Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472094
• Subject: NM_018699.3
• Aligned Length: 1890
• Identities: 1796
• Gaps: 93

Alignment

Query    1  ATGCTGGGCATGTACGTGCCGGACAGGTTCTCCCTGAAGTCCTCCCGGGTTCAGGACGGCATGGGGCTCTACAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGGGCATGTACGTGCCGGACAGGTTCTCCCTGAAGTCCTCCCGGGTTCAGGACGGCATGGGGCTCTACAC  74

Query   75  GGCCCGCAGAGTGCGAAAGGGTGAAAAGTTCGGACCCTTTGCTGGAGAGAAGAGAATGCCTGAAGACTTGGATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCCCGCAGAGTGCGAAAGGGTGAAAAGTTCGGACCCTTTGCTGGAGAGAAGAGAATGCCTGAAGACTTGGATG  148

Query  149  AAAATATGGATTACAGGTTGATGTGGGAGGTTCGTGGGAGTAAGGGAGAAGTTTTGTACATTTTGGATGCTACC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAAATATGGATTACAGGTTGATGTGGGAGGTTCGTGGGAGTAAGGGAGAAGTTTTGTACATTTTGGATGCTACC  222

Query  223  AACCCACGGCACTCCAACTGGCTTCGCTTCGTTCATGAGGCACCATCTCAGGAGCAGAAGAACTTGGCTGCCAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACCCACGGCACTCCAACTGGCTTCGCTTCGTTCATGAGGCACCATCTCAGGAGCAGAAGAACTTGGCTGCCAT  296

Query  297  TCAAGAAGGAGAAAACATTTTCTATTTGGCAGTTGAAGATATAGAAACAGACACGGAGCTTCTGATTGGCTACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCAAGAAGGAGAAAACATTTTCTATTTGGCAGTTGAAGATATAGAAACAGACACGGAGCTTCTGATTGGCTACC  370

Query  371  TGGATAGTGACATGGAGGCTGAGGAGGAAGAACAGCAAATTATGACAGTCATCAAAGAAGGGGAAGTTGAAAAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGATAGTGACATGGAGGCTGAGGAGGAAGAACAGCAAATTATGACAGTCATCAAAGAAGGGGAAGTTGAAAAT  444

Query  445  TCTAGAAGACAATCAACAGCGGGCAGAAAAGATCGCCTTGGCTGTAAAGAGGACTATGCTTGTCCTCAATGTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCTAGAAGACAATCAACAGCGGGCAGAAAAGATCGCCTTGGCTGTAAAGAGGACTATGCTTGTCCTCAATGTGA  518

Query  519  ATCGAGTTTTACCAGTGAGGATATTCTTGCTGAGCATCTCCAGACATTGCACCAGAAACCCACAGAGGAGAAAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATCGAGTTTTACCAGTGAGGATATTCTTGCTGAGCATCTCCAGACATTGCACCAGAAACCCACAGAGGAGAAAG  592

Query  593  AATTTAAGTGCAAGAACTGTGGGAAGAAATTCCCAGTTAAGCAGGCTTTGCAAAGACA----------------  650
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct  593  AATTTAAGTGCAAGAACTGTGGGAAGAAATTCCCAGTTAAGCAGGCTTTGCAAAGACATGTTCTTCAGTGCACA  666

Query  651  --------------------------------------------------------------------------  650
                                                                                      
Sbjct  667  GCGAAAAGCAGTCTAAAGGAGTCTTCGCGAAGTTTTCAGTGCTCTGTTTGCAATTCTTCCTTCAGTTCAGCATC  740

Query  651  ---TTTTGAGCAGCACCAGGAGACTTGCCGGGGGGATGCCAGGTTTGTGTGCAAGGCTGACAGCTGTGGAAAGA  721
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAGTTTTGAGCAGCACCAGGAGACTTGCCGGGGGGATGCCAGGTTTGTGTGCAAGGCTGACAGCTGTGGAAAGA  814

Query  722  GGCTGAAGAGCAAGGATGCCCTGAAAAGACACCAGGAAAATGTCCACACTGGAGATCCTAAGAAAAAGCTTATA  795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGCTGAAGAGCAAGGATGCCCTGAAAAGACACCAGGAAAATGTCCACACTGGAGATCCTAAGAAAAAGCTTATA  888

Query  796  TGTTCAGTGTGCAATAAAAAGTGTTCTTCAGCATCAAGCCTACAGGAACATAGAAAGATTCATGAGATATTTGA  869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGTTCAGTGTGCAATAAAAAGTGTTCTTCAGCATCAAGCCTACAGGAACATAGAAAGATTCATGAGATATTTGA  962

