Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472100
• Subject: NM_001260488.1
• Aligned Length: 1647
• Identities: 1610
• Gaps: 33

Alignment

Query    1  ATGACCA-------CA----------------TTCA----------AGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGC  41
            ||||..|       ||                ||||          ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATAAAGAGAAGCAAAGTACTTGTATTCTGTTCAAAGATTATGGAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGC  74

Query   42  TGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTGG  115
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTGG  148

Query  116  AGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATCAACCGTTCCACCAAGATACTTGCCACTTCCTAAGGGAAGAA  189
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATCAACCGTTCCACCAAGATACTTGCCACTTCCTAAGGGAAGAA  222

Query  190  AAGTTTTGGATGATGGGGACAGCAACCCAAAGAGAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTC  263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGTTTTGGATGATGGGGACAGCAACCCAAAGAGAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTC  296

Query  264  TGTTCCAGAAGCAGGAGCACATGAAGAGTGGTCCTGCCAGCAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCA  337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTTCCAGAAGCAGGAGCACATGAAGAGTGGTCCTGCCAGCAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCA  370

Query  338  GGTCTCAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGTTCTTTGAAAATGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAAGCAGGA  411
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGTCTCAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGTTCTTTGAAAATGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAAGCAGGA  444

Query  412  CTACCCACAATTCATACAGGACAGAAACCTTCCCAGGGTGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTCCCAT  485
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTACCCACAATTCATACAGGACAGAAACCTTCCCAGGGTGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTCCCAT  518

Query  486  CTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATACTCAGAAGAGAAGTCTTATACATGTGATGAGTGTGGAAAAAGCATCTGTT  559
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATACTCAGAAGAGAAGTCTTATACATGTGATGAGTGTGGAAAAAGCATCTGTT  592

Query  560  ACATCTCAGCTCTTCATGTTCATCAGAGAGTCCACGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTGTGATGTGTGTGGCAAG  633
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACATCTCAGCTCTTCATGTTCATCAGAGAGTCCACGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTGTGATGTGTGTGGCAAG  666

Query  634  GAATTTAGTCAAAGCTCACATCTGCAAACTCATCAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCA  707
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAATTTAGTCAAAGCTCACATCTGCAAACTCATCAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCA  740

Query  708  ATGTGGGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGCACTTAATGTTCATCATAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTACA  781
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATGTGGGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGCACTTAATGTTCATCGTAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTACA  814

Query  782  TTTGTGAGGCATGTGGGAAGGCCTTCATTCATGATTCCCAGCTTAAGGAACATAAGAGAATCCATACTGGGGAG  855
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTTGTGAGGCATGTGGGAAGGCCTTCATTCATGATTCCCAGCTTAAGGAACATAAGAGAATCCATACTGGGGAG  888

Query  856  AAACCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGACCTTCTATTTTAGGTCAAGACTTAAGAGCCATTCCATGGTTCA  929
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAACCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGACCTTCTATTTTAGGTCAAGACTTAAGAGCCATTCCATGGTTCA  962

Query  930  CACAGGAGAAAAACCATTTAGGTGTGATACATGTGATAAGAGCTTTCATCAGAGATCAGCACTTAATAGGCATT  1003
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CACAGGAGAAAAACCATTTAGGTGTGATACATGTGATAAGAGCTTTCATCAGAGATCAGCACTTAATAGGCATT  1036

Query 1004  GCATGGTCCACACAGGAGAGAAACCGTACAGATGTGAGCAGTGTGGAAAAGGCTTTATTGGTAGGCTAGATTTT  1077
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCATGGTCCACACAGGAGAGAAACCGTACAGATGTGAGCAGTGTGGAAAAGGCTTTATTGGTAGGCTAGATTTT  1110

Query 1078  TATAAGCATCAGGTGGTCCACACAGGAGAGAAACCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTC  1151
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TATAAGCATCAGGTGGTCCACACAGGAGAGAAACCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTC  1184

Query 1152  CTCATGCCTTTTGAACCATCAGCGAGTCCACAGTGGAGAAAAAAGCTTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGAT  1225
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1185  CTCATGCCTTTTGAACCATCAGCGAGTCCACAGTGGAGAAAAAAGCTTCAAATGTGAAGAATGTGGAAAGGGAT  1258

Query 1226  TTTATACAAATTCACAACTGTCTTCCCATCAGAGATCCCACAGTGGTGAAAAGCCATATAAATGTGAGGAGTGT  1299
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTTATACAAATTCACAACTGTCTTCCCATCAGAGATCCCACAGTGGTGAAAAGCCATATAAATGTGAGGAGTGT  1332

Query 1300  GGGAAGGGCTATGTTACTAAGTTTAATCTTGACTTGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTTATAATTG  1373
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GGGAAGGGCTATGTTACTAAGTTTAATCTTGACTTGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTTATAATTG  1406

Query 1374  TAAGGAATGTGGGAAGAACTTTAGCCGGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCACTGCCAGAAAAAAC  1447
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TAAGGAATGTGGGAAGAACTTTAGCCGGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCACTGCCAGAAAAAAC  1480

Query 1448  CATTCAAATGTGAGGACTGTGGAAAGAGGCTTGTACACAGGACATACCGTAAAGACCAGCCGAGAGACTATAGT  1521
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CATTCAAATGTGAGGACTGTGGAAAGAGGCTTGTACACAGGACATACCGTAAAGACCAGCCGAGAGACTATAGT  1554

Query 1522  GGGGAAAACCCATCCAAATGTGAGGATTGTGGGAGACGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATACTTTTATC  1595
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGGGAAAACCCATCCAAATGTGAGGATTGTGGGAGACGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATACTTTTATC  1628

Query 1596  ATTATTTCTAAATGACACA  1614
            |||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ATTATTTCTAAATGACACA  1647