTG  173
            |||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAAGGGAATGCATATTATGCTAAGAAGGACTACAACGAAGCTTATAACTATTACACAAAAGCCATAGATATGTG  222

Query  174  TCCTAAAAATGCTAGCTATTATGGTAATCGAGCAGCCACCTTGATGATGCTTGGAAGGTTCCGGGAAGCTCTTG  247
            ||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||..||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCTAACAATGCCAGCTATTACGGTAATCGAGCGGCCACACTGATGATGCTTGGACGGTTCCGGGAAGCTCTTG  296

Query  248  GAGATGCACAACAGTCAGTGAGGTTGGATGACAGTTTTGTCCGGGGACATCTACGAGAGGGCAAGTGCCACCTC  321
            |||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  297  GAGATGCGCAGCAGTCTGTGAGGTTGGATGACAGTTTTGTCCGGGGACACCTCCGAGAAGGCAAGTGCCACCTC  370

Query  322  TCTCTGGGGAATGCCATGGCAGCATGTCGCAGCTTCCAGAGAGCCCTAGAACTGGATCATAAAAATGCTCAGGC  395
            ||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  371  TCACTTGGGAATGCAATGGCGGCATGTCGTAGTTTCCAAAGAGCCCTAGAACTGGATCATAAAAATGCCCAGGC  444

Query  396  ACAACAAGAGTTCAAGAATGCTAATGCAGTCATGGAATATGAGAAAATAGCAGAAACAGATTTTGAGAAGCGAG  469
            |||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||...||||||||.|||||||
Sbjct  445  ACAGCAGGAGTTCAAGAACGCCAATGCCGTCATGGAGTATGAGAAAATAGCAGAAGTGGATTTTGAAAAGCGAG  518

Query  470  ATTTTCGGAAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCCTAGAATTTGCCCCTGCCTGCCATCGCTTCAAAATCCTC  543
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  519  ATTTCCGGAAGGTTGTTTTCTGCATGGACCGTGCCCTAGAATTTGCCCCTGCCTGCCATCGATTCAAAATTCTC  592

Query  544  AAGGCAGAATGTTTAGCAATGCTGGGTCGTTATCCAGAAGCACAGTCTGTGGCTAGTGACATTCTACGAATGGA  617
            ||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||.||||||.|||||||||.||||||||||
Sbjct  593  AAAGCAGAATGTTTAGCAATGCTTGGTCGATACCCAGAAGCACAGTTTGTGGCCAGTGACATTTTACGAATGGA  666

Query  618  TTCCACCAATGCAGATGCTCTGTATGTACGAGGTCTTTGCCTTTATTACGAAGATTGTATTGAGAAGGCAGTTC  691
            ||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  667  TTCCACCAATGCTGATGCTCTGTATGTCCGGGGTCTTTGCCTTTATTACGAAGATTGTATTGAGAAGGCAGTGC  740

Query  692  AGTTTTTCGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCCTGCATTGCCTGCAGAAATGCCAAAGCA  765
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..|.||.||.||||||||||||||.
Sbjct  741  AGTTTTTTGTACAGGCTCTCAGGATGGCTCCTGACCACGAGAAGGCTTGTGTCGCTTGTAGAAATGCCAAAGCC  814

Query  766  CTCAAAGCAAAGAAAGAAGATGGGAATAAAGCATTTAAGGAAGGAAATTACAAACTAGCATATGAACTGTACAC  839
            ||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTTAAAGCCAAGAAGGAAGATGGGAATAAAGCCTTTAAGGAAGGAAATTACAAGCTAGCATATGAACTGTACAC  888

Query  840  AGAAGCCCTGGGGATAGACCCCAACAATATAAAAACAAATGCTAAACTCTACTGTAATCGGGGTACGGTTAATT  913
            |||||||.||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGAAGCCTTGGGGATAGATCCCAACAACATAAAAACAAATGCTAAACTCTACTGTAATCGGGGTACGGTTAATT  962

Query  914  CCAAGCTTAGGAAACTAGATGATGCAATAGAAGACTGCACAAATGCAGTGAAGCTTGATGACACTTACATAAAA  987
            |||||||||||.||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  963  CCAAGCTTAGGCAACTGGAAGATGCCATAGAAGACTGTACAAATGCGGTGAAGCTCGATGACACTTACATCAAA  1036

