Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471826
• Subject: XM_024448324.1
• Aligned Length: 2585
• Identities: 1901
• Gaps: 679

Alignment

Query    1  ATGGGCTCCATGTTCCGGAGCGAGGAGGTGGCCCTGGTCCAGCTCTTTCTGCCCACAGCGGCTGCCTACACCTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCTCCATGTTCCGGAGCGAGGAGGTGGCCCTGGTCCAGCTCTTTCTGCCCACAGCGGCTGCCTACACCTG  74

Query   75  CGTGAGTCGGCTGGGCGAGCTGGGCCTCGTGGAGTTCAGAGACCTCAACGCCTCGGTGAGCGCCTTCCAGAGAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGTGAGTCGGCTGGGCGAGCTGGGCCTCGTGGAGTTCAGAGACCTCAACGCCTCGGTGAGCGCCTTCCAGAGAC  148

Query  149  GCTTTGTGGTTGATGTTCGGCGCTGTGAGGAGCTGGAGAAGACCTTCACCTTCCTGCAGGAGGAGGTGCGGCGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCTTTGTGGTTGATGTTCGGCGCTGTGAGGAGCTGGAGAAGACCTTCACCTTCCTGCAGGAGGAGGTGCGGCGG  222

Query  223  GCTGGGCTGGTCCTGCCCCCGCCAAAGGGGAGGCTGCCGGCACCCCCACCCCGGGACCTGCTGCGCATCCAGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCTGGGCTGGTCCTGCCCCCGCCAAAGGGGAGGCTGCCGGCACCCCCACCCCGGGACCTGCTGCGCATCCAGGA  296

Query  297  GGAGACGGAGCGCCTGGCCCAGGAGCTGCGGGATGTGCGGGGCAACCAGCAGGCCCTGCGGGCCCAGCTGCACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGAGACGGAGCGCCTGGCCCAGGAGCTGCGGGATGTGCGGGGCAACCAGCAGGCCCTGCGGGCCCAGCTGCACC  370

Query  371  AGCTGCAGCTCCACGCCGCCGTGCTACGCCAGGGCCATGAACCTCAGCTGGCAGCCGCCCACACAGATGGGGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCTGCAGCTCCACGCCGCCGTGCTACGCCAGGGCCATGAACCTCAGCTGGCAGCCGCCCACACAGATGGGGCC  444

Query  445  TCAGAGAGGACGCCCCTGCTCCAGGCCCCCGGGGGGCCGCACCAGGACCTGAGGGTCAACTTTGTGGCAGGTGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCAGAGAGGACGCCCCTGCTCCAGGCCCCCGGGGGGCCGCACCAGGACCTGAGGGTCAACTTTGTGGCAGGTGC  518

Query  519  CGTGGAGCCCCACAAGGCCCCTGCCCTAGAGCGCCTGCTCTGGAGGGCCTGCCGCGGCTTCCTCATTGCCAGCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGTGGAGCCCCACAAGGCCCCTGCCCTAGAGCGCCTGCTCTGGAGGGCCTGCCGCGGCTTCCTCATTGCCAGCT  592

Query  593  TCAGGGAGCTGGAGCAGCCGCTGGAGCACCCCGTGACGGGCGAGCCAGCCACGTGGATGACCTTCCTCATCTCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCAGGGAGCTGGAGCAGCCGCTGGAGCACCCCGTGACGGGCGAGCCAGCCACGTGGATGACCTTCCTCATCTCC  666

Query  667  TACTGGGGTGAGCAGATCGGACAGAAGATCCGCAAGATCACGGACT----------------GCTTCCACTGCC  724
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||||
Sbjct  667  TACTGGGGTGAGCAGATCGGACAGAAGATCCGCAAGATCACGGACTGCGCATCCTCCCTCCAGCTTCCACTGCC  740

Query  725  ACGTCTTCCCGTTTCTGCAGCAGGAGGAGGCCCGCCTCGGGGCCCTGCAGCAGCTGCAACAGCAGAGCCAGGAG  798
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACGTCTTCCCGTTTCTGCAGCAGGAGGAGGCCCGCCTCGGGGCCCTGCAGCAGCTGCAACAGCAGAGCCAGGAG  814

