Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471995
• Subject: XM_011521742.3
• Aligned Length: 969
• Identities: 831
• Gaps: 138

Alignment

Query   1  ATGCAGCCCTCAGGCTGGGCGGCCGCCAGGGAGGCGGCGGGCCGCGACATGCTGGCCGCCGACCTCCGGTGCAG  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGCAGCCCTCAGGCTGGGCGGCCGCCAGGGAGGCGGCGGGCCGCGACATGCTGGCCGCCGACCTCCGGTGCAG  74

Query  75  CCTCTTCGCCTCGGCCCTGCAGAGCTACAAGCGCGACTCGGTGCTGCGGCCCTTCCCCGCGTCCTACGCCCGCG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CCTCTTCGCCTCGGCCCTGCAGAGCTACAAGCGCGACTCGGTGCTGCGGCCCTTCCCCGCGTCCTACGCCCGCG  148

Query 149  GCGACTGTAAGGACTTTGAAGCCCTGCTTGCAGATGCCAGCAAGTTACCTAACCTGAAAGAACTTCTCCAGTCC  222
           |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct 149  GCGACTGTAAGGACTTTGAAGCCCT-------------------------------------------------  173

Query 223  TCCGGAGACAACCACAAACGGGCCTGGGACCTGGTGAGCTGGATTTTATCCTCAAAGGTCCTGACAATCCACAG  296
                                                                                     
Sbjct 174  --------------------------------------------------------------------------  173

Query 297  TGCAGGGAAGGCAGAGTTTGAAAAGATCCAAAAGCTGACTGGGGCTCCTCACACGCCTGTTCCTGCACCGGACT  370
                          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 174  ---------------GTTTGAAAAGATCCAAAAGCTGACTGGGGCTCCTCACACGCCTGTTCCTGCACCGGACT  232

Query 371  TCCTGTTTGAAATTGAGTACTTTGACCCAGCCAACGCCAAATTTTATGAGACCAAAGGAGAACGAGACCTAATC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 233  TCCTGTTTGAAATTGAGTACTTTGACCCAGCCAACGCCAAATTTTATGAGACCAAAGGAGAACGAGACCTAATC  306

Query 445  TATGCATTTCATGGTAGCCGCCTAGAAAACTTCCATTCCATTATCCACAATGGCCTGCACTGCCATCTGAACAA  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 307  TATGCATTTCATGGTAGCCGCCTAGAAAACTTCCATTCCATTATCCACAATGGCCTGCACTGCCATCTGAACAA  380

Query 519  GACATCCTTGTTCGGAGAGGGGACCTACCTCACCAGTGACTTGAGCCTGGCCCTCATATACAGCCCCCATGGCC  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 381  GACATCCTTGTTCGGAGAGGGGACCTACCTCACCAGTGACTTGAGCCTGGCCCTCATATACAGCCCCCATGGCC  454

Query 593  ATGGGTGGCAGCACAGCCTCCTCGGCCCCATCCTTAGCTGTGTGGCCGTGTGTGAGGTCATTGACCATCCGGAC  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 455  ATGGGTGGCAGCACAGCCTCCTCGGCCCCATCCTTAGCTGTGTGGCCGTGTGTGAGGTCATTGACCATCCGGAC  528

Query 667  GTCAAGTGCCAAACCAAGAAGAAGGATTCCAAGGAGATAGATCGCAGACGAGCGAGAATCAAACATAGTGAAGG  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 529  GTCAAGTGCCAAACCAAGAAGAAGGATTCCAAGGAGATAGATCGCAGACGAGCGAGAATCAAACATAGTGAAGG  602

Query 741  GGGAGACATCCCTCCCAAGTACTTCGTGGTCACCAATAACCAGCTGCTGCGAGTGAAGTACCTCCTGGTGTATT  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 603  GGGAGACATCCCTCCCAAGTACTTCGTGGTCACCAATAACCAGCTGCTGCGAGTGAAGTACCTCCTGGTGTATT  676

Query 815  CACAGAAGCCACCCAAGAGCAGGGCTTCGAGCCAGCTCTCCTGGTTTTCCAGCCATTGGTTTACCGTCATGATA  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 677  CACAGAAGCCACCCAAGAGCAGGGCTTCGAGCCAGCTCTCCTGGTTTTCCAGCCATTGGTTTACCGTCATGATA  750

Query 889  TCCCTGTATCTGCTGCTGCTGCTCATAGTGAGTGTCATCAACTCCTCTGCTTTCCAACACTTTTGGAATCGTGC  962
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 751  TCCCTGTATCTGCTGCTGCTGCTCATAGTGAGTGTCATCAACTCCTCTGCTTTCCAACACTTTTGGAATCGTGC  824

Query 963  GAAAAGA  969
           |||||||
Sbjct 825  GAAAAGA  831