Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472100
• Subject: NM_001129996.2
• Aligned Length: 1642
• Identities: 1266
• Gaps: 197

Alignment

Query    1  ATGACCACATTCA----------------------------AGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGG  46
            ||||.| .|||||                            ||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct    1  ATGATC-GATTCAGGAGAAAAGAAGCCTGGGCGGAGAGCAGAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGA  73

Query   47  TCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTGGAGAAC  120
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct   74  TCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTTGAGAAC  147

Query  121  TTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATCAACCGTTCCACCAAGATACTTGCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTT  194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||...||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  TTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATCAACCATTCCATGGAGATACTTTCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTT  221

Query  195  TTGGATGATGGGGACAGCAACCCAAAGAGAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTC  268
            ||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  222  TTGGGTGATGGGGACAACAAGCCAAAGAGAAGGGAATTTGGGAGGCAAGATCCAAACTGAGATGGAGACTGTTC  295

Query  269  CAGAAGCAGGAGCACATGAAGAGTGGTCCTGCCAGCAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCAGGTCT  342
            |||||||||||.||||||||||.|..||||||.|||||||.||||||||||||||||..|||||||||||||||
Sbjct  296  CAGAAGCAGGAACACATGAAGAATTTTCCTGCAAGCAAATTTGGGAACAAATTGCAAGTGACTTAACCAGGTCT  369

Query  343  CAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGTTCTTTGAAAATGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAAGCAGGACTACC  416
            ||.||..|.|.|||||.||||||||||||.||||||.|.|.|||...||||||||||.||.|||||.|||||.|
Sbjct  370  CAAGATACCACCATAAGTAACTCTCAGTTATTTGAACAAGATGACAACCCCTCCCAGATTAAAGCAAGACTATC  443

Query  417  CACAATTCATACAGGACAGAAACCTTCCCAGGGTGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTCCCATCTTTG  490
            .|||.||||.|||.||.|.|||||||.||||||||..||.||||||||||.|||||||||||||.||.||||||
Sbjct  444  TACAGTTCACACAAGAGAAAAACCTTTCCAGGGTGAAAATTGTAAACAGTTCTTCAGTGATGTTTCCTTCTTTG  517

Query  491  ATCTTCCTCAGCAGTTATACTCAGAAGAGAAGTCTTATACATGTGATGAGTGTGGAAAAAGCATCTGTTACATC  564
            |||||||||||||||||||.||||.||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  518  ATCTTCCTCAGCAGTTATATTCAGGAGAGAAGTCTCATACCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATC  591

Query  565  TCAGCTCTTCATGTTCATCAGAGAGTCCACGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTGTGATGTGTGTGGCAAGGAATT  638
            |||||.||||||.||||||||||.||||||.||||||.||||..||.||.|||||||||||||||.||||||||
Sbjct  592  TCAGCCCTTCATATTCATCAGAGGGTCCACATGGGAGTGAAATGCTATAAGTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATT  665

Query  639  TAGTCAAAGCTCACATCTGCAAACTCATCAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTG  712
            ||||||.|||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  666  TAGTCAGAGCTCACGTCTGCAAACTCATCAAAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTG  739

Query  713  GGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGCACTTAATGTTCATCATAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTACATTTGT  786
            |||||||.|||||..||||||||||||||||.||||||...||||||||||...|||||||||||||.|.||||
Sbjct  740  GGAAAGGCTTCAGATGTAGATCAGCACTTAAAGTTCATTGCAAATTACACATGAGAGAGAAACCTTATAATTGT  813

Query  787  GAGGCATGTGGGAAGGCCTTCATTCATGATTCCCAGCTTAAGGAACATAAGAGAATCCATACTGGGGAGAAACC  860
            |||..||||||||||||.|||||.||..|||.|||||||.||.|||||.|.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct  814  GAGAAATGTGGGAAGGCTTTCATGCACAATTTCCAGCTTCAGAAACATCACAGAATTCATACTGGGGAGAAGCC  887

Query  861  ATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGACCTTCTATTTTAGGTCAAGACTTAAGAGCCATTCCATGGTTCACACAG  934
            ||||||||||||.|||||||||||||.|||||.|.||||||||||                             
Sbjct  888  ATTCAAATGTGAAATATGTGGTAAGAGCTTCTGTCTTAGGTCAAG-----------------------------  932

Query  935  GAGAAAAACCATTTAGGTGTGATACATGTGATAAGAGCTTTCATCAGAGATCAGCACTTAATAGGCATTGCATG  1008
                                                                   .||||||||||||||||||
Sbjct  933  -------------------------------------------------------TCTTAATAGGCATTGCATG  951

Query 1009  GTCCACACAGGAGAGAAACCGTACAGATGTGAGCAGTGTGGAAAAGGCTTTATTGGTAGGCTAGATTTTTATAA  1082
            ||||||||||.||||||||.|||||.||.|||..|||.|||||.|||.||.||||.||||||||||||..||||
Sbjct  952  GTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAATCTGAAAAGTATGGAAGAGGTTTCATTGATAGGCTAGATTTGCATAA  1025

Query 1083  GCATCAGGTGGTCCACACAGGAGAGAAACCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCAT  1156
            |||||||.||.|.||.|..|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1026  GCATCAGATGATTCATATGGGACAGAAACCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAAATGGTCCTCAT  1099

Query 1157  GCCTTTTGAACCATCAGCGAGTCCACAGTGGAGAAAAAAGCTTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTAT  1230
            ..||||||..||||||.||||||||||.||||                                          
Sbjct 1100  ATCTTTTGGTCCATCAACGAGTCCACACTGGA------------------------------------------  1131

Query 1231  ACAAATTCACAACTGTCTTCCCATCAGAGATCCCACAGTGGTGAAAAGCCATATAAATGTGAGGAGTGTGGGAA  1304
                                                      |||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1132  ------------------------------------------GAAAAGCCATACAAATGTGAGGAGTGTGGGAA  1163

Query 1305  GGGCTATGTTACTAAGTTTAATCTTGACTTGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGG  1378
            ||||||..|||.|||||....|||||||||.|||||.||...||||||||||||||||.|||||||.|||.|..
Sbjct 1164  GGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTGACTTCCACCATAGAACCCACACGGGAGAGAGATCTTATAACTGTGATA  1237

Query 1379  AATGTGGGAAGAACTTTAGCCGGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCACTGCCAGAAAAAACCATTC  1452
            |.||.|||||||.||||||.|..||.||.|||||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||.|||||.
Sbjct 1238  ACTGCGGGAAGAGCTTTAGACATGCTTCTAGTATTTTGAATCATAAGAAACTCCACTGCCAAAGAAAGCCATTG  1311

Query 1453  AAATGTGAGGACTGTGGAAAGAGGCTTGTACACAGGACATACCGTAAAGACCAGCCGAGAGACTATAGTGGGGA  1526
            ||||||||.|||||||||||||||||||||..|.||.|||||.||||||||||.|..||||||.|.|||||.||
Sbjct 1312  AAATGTGAAGACTGTGGAAAGAGGCTTGTATGCCGGTCATACTGTAAAGACCAACAAAGAGACCACAGTGGAGA  1385

Query 1527  AAACCCATCCAAATGTGAGGATTGTGGGAGACGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATACTTTTATCATTAT  1600
            |||||||||||||||||||||.|||||||..||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1386  AAACCCATCCAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATAATTTTATCATTAT  1459

Query 1601  TTCTAAATGACACA  1614
            ||.|||||||||.|
Sbjct 1460  TTTTAAATGACATA  1473