Query  799  CTGCAGGAGGTCCTCGGGGAGACAGAGCGGTTCCTGAGCCAGGTGCTAGGCCGGGTGCTGCAGCTGCTGCCGCC  872
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGCAGGAGGTCCTCGGGGAGACAGAGCGGTTCCTGAGCCAGGTGCTAGGCCGGGTGCTGCAGCTGCTGCCGCC  888

Query  873  AGGGCAGGTGCAGGTCCACAAGATGAAGGCCGTGTACCTGGCCCTGAACCAGTGCAGCGTGAGCACCACGCACA  946
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGGGCAGGTGCAGGTCCACAAGATGAAGGCCGTGTACCTGGCCCTGAACCAGTGCAGCGTGAGCACCACGCACA  962

Query  947  AGTGCCTCATTGCCGAGGCCTGGTGCTCTGTGCGAGACCTGCCCGCCCTGCAGGAGGCCCTGCGGGACAGCTCG  1020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGTGCCTCATTGCCGAGGCCTGGTGCTCTGTGCGAGACCTGCCCGCCCTGCAGGAGGCCCTGCGGGACAGCTCG  1036

Query 1021  ATGGAGGAGGGAGTGAGTGCCGTGGCTCACCGCATCCCCTGCCGGGACATGCCCCCCACACTCATCCGCACCAA  1094
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGGAGGAGGGAGTGAGTGCCGTGGCTCACCGCATCCCCTGCCGGGACATGCCCCCCACACTCATCCGCACCAA  1110

Query 1095  CCGCTTCACGGCCAGCTTCCAGGGCATCGTGGATGCCTACGGCGTGGGCCGCTACCAGGAGGTCAACCCCGCTC  1168
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCGCTTCACGGCCAGCTTCCAGGGCATCGTGGATGCCTACGGCGTGGGCCGCTACCAGGAGGTCAACCCCGCTC  1184

Query 1169  CCTACACCATCATCACCTTCCCCTTCCTGTTTGCTGTGATGTTCGGGGATGTGGGCCACGGGCTGCTCATGTTC  1242
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTACACCATCATCACCTTCCCCTTCCTGTTTGCTGTGATGTTCGGGGATGTGGGCCACGGGCTGCTCATGTTC  1258

Query 1243  CTCTTCGCCCTGGCCATGGTCCTTGCGGAGAACCGACCGGCTGTGAAGGCCGCGCAGAACGAGATCTGGCAGAC  1316
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTGTTCGCCCTGGCCATGGTCCTTGCGGAGAACCGACCGGCTGTGAAGGCCGCGCAGAACGAGATCTGGCAGAC  1332

Query 1317  TTTCTTCAGGGGCCGCTACCTGCTCCTGCTTATGGGCCTGTTCTCCATCTACACCGGCTTCATCTACAACGAGT  1390
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTTCTTCAGGGGCCGCTACCTGCTCCTGCTTATGGGCCTGTTCTCCATCTACACCGGCTTCATCTACAACGAGT  1406

Query 1391  GCTTCAGTCGCGCCACCAGCATCTTCCCCTCGGGCTGGAGTGTGGCCGCCATGGCCAACCAGTCTGGCTGG---  1461
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct 1407  GCTTCAGTCGCGCCACCAGCATCTTCCCCTCGGGCTGGAGTGTGGCCGCCATGGCCAACCAGTCTGGCTGGAGG  1480

Query 1462  --------------------------------------------------------------------------  1461
                                                                                      
Sbjct 1481  TGAGGCCCGGGCCCCAGCCCGGCTGGGGGCCCCGCAGCACCCGCAGCCCTGACCGCCCTCCCCTGCGTTGCCGC  1554

Query 1462  AGTGATGCATTCCTGGCCCAGCACACGATGCTTACCCTGGATCCCAACGTCACCGGTGTCTTCCTGGGACCCTA  1535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGTGATGCATTCCTGGCCCAGCACACGATGCTTACCCTGGATCCCAACGTCACCGGTGTCTTCCTGGGACCCTA  1628