Query  988  GCCTACTTGAGAAGAGCTCAGT----------------------------------------------------  1009
            ||||||.|||||||||||||||                                                    
Sbjct 1037  GCCTACCTGAGAAGAGCTCAGTGGTGGGATTGTTCCAGTCCTAGACTATCTTTATAGACCTCCAGCGGAGGAGA  1110

Query 1010  ------------------------------------------------GTTACATGGACACAGAACAGTATGAA  1035
                                                            ||||||||||||||||.||||.||||
Sbjct 1111  TTGCACACGCTCCCTCAGTCTCCCATGCCTGTGTCTAACGCCCCTCACGTTACATGGACACAGAGCAGTTTGAA  1184

Query 1036  GAAGCAGTACGAGACTATGAAAAAGTATACCAGACAGAGAAAACAAAAGAACACAAACAGCTCCTAAAAAATGC  1109
            |||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1185  GAAGCCGTGCGGGACTATGAAAAAGTGTATCAGACGGAGAAAACAAAAGAACACAAACAGCTCCTTAAGAATGC  1258

Query 1110  GCAGCTGGAACTGAAGAAGAGTAAGAGGAAAGATTACTACAAGATTCTAGGAGTGGACAAGAATGCCTCTGAGG  1183
            .||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACAGCTGGAACTGAAGAAGAGCAAGAGGAAAGATTACTACAAGATCCTGGGAGTGGACAAGAATGCCTCTGAGG  1332

Query 1184  ACGAGATCAAGAAAGCTTATCGGAAACGGGCCTTGATGCACCATCCAGATCGGCATAGTGGAGCCAGTGCTGAG  1257
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.
Sbjct 1333  ACGAGATCAAGAAAGCTTACCGGAAACGGGCCTTGATGCACCATCCAGATCGGCACAGTGGGGCCAGTGCCGAA  1406

Query 1258  GTTCAGAAGGAGGAGGAGAAGAAGTTCAAGGAAGTTGGAGAGGCCTTTACTATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAA  1331
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTTCAGAAGGAGGAGGAGAAGAAGTTTAAGGAAGTGGGAGAGGCCTTTACCATCCTCTCTGATCCCAAGAAAAA  1480

Query 1332  GACTCGCTATGACAGTGGACAGGACCTAGATGAGGAGGGCATGAATATGGGTGATTTTGATCCAAACAATATCT  1405
            ||||||.||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||||
Sbjct 1481  GACTCGTTATGACAGTGGACAGGACTTGGATGAGGAGGGCATGAATATGGGCGATTTTGATGCAAACAACATCT  1554

Query 1406  TCAAGGCATTCTTTGGCGGTCCTGGCGGCTTCAGCTTTGAAGCATCTGGTCCAGGGAATTTCTTTTTTCAATTT  1479
            |||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||..|||||.|||
Sbjct 1555  TCAAGGCATTCTTCGGTGGTCCTGGGGGCTTCAGCTTTGAAGCATCTGGCCCAGGGAATTTCTACTTTCAGTTT  1628

Query 1480  GGC-----------------------------------------------------------------------  1482
            |||                                                                       
Sbjct 1629  GGCTAATGAAGGCCAACTACTTAAAACCCAGAAAATGCAGACTTGCTTGGTTTAACCATGAGTGTGGACAGTTC  1702

Query 1483  --------------------------------------------------------------------------  1482
                                                                                      
Sbjct 1703  ACTTCCTCCATCATGTCCCTGTGTACTTAGAGCAGTTTCGTTTTCTCAGTCGGGTGCCCTGTGTCTGTATGAGG  1776

Query 1483  --------------------------------------------------------------------------  1482
                                                                                      
Sbjct 1777  GGTGAAGGAAAGGGGGCCAGTGCTGAGGACTAGGGAGGGAGGGAAGCCAGGGGTAGACAGGGAAGCAGGCAGCT  1850

Query 1483  -----------------------------------------------------------------  1482
                                                                             
Sbjct 1851  TGTGAATTTTTGTTGTATTGTTTAACTTTATTAAAAAAGAAAAAGAATAAAATGTTTTGACCGTT  1915