Query  870  TTGTCAAGAATGTATGAAGAAATTTATTTCAGCTAATCAGCTAAAACGTCATATGATCACCCACTCAGAAAAAC  943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTGTCAAGAATGTATGAAGAAATTTATTTCAGCTAATCAGCTAAAACGTCATATGATCACCCACTCAGAAAAAC  1036

Query  944  GACCCTATAATTGCGAGATTTGTAATAAGTCTTTCAAGAGGCTTGATCAAGTGGGTGCTCACAAAGTAATACAC  1017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GACCCTATAATTGCGAGATTTGTAATAAGTCTTTCAAGAGGCTTGATCAAGTGGGTGCTCACAAAGTAATACAC  1110

Query 1018  AGCGAAGACAAACCTTACAAATGCAAACTTTGTGGAAAGGGATTTGCCCACAGAAATGTTTACAAGAATCATAA  1091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGCGAAGACAAACCTTACAAATGCAAACTTTGTGGAAAGGGATTTGCCCACAGAAATGTTTACAAGAATCATAA  1184

Query 1092  GAAGACCCACTCTGAGGAGAGACCGTTCCAATGTGAAGAATGTAAAGCTCTGTTCCGGACCCCATTTTCTTTAC  1165
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAAGACCCACTCTGAGGAGAGACCGTTCCAATGTGAAGAATGTAAAGCTTTGTTCCGGACCCCATTTTCTTTAC  1258

Query 1166  AGAGACACCTGCTAATACATAACAGTGAGAGGACTTTCAAGTGCCATCACTGCGATGCTACCTTTAAGAGGAAG  1239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGAGACACCTGCTAATACATAACAGTGAGAGGACTTTCAAGTGCCATCACTGCGATGCTACCTTTAAGAGGAAG  1332

Query 1240  GATACATTAAATGTTCATGTCCAGGTGGTTCATGAAAGACACAAGAAGTATAGGTGTGAGCTATGTAATAAGGC  1313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GATACATTAAATGTTCATGTCCAGGTGGTTCATGAAAGACACAAGAAGTATAGGTGTGAGCTATGTAATAAGGC  1406

Query 1314  CTTTGTTACACCTTCAGTGCTTAGAAGTCATAAGAAAACACATACAGGAGAAAAGGAGAAAATCTGTCCATATT  1387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTTTGTTACACCTTCAGTGCTTAGAAGTCATAAGAAAACACATACAGGAGAAAAGGAGAAAATCTGTCCATATT  1480

Query 1388  GTGGCCAGAAATTTGCCAGCAGTGGTACACTCAGAGTTCATATCCGGAGCCACACAGGTGAGCGTCCCTATCAA  1461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTGGCCAGAAATTTGCCAGCAGTGGTACACTCAGAGTTCATATCCGGAGCCACACAGGTGAGCGTCCCTATCAA  1554

Query 1462  TGTCCTTACTGTGAAAAAGGATTCAGTAAAAATGATGGACTGAAGATGCACATTCGTACTCACACCAGGGAGAA  1535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGTCCTTACTGTGAAAAAGGATTCAGTAAAAATGATGGACTGAAGATGCACATTCGTACTCACACCAGGGAGAA  1628

Query 1536  GCCGTACAAGTGCTCAGAGTGCAGCAAGGCCTTCAGCCAGAAGCGAGGCCTGGATGAGCACAAGAGGACGCACA  1609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCCGTACAAGTGCTCAGAGTGCAGCAAGGCCTTCAGCCAGAAGCGAGGCCTGGATGAGCACAAGAGGACGCACA  1702

Query 1610  CTGGAGAAAAGCCTTTTCAGTGTGATGTTTGTGATTTGGCTTTTAGCCTGAAGAAAATGCTGATTCGACACAAG  1683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTGGAGAAAAGCCTTTTCAGTGTGATGTTTGTGATTTGGCTTTTAGCCTGAAGAAAATGCTGATTCGACACAAG  1776

Query 1684  ATGACTCATAATCCCAATCGTCCCCTGGCAGAATGCCAGTTTTGCCATAAGAAGTTTACAAGGAATGACTACCT  1757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ATGACTCATAATCCCAATCGTCCCCTGGCAGAATGCCAGTTTTGCCATAAGAAGTTTACAAGGAATGACTACCT  1850

Query 1758  CAAAGTGCACATGGACAATATCCATGGTGTAGCTGACAGC  1797
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CAAAGTGCACATGGACAATATCCATGGTGTAGCTGACAGC  1890