Query 1536  CCCCTTTGGCATCGATCCTATTTGGAGCCTGGCTGCCAACCACTTGAGCTTCCTCAACTCCTTCAAGATGAAGA  1609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCCCTTTGGCATCGATCCTATTTGGAGCCTGGCTGCCAACCACTTGAGCTTCCTCAACTCCTTCAAGATGAAGA  1702

Query 1610  TGTCCGTCATCCTGGGCGTCGTGCACATGGCCTTTGGGGTGGTCCTCGGAGTCTTCAACCACGTGCACTTTGGC  1683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGTCCGTCATCCTGGGCGTCGTGCACATGGCCTTTGGGGTGGTCCTCGGAGTCTTCAACCACGTGCACTTTGGC  1776

Query 1684  CAGAGGCACCGGCTGCTGCTGGAGACGCTGCCGGAGCTCACCTTCCTGCTGGGACTCTTCGGTTACCTCGTGTT  1757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CAGAGGCACCGGCTGCTGCTGGAGACGCTGCCGGAGCTCACCTTCCTGCTGGGACTCTTCGGTTACCTCGTGTT  1850

Query 1758  CCTAGTCATCTACAAGTGGCTGTGTGTCTGGGCTGCCAGGGCCGCCTCGGCCCCCAGCATCCTCATCCACTTCA  1831
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCTAGTCATCTACAAGTGGCTGTGTGTCTGGGCTGCCAGGGCCGCCTCGGCCCCCAGCATCCTCATCCACTTCA  1924

Query 1832  TCAACATGTTCCTCTTCTCCCACAGCCCCAGCAACAGGCTGCTCTACCCCCGGCAGGAGGTGGTC--CAGGCCA  1903
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| .|||..|  |||| .|
Sbjct 1925  TCAACATGTTCCTCTTCTCCCACAGCCCCAGCAACAGGCTGCTCTACCCCCGGCAGG-TGTGCACAGCAGG-GA  1996

Query 1904  CGCTGGTGGTCCTGGCCTTGGCCATGGTGCCCATCCTGCTGCTTGGCACACCCCTGCACCTGCTGCACCGCCAC  1977
            |||       ||                                                              
Sbjct 1997  CGC-------CC--------------------------------------------------------------  2001

Query 1978  CGCCGCCGCCTGCGGAGGAGGCCCGCTGACCGACAGGAGGAAAACAAGGCCGGGTTGCTGGACCTGCCTGACGC  2051
                                                                                      
Sbjct 2002  --------------------------------------------------------------------------  2001

Query 2052  ATCTGTGAATGGCTGGAGCTCCGATGAGGAAAAGGCAGGGGGCCTGGATGATGAAGAGGAGGCCGAGCTCGTCC  2125
                                                                                      
Sbjct 2002  --------------------------------------------------------------------------  2001

Query 2126  CCTCCGAGGTGCTCATGCACCAGGCCATCCACACCATCGAGTTCTGCCTGGGCTGCGTCTCCAACACCGCCTCC  2199
                                                                                      
Sbjct 2002  --------------------------------------------------------------------------  2001

Query 2200  TACCTGCGCCTGTGGGCCCTGAGCCTGGCCCACGCCCAGCTGTCCGAGGTTCTGTGGGCCATGGTGATGCGCAT  2273
                                                                                      
Sbjct 2002  --------------------------------------------------------------------------  2001

Query 2274  AGGCCTGGGCCTGGGCCGGGAGGTGGGCGTGGCGGCTGTGGTGCTGGTCCCCATCTTTGCCGCCTTTGCCGTGA  2347
                                                                                      
Sbjct 2002  --------------------------------------------------------------------------  2001

Query 2348  TGACCGTGGCTATCCTGCTGGTGATGGAGGGACTCTCAGCCTTCCTGCACGCCCTGCGGCTGCACTGGGTGGAA  2421
                                                                                      
Sbjct 2002  --------------------------------------------------------------------------  2001

Query 2422  TTCCAGAACAAGTTCTACTCAGGCACGGGCTACAAGCTGAGTCCCTTCACCTTCGCTGCCACAGATGAC  2490
                                                                                 
Sbjct 2002  ---------------------------------------------------------------------  2001